国家自然科学基金(81360366) 作品数:25 被引量:48 H指数:5 相关作者: 丁杰 夏宇 吴明 张忠民 董奇 更多>> 相关机构: 贵州省人民医院 遵义医科大学 贵州大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 贵州省科技计划项目 贵州省社会发展科技攻关计划项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
LSD1与肿瘤转移的研究进展 被引量:1 2016年 表观遗传是一种不基于DNA序列差异的核酸遗传,其能对基因产生可逆化修饰而激活或阻断基因的转录与翻译,在肿瘤的发生、增殖、侵袭转移甚至耐药的过程中发挥重要作用。表观遗传学的发展改变了人们对基因组的认识,不仅基因的结构包含遗传信息,其修饰也可记载遗传信息。目前已知的表观遗传修饰主要包括:DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA(Micro RNA)及核小体重塑等。 董奇 丁杰关键词:肿瘤转移 表观遗传 甲基化酶 雄激素受体 乳腺癌细胞 组蛋白修饰 基于转录组测序分析唾液酸结合免疫球蛋白样凝集素-15在胃癌细胞中的作用机制 2023年 目的筛选并分析唾液酸结合Ig样凝集素15(Siglec-15)在胃癌细胞中的候选靶基因及其下游信号通路并进行患者预后相关性分析。方法构建干扰Siglec-15基因的最佳慢病毒转染至人胃腺癌AGS细胞株获得沉默组(AGS-shSiglec-15),以及空载体慢病毒转染获得的AGS细胞对照组(AGS-NC),各取三个样本进行转录组测序。根据测序数据筛选差异表达基因,通过GO分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析和GESA分析进行基因的功能注释和信号通路的鉴定。构建蛋白与蛋白相互作用网络图(PPI),进行可视化分析并获取关键互作蛋白,并对靶蛋白进行生存期分析。结果共鉴定出符合筛选标准的255个差异表达蛋白编码基因,包括119个上调基因和136个下调基因。经GO、KEGG和GSEA分析表明,差异表达基因(DEGs)主要参与甲型流感、Toll样受体信号传导途径、钙信号传导途径、NOD样受体信号传导途径、病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体的相互作用等进程。同时筛选出10个Siglec-15相关基因的靶蛋白,其中钙黏蛋白23(CDH23)[HR=1.31(1.05~1.63),P<0.05]、蛋白网络成分协调蛋白(USH1C)[HR=1.25(1.05~1.48),P<0.05]、干扰素调节因子7(IRF7)[HR=1.7(1.41~2.05),P<0.001]、MX2[HR=1.63(1.33~2.00),P<0.01]、干扰素调节因子9(IRF9)[HR=1.30(1.09~1.54),P<0.01]高表达的胃癌患者总生存率(OS)较差。而RSAD2(RSAD2)[HR=0.78(0.61~1.00),P<0.05]、CC基序趋化因子配体5(CCL5)[HR=0.66(0.55~0.78),P<0.01]、CXC趋化因子配体(CXCL8)[HR=0.65(0.53~0.79),P<0.01]、XIAP相关因子1(XAF1)[HR=0.77(0.65~0.92),P<0.01]、干扰素调节因子6(IRF6)[HR=0.51(0.41~0.63),P<0.01]高表达的患者具有较好的OS。结论沉默Siglec-15基因在胃癌细胞中有明显差异表达基因并参与多种生物学进程和信号通路调节,可能作为胃癌的潜在新免疫检查点标志物及治疗靶点。 张媛玲 陈俊豪 黄锐 谢雪晴 卢伟 田菁菁 尹清玲 丁杰关键词:胃癌 转录组测序 靶向PD-1/PD-L1的结直肠癌免疫治疗研究进展 被引量:2 2020年 传统的外科手术方式、治疗理念在不断改进,但对于改善结直肠癌患者的预后鲜有重大的突破。