山东省优秀中青年科学家科研奖励基金(05BS02017)
- 作品数：4 被引量：20H指数：3
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- 不同来源辣椒疫霉菌的遗传多样性分析被引量：2
- 2008年
- [目的]探索来自辣椒寄主和土壤的辣椒疫霉的遗传多样性。[方法]通过利用12个10碱基随机引物对来自我国4个不同地理区域的22个辣椒疫霉菌株的亲缘关系进行RAPD分析。[结果]受试22个菌株共产生101条谱带,其中多态性为99条,占98.02%,说明受试辣椒疫霉菌具有丰富的遗传多样性。根据引物扩增的DNA指纹图谱,运用UPGMA分析法,以遗传相似系数0.5为阈值,将供试22个菌株划分为3个遗传聚类组(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ)。RAPD标记技术分析表明,来辣椒寄主和土壤的菌株的全基因组DNA扩增图谱差异很大。[结论]供试菌株具有丰富的遗传多样性,来自不同遗传背景的菌株差异显著,聚类组的划分与菌株的来源有一定的相关性。
- 孙文秀张修国
- 关键词：辣椒疫霉菌DNA指纹图谱
- 不同来源辣椒疫霉菌的系统发育分析被引量：13
- 2009年
- 运用PCR直接测序法，对9个辣椒疫霉菌株和1个外类群大豆疫霉菌株的nrDNA的ITS区（包括ITS1、5．8SrDNA和ITS2）进行序列测定。结果表明，不同来源的辣椒疫霉菌的ITS序列总长度为750～753bp。采用PAUP软件进行系统发育分析表明：来自辣椒寄主和土壤的辣椒疫霉菌各自聚为一组，与其地理来源没有明显的相关性。
- 孙文秀张修国
- 关键词：辣椒疫霉菌ITS序列分析系统发育
- 致病性和非致病性辣椒疫霉菌群体的遗传多样性被引量：5
- 2008年
- 从辣椒疫病病土和病株上分离鉴定辣椒疫霉菌(Phytophthora capsici),得到11个致病性和11个非致病性菌株。利用RAPD分子标记对其遗传多样性进行分析,结果表明受试致病性和非致病性辣椒疫霉菌株分别聚为1个组,但其中3个非致病性菌株与致病性菌株聚为1个组。ITS序列分析发现,受试致病性和非致病性辣椒疫霉菌株分别聚为1个组,但是非致病性辣椒疫霉菌的遗传多样性比致病性的高,这说明致病性菌株可能是单系群起源。此外,在辣椒疫霉菌的遗传表型和地理来源方面,致病性和非致病性辣椒疫霉菌之间不存在任何关系,这表明辣椒疫霉菌的起源并不单独依赖其地理来源。
- 孙文秀张修国
- 关键词：辣椒疫霉菌RAPDITS序列分析
- 不同地区辣椒疫霉致病力分化及其DNA多态性分析被引量：3
- 2008年
- 从山东、湖北、广东、浙江、云南、重庆和湖南7个不同省份采集辣椒疫病病株和病土,经分离纯化获得31株辣椒疫霉菌(Phytophthora capsici)菌株,利用浸根法进行致病力测定,并从100个RAPD随机引物中选出多态扩增性强的14个引物用于对其全基因组DNA的RAPD分析。结果表明,31个菌株具有明显的致病力差异,并有非致病、弱致病、强致病的分化。利用RAPD分子标记方法对受试31个菌株的基因组进行扩增,并用UPGMA软件对受试菌株间的遗传距离进行聚类分析构建系统树状图。结果显示,不同致病力分化的辣椒疫霉具有丰富的遗传多样性,遗传聚类组的划分与菌株的致病力没有显著的相关性。由此说明,来自不同地区的辣椒疫霉的DNA存在较高的遗传多样性,但与其致病力无直接的相关性。
- 孙文秀张修国
- 关键词：致病力分化DNA多态性RAPD分析
