山东省自然科学基金(2009ZRA14028)
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
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- 相关机构：德州学院山东师范大学更多>>
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- DSS1对蛋白质PCID2构象稳定性影响的分子动力学研究
- 2014年
- PCID2和DSS1是TREX2复合体中的成分,DSS1作为子复合体之间的粘合剂在复合体中主要与PCID2结合.研究发现,DSS1在复合体中起稳定PCID2的作用.利用分子动力学模拟研究无序蛋白DSS1与PCID2的相互作用,结果表明:未结合DSS1的单体PCID2蛋白构象不稳定,与DSS1结合后的PCID2蛋白构象明显变得更稳定,特别是与DSS1结合处的构象,与实验得出的结论一致.研究DSS1对PCID2的作用,不仅可以为了解PCI蛋白提供分子基础,也为深入了解TREX复合体在核酸输出中的功能提供帮助.
- 刘倩君扈国栋王吉华
- 关键词：分子动力学模拟构象变化
- 基于分子动力学模拟研究温度致Aβ42蛋白构象变化被引量：3
- 2013年
- 基于分子动力学模拟方法研究了不同温度对Aβ42蛋白结构的影响。模拟选用GROMACS软件包和GROMOS 43A1分子力场,在300 K、340 K和380 K下分别进行60 ns的分子动力学模拟。通过计算原子均方根涨落、回旋半径、二级结构形成几率等参数,分析了Aβ42蛋白结构的稳定性、二级结构及三级结构形成。研究发现:该蛋白在三种不同温度下,都没有稳定结构,表现出固有无序特征,温度会导致结构特征发生显著变化;在高温(380 K)时,会产生α螺旋向β折叠转换的趋势。
- 付静赵立岭王吉华
- 关键词：分子动力学模拟阿尔兹海默症构象转变