近年来,靶向程序性细胞凋亡蛋白-1(programmed death-1 receptor,PD-1)/程序性细胞凋亡蛋白配体-1(programmed cell death protein ligand-1,PD-L1)在部分晚期结直肠癌患者的治疗中效果显著,其抑制剂Pembrolizumab和Nivolumab被美国食品药品管理局(US Food and Drug Administration,FDA)批准用于转移性高度微卫星不稳定型或错配修复缺陷型(dMMR/MSI-H)实体瘤的末线治疗。文章综述了近年来靶向PD-1/PD-L1的结直肠癌免疫治疗研究进展。 刘航 丁杰 丁杰 吴明 张林 曾家兴关键词:结直肠癌 免疫治疗 组蛋白去乙酰化酶抑制剂及其衍生的多靶点抑制剂在胃肠道肿瘤中的研究进展 被引量:5 2020年 胃癌的新发病例排在恶性肿瘤的第5位,而结直肠癌是世界第三大常见的恶性肿瘤和第四大癌症死亡原因。组蛋白乙酰化的动态平衡由组蛋白乙酰转移酶(HAT)和组蛋白去乙酰化酶(HDAC)两个酶家族共同维持。HDAC能将赖氨酸上的乙酰基去除,从而抑制基因转录,但HDAC异常高表达可诱导正常细胞发生癌变,并参与其发展、增殖、侵袭和转移。靶向抑制HDAC已被证实具有抗肿瘤的效应,组蛋白去乙酰化酶抑制剂(HDACi)能抑制HDAC的表达及活性,并通过影响细胞活性氧水平、阻滞细胞周期、促进损伤DNA修复、抗血管新生、影响细胞信号通路、诱导自噬凋亡及增加细胞对放化疗药物的敏感性发挥强效的抗瘤作用,在胃癌及结直肠癌中HDAC则表达增高,HDACi在胃肠道肿瘤的研究中也呈现出良好的成效,由于I、II和IV类HDAC的催化核心发挥功能均依赖于Zn^2+,故多数HDACi均含有Zn^2+鳌合基团,异羟肟酸类抑制剂中的SAHA、TSA小剂量单独给药时已具有良好的抗肿瘤的成效,但后期临床研究发现,SAHA由于活性低,在治疗胃癌及结直肠癌的临床试验疗效并不佳,TSA的活性有所提高,但对HDAC选择性仍低,苯甲酰胺类HDACi在选择性上得以改善,但也无法只针对于特定亚型的HDAC,后期的环肽类及新报道的HDACi在HDAC的选择性上逐渐增加,但也仅限在动物及细胞实验阶段,并且上述的HDACi除与Zn^2+结合之外还能与其他金属酶结合,从而缺乏绝对的特异性,故大多数的HDACi在很小的剂量下就已引发了副作用,由于肿瘤的发生、发展涉及多环节、多因素,单一靶标常常不能有效杀灭癌细胞,并易产生耐药性,联合多靶标比单一靶标具有更强的抑癌效用,甚至能减轻药物耐药性的产生,但有时联合用药时会因药物间相互影响而带来不良反应,为了避免药物间相互影响,研究者基于药效基团拼接理念,将HDACi活性基团与其他不同� 李显 丁杰 丁杰 夏宇 吴明 吴明 樊斐 曾家兴 糜睿关键词:胃肠肿瘤 组蛋白类 组蛋白脱乙酰基酶类 酶抑制剂 环状RNAs在结直肠癌中研究进展 2018年 结直肠癌是常见的恶性肿瘤,在我国肿瘤中仅次于肺癌、胃癌、肝癌,名列第四位[1,2];其致死率高,我国每年约有20万人死于结肠癌[2]。目前,消化道肿瘤的诊断主要以内镜检查联合病理诊断为主。因其侵入性,且受内镜医师判断能力、患者配合程度等多因素影响,因此寻找确切的肿瘤标志物以提高结肠癌早期诊断率具有重要的临床意义。近年来研究发现,环状(circ)RNAs是信使(m)RNA剪接过程中的产物,大量分布于原核和真核细胞生物中,因其分布广泛、结构稳定保守、形式多样的特性而丰富了RNA家族的内容. 刘振华 丁杰关键词:结直肠癌 TGF-β/Smads信号通路对胃肠间质瘤细胞增殖和侵袭能力的影响 被引量:1 2018年 目的:探讨转化生长因子β(transforming growth factor-β,TGF-β)/Smads信号通路对胃肠间质瘤(gastrointestinal stromal tumor,GIST)细胞增殖、侵袭能力的影响及可能的作用机制。方法:分别采用外源性TGF-β1单独或联合不同浓度的SB-431542处理GIST882细胞,激活和阻断GIST882细胞的TGF-β/Smads信号转导通路;采用MTT法检测激活和阻断TGF-β/Smads信号通路对GIST882细胞增殖能力的影响,Transwell小室侵袭实验检测对GIST882细胞侵袭能力的影响;实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法检测激活和阻断TGF-β/Smads信号通路后对GIST882细胞中Slug mRNA和蛋白表达的影响。