广州市科技计划项目(2006J1-C0211)
- 作品数：9 被引量：36H指数：4
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- 结核病血清蛋白质组学研究对象的选择被引量：1
- 2007年
- 目的对可能影响结核病蛋白质组学研究的因素进行理论探索,为合理选择研究对象提供理论依据,为最终获得理想研究结果提供实践基础。方法以“结核”、“血清蛋白”、“蛋白质组学”等为检索词在PubMed及CNKI（中国学术期刊网专题数据库1994-2004）中国医院数字图书馆数据库中检索相关文献,结合我们的结核病工作实践,对可能存在的影响因素进行分析与推断。结果结核病血清蛋白质组学研究的对象选择需要考虑以下几个因素：（1）在方法学上,结核病血清蛋白质组学研究多采用比较蛋白质组学研究方法,病例选择需考虑与健康对照组间多种相关因素的匹配;（2）根据研究目的,结核病血清蛋白质组学研究的基本目标为寻找结核病相关蛋白,纳入病例应包括不同病理类型与不同病灶部位的结核病患者;（3）结核病患者可伴有其它病原菌感染,可致患者的血清蛋白质组产生变化,在病例选择时应尽量避免选择合并感染病例;（4）鉴于结核病的复杂性,需考虑潜伏感染者及陈旧性结核患者对结核病血清蛋白质组研究可能产生的影响。结论对结核病血清蛋白质组学研究而言,研究对象选择方案是否科学从本质上影响到研究结果。加上蛋白质组学研究费用昂贵,更加需要在实验研究前审慎考虑研究对象的选择问题。
- 罗强生刘玉美刘志辉
- 关键词：结核血清蛋白蛋白质组学
- 结核性胸膜炎患者血清与胸腔积液蛋白质组的初步分析被引量：15
- 2010年
- 目的:比较分析结核性胸膜炎患者血清与胸腔积液蛋白质组的异同,为探讨结核性胸膜炎的发生机制和寻找诊断标志物提供实验依据。方法:采用弱阳离子交换蛋白质芯片(WCX2)处理分析样本、应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,以蛋白质/多肽质荷比(m/z)区分不同的蛋白质/多肽,对5例结核性胸膜炎患者血清与胸腔积液蛋白质组进行描述性分析。结果:(1)在5例患者血清中检测到134种血清蛋白质/多肽,其中76种在胸腔积液中未出现;在5例患者胸腔积液中检测到269种蛋白质/多肽,其中211种在血液中未出现。(2)在5例患者血液中均检测到m/z分别为2660、3191、4208、5903、7764、9287等6种蛋白质/多肽;在5例患者胸腔积液中均检测到m/z分别为2416、2660、2900、2940等4种蛋白质/多肽;在5例患者血液和胸腔积液中均检测到m/z为2660的蛋白质/多肽。结论:结核性胸膜炎患者胸腔积液蛋白质组远比其血清蛋白质组复杂,对其进行深入研究有助于明晰结核性胸膜炎的发生机制和寻找诊断标志物。
- 彭德虎胡锦兴石琳林兆原冯治宇刘志辉
- 关键词：蛋白质组表面增强激光解析电离飞行时间质谱
- 不同结核病患者群血清蛋白质谱分析与比较被引量：2
- 2012年
- 目的:比较分析菌阳肺结核与菌阴肺结核、肺结核与肺外结核患者的血清蛋白质谱,从蛋白质组学层面了解不同结核病患者群血清蛋白质谱的特征,为结核病诊断标志物的筛选提供指导。方法:应用表面增强激光解吸-电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)蛋白质芯片系统,采用弱阳离子交换蛋白质芯片(WCX)对54例菌阳肺结核、45例菌阴肺结核、18例肺外结核患者的血清蛋白质进行检测;应用ClinProTools分析软件依据各蛋白质的质谱峰面积计算相对强度表示该血清蛋白质的丰度,采用t检验(对Anderson-Darling检验P>0.05的正态分布者)或Wilcoxon检验(对Anderson-Darling检验P<0.05的非正态分布者)分析比较菌阳肺结核与菌阴肺结核、肺结核与肺外结核患者各血清蛋白质的平均丰度。