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杏SSR反应体系的优化研究被引量：4: 2009年; 研究了杏SSR-PCR反应体系的主要成分对扩增结果的影响,并进行了体系验证。优化后的反应体系为：总体积20μL,1×buffer2、.0 mM/L Mg^2＋0、.25 mM/L dNTP、0.20μM/LPrimer6、0 ng/20μL模板DNA和0.05 U/μL Taq酶。利用32个杏品种验证此反应体系,6%的变性聚丙稀酰胺凝胶电泳检测结果显示,扩增产物在184-267 bp之间,不同品种间DNA谱带具有多态性,且反应体系的稳定性和可重复性好。; 宁宁王玉柱张俊怀杨丽孙浩元章镇; 关键词：SSR-PCR

不同用途杏品种群的AFLP分析被引量：3: 2011年; 利用荧光AFLP技术,对49个隶属于不同用途的杏种质资源的遗传多样性和群体遗传结构进行了研究,结果表明,8对EcoRⅠ/PstⅠ引物平均扩增多态带数量为183.9,平均多态带百分比为85.1%,揭示了杏资源丰富的遗传多样性。杏资源在个体间的Nei’s基因多样度(H=0.184)、Shannon信息指数(I=0.295)、观测等位基因数(Na=1.851)和有效等位基因数(Ne=1.294)都显著高于群体水平。在群体水平上,杂种杏品种类群的4个遗传变异参数都高于其他4个类群,遗传变异度最大。5个品种类群的遗传分化系数(Gst=0.267 9)显示,杏资源的遗传变异主要存在于群体内,占总变异的73.21%。仁用杏品种类群和观赏杏品种类群之间的遗传关系最近(遗传一致度IN=0.985 0,遗传距离D=0.015 1),鲜食加工兼用品种类群与其他4个类群的遗传关系比较结果显示,其与杂种杏品种类群间遗传关系最近(IN=0.946 3;D=0.056 5)。UPGMA聚类分析结果表明,以0.537为阈值将49份材料分为3个大类,第(1)类全部是鲜食加工兼用杏品种;第(2)类由全部仁用杏品种和全部观赏杏品种组成;第(3)类包括引进的3个品种和全部9个杂种杏。; 张俊环王玉柱孙浩元杨丽; 关键词：群体遗传结构

杏EST-SSR标记的开发被引量：28: 2011年; 利用MISA软件对NCBI上杏的15387条EST序列进行SSR位点查找,发掘出含有SSR位点的序列1073条,共有1353个SSR位点,候选SSR位点出现的频率为8.79%。二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸重复是最主要的重复类型,分别占23.50%、38.80%和23.43%。设计了50对EST-SSR引物并进行PCR扩增,发现40对引物能扩增出理想的PCR产物,其中有25对引物能够扩增出多态性带。随机对7对引物的部分杏扩增片段进行了测序分析,发现有57.1%的片段具有相应的SSR位点,对梅DNA指纹中部分谱带的测序结果也证明是杏扩增出的相应的SSR位点。根据推算,从杏EST中开发SSR标记的开发效率为3.98%。进一步选用20对扩增效果最好的引物对24个杏品种,16个花梅品种以及8个果梅品种进行DNA指纹构建与遗传多样性分析,结果表明,来源于杏的EST-SSR引物在梅中有很高的通用性,杏和梅是遗传差异明显的两种植物,果梅与花梅在遗传上是不能分为两类的同种植物。; 上官凌飞李晓颖宁宁王玉柱章镇房经贵; 关键词：EST-SSR

杏叶片DNA提取和荧光AFLP反应体系的建立被引量：1: 2010年; 以杏嫩叶为材料,利用改进的CTAB法,提取到高质量的杏叶片总DNA,通过优化酶切、连接、预扩增、选择性扩增等试验条件,建立了高效稳定的杏荧光AFLP反应体系;筛选出多态性好的12对引物组合,均获得稳定、清晰的扩增图谱,可进行杏品种鉴定、种质资源的遗传多样性和亲缘关系分析等研究。; 张俊环孙浩元杨丽王玉柱; 关键词：DNA提取

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