采用siRNA干扰的方法沉默Smad3基因的表达,并采用实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法检测Smad3基因的沉默效率,及对GIST882细胞中Slug mRNA及蛋白表达的影响。结果:TGF-β1激活TGF-β/Smads信号通路后,GIST882细胞的增殖活性和侵袭能力均明显增高(P值均<0.05),而SB-431542阻断TGF-β/Smads信号通路后GIST882细胞的增殖活性和侵袭能力均较TGF-β1单药组明显下降(P值均<0.05)。激活TGF-β/Smads信号通路后,GIST882细胞中转录因子Slug mRNA和蛋白的表达水平明显上调(P值均<0.01);而采用SB-431542阻断该信号通路后Slug mRNA和蛋白的表达水平均较TGF-β1单药组明显下调(P值均<0.05),且呈浓度依赖性。Smad3-siRNA2能有效沉默GIST882细胞中Smad3基因的表达,Slug mRNA和蛋白水平也明显下调(P<0.05和P<0.01)。结论:TGF-β/Smads信号通路能介导GIST882细胞的增殖和侵袭能力,调控Slug的表达,且该调控是Smad3依赖性的。Slug可能在TGF-β/Smads信号通路介导的GIST转移过程中发挥重要的作用。 丁杰 张忠民 徐开盛 董奇 糜睿 刘航 蒋专 杨晓飞 廖国庆关键词:胃肠间质瘤 转化生长因子Β 细胞增殖 肿瘤转移 组蛋白赖氨酸特异性去甲基化酶1相互作用蛋白的研究进展 被引量:2 2020年 组蛋白赖氨酸特异性去甲基化酶1(LSD1)是一种去甲基酶,其功能依赖黄素腺嘌呤二核苷,能特异性催化组蛋白赖氨酸H3第4位和第9位的去一甲基、二甲基反应(H3K4me、H3K4me2、H3K9me、H3K9me2),调控靶基因的表达。正常组织中有LSD1的表达,多种肿瘤组织中也易表达,并且与肿瘤的发生、增殖、侵袭转移过程密切相关。LSD1在细胞内能与多种蛋白结合形成复合物,各司其职,共同调控靶基因,将这些蛋白称为LSD1相互作用蛋白。本文作者就LSD1相互作用蛋白的研究成果作一综述。 李显 丁杰 岑祥莹 刘振华 刘振华 吴明 蒋专 樊斐 张林 曾家兴 夏宇 夏宇关键词:组蛋白 相互作用蛋白 复合体 结直肠癌免疫治疗的研究进展 被引量:7 2020年 结直肠癌的传统治疗方式尽管能提高总生存率,但是复发或转移患者疗效欠佳。近年来,随着分子生物学、肿瘤免疫学的迅速发展,免疫治疗成为一种重要的肿瘤治疗手段,在部分结直肠癌患者中也取得较好效果。本文就结直肠癌免疫治疗的研究进展作一综述。 曾家兴 丁杰 丁杰 夏宇 张媛玲 黄锐 陈俊豪 张林 樊斐 李显关键词:免疫治疗 肿瘤疫苗 细胞疗法 细胞因子疗法 赖氨酸特异性去甲基化酶1与Wnt信号通路中相关蛋白在结直肠癌中的表达及意义 目的:探讨赖氨酸特异性去甲基化酶1(Lysine-specific demethylase 1,LSD1)和Wnt信号通路中相关蛋白在结直肠癌、癌旁组织、正常结直肠组织,以及结肠癌细胞和正常结肠上皮细胞中的表达情况。方法... 刘航关键词:结直肠癌 WNT信号通路 文献传递 粪便miRNA作为结直肠癌生物标记物的价值 被引量:5 2022年 结直肠癌是最常见的消化系统恶性肿瘤,患者生存率与诊断时癌症分期呈负相关,如果及早发现,高达90%的死亡是可以避免的。迄今为止,许多miRNA已经被证实是肿瘤抑制基因或癌基因,具有很好的临床应用前景。但目前研究主要集中在结直肠癌患者外周血液及组织样本的miRNA,较少有研究关注粪便miRNA水平的变化,并系统阐述粪便miRNA在结直肠癌患者中的优势。因此,本文就结直肠癌患者粪便中miRNA的最新研究进展进行综述,重点介绍了在结直肠癌患者粪便中不同种类miRNA的诊断价值及预后评估,并阐述其作为结直肠癌生物标志物的潜在价值。 曾家兴 田菁菁 卢伟 黄锐 陈俊豪 张林 谢雪晴 张媛玲 丁杰关键词:结直肠癌 粪便 MIRNA 生物标志物