International Foundation for Science(IFSD4348-1)
- 作品数：2 被引量：3H指数：2
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- 松材线虫Bx-sHSP16A基因克隆及蛋白质结构研究被引量：2
- 2013年
- 分子伴侣小热激蛋白(sHSPs)是线虫度过高温环境的关键因子。为开发直接针对松材线虫的防治技术提供理论依据,对松材线虫小热激蛋白Bx-sHSP16A基因进行了研究。采用SL法进行基因全长克隆,STRING9.0进行蛋白质互作网络分析,NAMD2.9进行分子动力学模拟。本研究克隆到松材线虫小热激蛋白基因Bx-sHSP16A。Bx-sHSP16A具α-crystallin保守结构域"F-polar-R-polar-aromatic-x-L-P"序列和"I/L-x-I"序列,初步判断具备分子伴侣功能。Bx-sHSP16A与多个蛋白发生互作,深入研究这些蛋白有助于了解Bx-sHSP16A在应激反应路径中的作用。Bx-sHSP16A二聚体中A亚基的"I/L-x-I"序列可以嵌入B亚基的去水合位点,契合后氢键稳定,说明Bx-sHSP16A可以形成多聚体。在应激反应过程中,去水合位点与多聚体聚合相关,Bx-sHSP16A以多聚体形式发挥分子伴侣功能。
- 刘立宏王峰王步勇马玲杨洋崔伟婵
- 关键词：松材线虫多聚体
- 松材线虫Rbx1基因克隆及蛋白质结构分析被引量：2
- 2013年
- 为鉴定潜在的松材线虫防治靶标基因,应用SL法克隆到松材线虫Rbx1,并完成Rbx1蛋白质结构分析。松材线虫Rbx1与泛素途径多个蛋白发生互作。通过Rbx1与E2的分子对接研究,共发现Rbx1与E2分子间存在3个氢键,Rbx1含有1个E2契合"口袋"。分子动力学模拟表明,Rbx1的氮末端是其功能区域。松材线虫Rbx1是潜在的防治靶标基因,以该区域为靶位点设计抑制子或可达到防治该线虫的目的。
- 王步勇王峰刘立宏马玲胡庆东梁为玉高威
- 关键词：松材线虫分子动力学模拟