结果:(1)在3种不同结核病患者人群中均捕获到102种相对分子质量在1011.41～9435.07的不同血清蛋白质,经Anderson-Darling检验,在菌阳肺结核、菌阴肺结核、肺外结核患者人群中分别有31、23和29种血清蛋白质呈正态分布。(2)正态分布的血清蛋白质在不同结核病患者人群间其水平未见显著差异。(3)非正态分布的血清蛋白质:在菌阳肺结核与菌阴肺结核患者人群间其水平未见显著差异;在肺结核与肺外结核患者人群间发现1个差异血清蛋白质(P=0.0251),其相对分子质量为5753.76,在肺结核与肺外结核患者人群血清中的平均丰度分别为15.42±4.86和28.29±14.08。结论:不同结核病患者群的血清蛋白质谱具有同质性,为普遍适用性结核病血清学诊断标志物的筛选提供了科学依据。
- 黄业伦刘玉美谭守勇刘健雄李昕洁罗强生曹翌明刘志辉
- 关键词：结核血清蛋白质
- 结核病患者血清蛋白质组学研究实践的启示被引量：1
- 2012年
- H37Rv全基因组序列图，标志着结核病研究进入后基因组时代。以双向电泳、生物质谱和生物信息学为核心技术的蛋白质组学开启了后基因组时代研究之门。蛋白质作为生物生命活动的直接体现者，必将体现于结核病发生、发展的各个环节和方面，为探讨结核病血清学诊断新型标志物，笔者进行了结核病血清蛋白质组学的相关研究。在研究过程中，笔者获益匪浅．现总结报告如下。
- 刘玉美李笑颜罗强生刘志辉
- 关键词：血清蛋白质组学结核病患者后基因组时代全基因组序列H37RV血清学诊断
- 肺结核患者强化治疗前后血清差异蛋白质质谱分析被引量：4
- 2010年
- 目的研究肺结核患者强化治疗前后血清蛋白质谱的变化。方法利用弱阳离子(WCX)液体蛋白质芯片和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术,对16例肺结核患者强化治疗前后的血清蛋白质谱进行比较分析。结果强化治疗前后有22种蛋白质的相对含量有明显差异,11种蛋白质在强化治疗后相对含量明显升高(P<0.05),另外11种蛋白质在强化治疗后相对含量明显降低(P<0.05)。结论肺结核患者强化治疗前后血清蛋白质谱存在明显差异。
- 尹小毛刘志辉刘玉美罗强生谭守勇刘健雄
- 关键词：肺结核蛋白质组学
- 结核病患者与健康人血清蛋白质谱的比较研究被引量：3
- 2012年
- 目的 比较结核病患者与健康人血清蛋白质谱,寻找结核病相关特异血清蛋白质,以期发现新型结核病血清学诊断标志物.方法 应用弱阳离子交换蛋白质芯片(WCX)和表面增强激光解吸-电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对包括54例菌阳肺结核(菌阳组)、45例菌阴肺结核(菌阴组)、18例肺外结核(肺外组)共117例结核病患者(结核组)及62例健康对照者(对照组)进行了血清蛋白质谱检测,并应用ClinProTools分析软件进行分析,找出差异蛋白质.结果 菌阳组-对照组、菌阴组-对照组、肺外组-对照组和结核组-对照组间分别存在19、14、26和30个差异血清蛋白质,其中分别有11、9、15和15个蛋白质在患者血清中表达上调；相对分子质量分别为1060、1944、2081和3954的4个血清蛋白质为各患者组与对照组间共同存在的差异血清蛋白质,其中相对分子质量为1060的蛋白质在患者血清中表达下调.结论 结核病患者与健康人之间血清蛋白质谱存在差异,有望通过血清蛋白质谱的比较分析,寻找到结核病相关特异血清蛋白质而发现新型结核病血清学诊断标志物.但尚需大样本量、多对照系的进一步研究予以确证.
- 刘志辉谭守勇刘玉美罗强生云径平李昕洁刘健雄
- 关键词：血蛋白质类蛋白质阵列分析
- 结核病患者与健康人血清蛋白质谱的比较研究
- 目的比较结核病患者与健康人血清蛋白质谱,寻找结核病相关特异血清蛋白质,以期发现新型结核病血清学诊断标志物。方法应用WCX蛋白质芯片和表面增强激光解吸-电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术对包括54例菌阳肺结核...
