国家标准化管理委员会项目(20081021-T-361) 作品数:14 被引量:60 H指数:5 相关作者: 朱庆义 胡朝晖 赵利伟 宣瑞红 王娟 更多>> 相关机构: 广州金域医学检验中心有限公司 山西医科大学 军事医学科学院 更多>> 发文基金: 国家标准化管理委员会项目 国家科技重大专项 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
16S rRNA PCR基因测序鉴定临床标本军团菌 被引量:1 2010年 目的建立军团菌PCR基因测序鉴定方法,探讨广东地区非典型性肺炎患者军团菌感染状况。方法 2008年7月至2009年6月对广东地区各社区医院采集的100例非典型性肺炎痰液标本,采用军团菌16S rRNA基因片段作PCR试验,基因测序法对PCR结果进行鉴定。结果 100例非典型性肺炎患者痰液16S rRNA PCR试验阳性13例,其中12例经测序鉴定为嗜肺军团菌,1例测序结果阴性,结果表明PCR试验敏感性100%,特异性98.86%。结论 16S rRNA PCR基因测序不仪可以提高阳性率,而且可以排除假阳性。本研究结果显示,广东地区各社区医院内非典型性肺炎患者的军团菌感染率为1 2%。 宣瑞红 王娟 胡朝晖 周向红 朱庆义关键词:肺炎 聚合酶链反应 微生物敏感性试验 军团菌分子生物学分型测定及其实用性研究进展 被引量:13 2010年 军团菌病首次暴发至今已有30多年历史,临床上对于军团菌的检测方法很多,细菌分离培养是军团菌检测的"金标准"。近年来,分子生物学方法检测军团菌已被越来越多的实验室所认可。本文对军团菌分子生物学检测和分型方法及其用于检测的目的基因作简要概述,并对其优劣和实用价值进行探讨。 宣瑞红 胡朝辉 朱庆义关键词:军团菌 分子生物学 基因分型 聚合酶链反应-酶切分型鉴定广州地区环境水源军团菌 被引量:4 2010年 【目的】探讨聚合酶链反应-酶切分型在快速鉴定环境水源军团菌方面的应用价值,并了解广州地区环境水源军团菌的分布状况。【方法】对广州地区采集的44份环境水样,作军团菌分离培养,再对分离菌株进行16Sr DNA PCR-酶切分型鉴定、16S rDNA基因测序和mip基因测序鉴定。【结果】在广州地区环境水源分离的112株军团菌,经聚合酶链反应-酶切分型鉴定、16S rDNA基因测序和mip基因测序鉴定,检出嗜肺军团菌66株,非嗜肺军团菌46株,其中菲氏军团菌20株,戈氏军团菌17株,橡树岭军团菌7株,长滩军团菌2株。【结论】聚合酶链反应-酶切分型检测环境水源军团菌是一种简便、快速、特异的鉴定方法;在广州地区环境水源中普遍存在军团菌,主要是嗜肺军团菌,其次是菲氏军团菌,戈氏军团菌,橡树岭军团菌和长滩军团菌。 赵利伟 胡朝晖 宣瑞红 刘洋敏 朱庆义 王娟 詹晓勇关键词:军团菌 基因测序 环境水军团菌分离培养及其表型与分子分型研究 被引量:5 2012年 目的探讨环境水系军团菌分离培养及其表型和分子分型鉴定方法。方法采用军团菌常规分离培养、生化试验、血清学分型和菌体脂肪酸成分分析、PCR试验、AFLP基因分型和SBT核酸测序分型鉴定等技术方法,对广东地区195份环境水系分离的226株军团菌进行表型和基因型分型鉴定。结果在广东地区195份环境水样中共检出军团菌226株,主要是嗜肺军团菌170株(75.22%),长滩军团菌21株(9.29%)、菲氏军团菌21株(9.29%)、橡树岭军团菌和茴芹军团菌各2株(0.89%),其他非嗜肺军团菌10株(4.42%)。125株军团菌细胞脂肪酸成分测定分嗜肺军团菌、橡树岭军团菌、长滩军团菌、菲氏军团菌等6种类型;54株嗜肺军团菌1型AFLP分型,分为25个基因型。7株不能用生化试验、细胞脂肪酸成分分析和AFLP分型做出鉴定的军团菌,用SBT核酸测序鉴定为菲氏军团菌2株、长滩军团菌3株和茴芹军团菌2株。结论广州地区环境水系军团菌分布以嗜肺军团菌为主,同时有橡树岭军团菌、菲氏军团菌、长滩军团菌和茴芹军团菌等多种军团菌种;SBT核酸测序鉴定有助于发现军团菌新种。 