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山东省自然科学基金(Q2006D06)
作品数:
2
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相关作者:
王可
黄庆华
韩虹
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姜宁朋
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作者
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黄庆华
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王可
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孙健全
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韩虹
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2010
1篇
2009
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猪传染性胃肠炎病毒N蛋白的二级结构和B细胞抗原表位的预*测
2009年
以TGEV基因组序列为基础,运用Garnier—Robson、Chou—fasman和Karplus—Schulz方法预测猪传染性胃肠炎病毒N蛋白的二级结构。运用Kyte—Doolitte方法对N蛋白的疏水性进行了分析,Jameson-Wolf方法预测了结构蛋白的抗原指数,Emini方法预测了N蛋白的表面可能性,最后结合吴玉章的方法综合分析预测B细胞抗原表住。结果显示柔性区域主要集中在N-端第11~31、52~65、128~147、155~188、210~227、313~319、331~347区段,α-螺旋和β-折叠数量少且分散。N蛋白可能的B细胞抗原位点是N-端12~31,154~191,204~243,309~320,329~354区段,而这些区段内部或附近都有柔性区域存在,可作为N蛋白的抗原优势表位。本研究为TGEV抗原优势表位的试验研究和反向疫苗的研制奠定了基础。
姜宁朋
孙健全
黄庆华
王可
关键词:
猪传染性胃肠炎病毒
B细胞抗原表位
猪传染性胃肠炎病毒S蛋白的二级结构和B细胞抗原表位的预测
2010年
以TGEV(猪传染性胃肠炎病毒)基因组序列为基础,运用Garnier-Robson、Chou-Fasman和Karplus-Schulz方法预测其S蛋白的二级结构,运用Kyte-Doolittle方法对S蛋白的亲水性进行分析,并分别运用Jameson-Wolf方法和Emini方法预测了其抗原指数和表面可及`性,最后结合吴玉章的方法综合分析预测了其B细胞抗原表位。结果显示,α螺旋数量少且分散,β折叠占据面积较大,柔性区域主要集中在N端第22~30、45~76、100~172、239~301、348~419、451~519、541~633、645~720、746~796、822~887、921~986、1052~1201、1239~1384、1434~1445区段。S蛋白可能的B细胞抗原位点是N端第20~32、44~54、69~78、97~106、635~655、781~803、949~994、1307~1328、1346~1362、1432~1448区段,这些区段内部或附近都有柔性区域存在,可作为S蛋白的抗原优势表位。
高传庆
王可
黄庆华
韩虹
关键词:
猪传染性胃肠炎病毒
S蛋白
B细胞抗原表位
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