- 刘志辉谭守勇刘玉美罗强生云径平刘健雄李昕洁
- 关键词：结核血清蛋白质蛋白质组学
- 文献传递
- 结核病患者和正常人血清蛋白质双向凝胶电泳差异比较被引量：7
- 2008年
- 目的初步探讨结核病患者与正常人之间血清蛋白质的差异,以期筛选出新的结核病实验诊断标志物。方法对10例菌阳肺结核(阳性组)、10例菌阴肺结核(阴性组)、10例肺外结核(肺外组)及10例正常人(正常组)分组混合血清应用17cmpH4～7IPG胶条进行双向凝胶电泳(two-dimensional electrophoresis,2-DE),每组平行电泳3块胶条。电泳结束后对2-DE胶条进行考马斯亮蓝染色,染色后用Umax powerlook2000扫描仪以投射方式、300dpi分辨率扫描获取2-DE图谱,然后用2-DE分析软件Image Master2D Platium5.0进行分析。结果在正常组、阳性组、阴性组、肺外组中,分别平均可以检测到310±64、307±33、296±54、267±23个清晰可见的蛋白质点。正常组与阳性组、阴性组、肺外组的匹配率分别为(74±2)%、(76±2)%和(68±5)%。通过对4组2-DE图谱比较,阳性组与正常组间有21个差异蛋白质点(其中9个上调),阴性组与正常组间有18个差异蛋白质点(其中8个上调),肺外组与正常组间有24个差异蛋白质点(其中7个上调)。将阳性组、阴性组、肺外组合并为结核组与正常组比较有3个差异蛋白质点(其中2个上调)。结论结核病患者和正常人血清蛋白质存在差异,有望从血清中筛选出新的结核病实验诊断标志物。本研究建立了两者间血清蛋白质组差异蛋白质的初步模型,但有待进一步验证并进行差异蛋白质鉴定。
- 刘志辉刘玉美云径平罗强生尹小毛谭守勇刘健雄李昕洁
- 关键词：结核双向凝胶电泳蛋白质组血清蛋白质组学
- 结核病患者血清蛋白质/多肽谱的初步研究被引量：1
- 2010年
- 目的了解结核病患者血清蛋白质/多肽的表达,为新型结核病血清学诊断方法的研究提供基础依据。方法 (1)应用WCX蛋白质芯片和表面增强激光解析-电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对99例肺结核患者和18例肺外结核患者进行了血清蛋白质/多肽谱检测,采用ClinProTools分析软件进行比较分析。(2)以"结核"、"双向电泳"、"表面增强激光解析-电离飞行时间质谱"、"血清学"、"蛋白质组学"及相应英文为检索词在万方医学数据库、PUBMED中检索中、外文献进行文献复习。结果 WCX蛋白质芯片从血清中捕获到99种蛋白质/多肽,其中m/z为5 753.76的蛋白质在肺结核与肺外结核两组间差异有显著性,在肺外结核患者血清中表达上调,其平均质谱峰面积在肺结核患者和肺外结核患者中分别为15.42±4.86、28.29±14.08。结论结核病的发生可产生大致相同的血清蛋白质/多肽谱,在不同类型结核结核病患者血清中可以找到共同的血清学诊断标志物。
- 李昕洁谭守勇刘玉美刘志辉
- 关键词：结核血清蛋白质蛋白质组学
- MPB64分泌蛋白检测鉴定结核分枝杆菌复合群的应用研究被引量：8
- 2010年
- 目的对应用MPB64分泌蛋白检测鉴定结核分枝杆菌复合群进行方法学评价。方法对临床分离菌株。取BacT／ALERT3D系统的液体培养液或改良罗氏固体培养基分离培养菌落室温静置约2h、浊度为1麦氏单位的生理盐水菌悬液0．1ml为检测样本，应用胶体金标记抗MPB64单克隆抗体采用免疫层析色谱法进行MPB64分泌蛋白检测，而后与菌种鉴定结果相比较。对参考菌株，则同时采用两种样本进行检测。结果对23株分枝杆菌参考菌株、267株临床分离菌株进行了检测。①对于参考菌株的两种样本，MPB64检测结果均为：结核分枝杆菌、牛分枝杆菌、田鼠分枝杆菌菌株阳性，其他20株非结核分枝杆菌为阴性。分群鉴定准确度为100％。②在111株BacT／AI。ERT3D系统分离培养临床株中，55株为结核分枝杆菌，其中51株MPB64检测阳性；56株为非结核分枝杆菌，其中54株MPB64检测阴性。分群鉴定准确度为94．59％。③在156株改良罗氏培养基分离培养临床菌株中，121株为结核分枝杆菌，其中115株MPB64检测阳性；35株为非结核分枝杆菌，MPB64检测全部阴性。分群鉴定准确度为96．15％。④对于所有研究样本，应用MPB64分泌蛋白检测鉴定结核分枝杆菌复合群的敏感度、特异度与准确度分别为94．41％、98．20％和95．86％。结论应用MPB64分泌蛋白检测鉴定结核分枝杆菌复合群是一种准确、快速、简便而又不需要任何仪器设备的实用型方法，值得临床推广应用。
- 刘志辉蔡杏姗刘玉美何霞罗春明樊晖
- 关键词：MPB64分泌蛋白结核分枝杆菌复合群细菌分型技术