朱庆义 胡朝晖 赵利伟 陈文聪 杨瑞馥 宋亚军 郭兆彪关键词:军团菌 表型 分子分型 环境水 生物信息学的进展及其在分子微生物学研究中的应用 被引量:10 2011年 生物信息学的飞速发展,为其他生命学科的研究提供了新的平台。随着微生物基因组、蛋白质组的数据日益丰富,生物信息学方法在分子微生物学研究中应用越来越广泛,为人类疾病防治带来了不可估量的影响。本文概述了生物信息学的研究概况和生物信息学在分子微生物学研究领域中的应用,如微生物鉴定、溯源分析、新型疫苗研究,以及微生物致病机理的研究等具有重要意义。 陈文聪 胡朝晖 朱庆义关键词:生物信息学 实时荧光定量PCR及其在军团菌检测中的应用 被引量:3 2011年 军团菌是一种兼性胞内寄生菌,可入侵人体巨噬细胞,并在其中繁殖,是引起人类军团菌病的重要病原体。目前已确认军团菌有50多个种,70多个血清型,其中20多种与人类疾病相关[1]。由于军团菌种类繁多,常规的检测鉴定方法已不能满足需要。近年来,随着分子技术特别是PCR技术的发展,已有许多分子生物学方法被用于军团菌的检测。 赵利伟 胡朝晖 朱庆义关键词:军团菌病 基因设计 RRNA 荧光基团 荧光定量 临床痰液标本军团菌检测方法研究 被引量:1 2010年 目的探讨荧光定量PCR、PCR-酶切分型及16SrDNA基因测序三种方法在检测临床痰液标本军团菌方面的应用价值。方法对274例肺部感染患者痰液标本作军团菌分离培养,荧光定量PCR、PCR-酶切分型及16SrDNA基因测序检测。结果 274份痰液标本细菌培养均为阴性,经荧光定量PCR检出军团菌阳性13例(4.74%),其中10例经PCR-酶切分型及16SrDNA基因测序检测为军团菌阳性,其余261例检测为阴性。结论荧光定量PCR、PCR-酶切分型及16SrDNA基因测序均可用于临床痰液标本军团菌的检测,PCR-酶切分型是一套更合理的检测方法。 张润梅 武素梅 周向红 李连青 胡朝晖 刘洋敏 赵利伟 朱庆义关键词:聚合酶链反应 寡核苷酸序列分析 实时荧光PCR检测军团菌研究进展 被引量:5 2010年 实时荧光定量PCR(polymerase chain reaction,聚合酶链反应)能对目标基因进行定性分析,同时也可以对其起始浓度进行定量,且有可减少交叉污染和缩短样品检测时间、无需对PCR终产物进行凝胶电泳分析、高敏感性和特异性等优点,近年来被广泛用于军团菌分型检测。本文对用于军团菌实时荧光YPCR检测的目的基因和检测方法作简要综述,并对其优劣和实用价值进行探讨。 王娟 方存磊 朱庆义 胡朝晖关键词:聚合酶链反应 军团菌测序鉴定与分子分型研究进展 2010年 用分子生物学方法检测军团菌已经被越来越多的专家和实验室所认可,其中以基因测序为基础的军团菌鉴定和分型方法是目前认为最客观、准确且具有较好重复性的方法。军团菌常用的测序靶点有16S rRNA基因、mip基因、rpoB基因、dotA基因、23S-5S rDNA基因间隔区、5S rRNA基因、gyrA基因、dnaJ基因、rnpB基因等位点,但观其分型效果、重复性、流行病学可信度及分辨能力,最具优势的是欧洲军团菌感染工作组(EWGLI)提出的利用7个基因(flaA,mompS,pilE,asd,mip,proA,neuA)测序对军团菌进行分型。随着基因测序技术和序列数据库的发展,基因测序在军团菌的鉴定、分型中发挥着越来越重要的作用。本文对基因测序鉴定军团菌的技术方法及其优缺点和实用价值做一简要概述。 宣瑞红 胡朝晖 朱庆义关键词:军团菌 基因测序 分子生物学 荧光原位杂交技术在军团菌研究中的应用与进展 被引量:2 2013年 军团菌是一种兼性胞内寄生菌,可引起人类军团菌病与庞蒂亚克热。目前已确认军团菌有58个种,70多个血清型,接近20个种有临床分离报道,其中嗜肺军团菌(Legionella phenomenon)为引起人类军团菌病的主要病原体。公共场所集中空调系统冷却水中极易滋生军团菌,而引起军团菌病的大规模暴发。军团菌作为一类苛养性致病菌,如何对其进行快速鉴定检测一直是微生物检验的难题。 顾全 赵利伟 朱庆义关键词:军团菌 荧光原位杂交