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国家自然科学基金(31270796)

作品数:4 被引量:9H指数:2
相关作者:朱平李慧仙陈天娇更多>>
相关机构:中国医学科学院北京协和医学院北京协和医学院药物研究所更多>>
发文基金:国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金“重大新药创制”科技重大专项更多>>
相关领域:生物学医药卫生更多>>

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 3篇生物学
  • 1篇医药卫生

主题

  • 2篇水解酶
  • 2篇紫杉
  • 2篇紫杉烷
  • 2篇P1
  • 1篇易错PCR
  • 1篇糖苷酶
  • 1篇葡萄糖苷酶
  • 1篇微孔板
  • 1篇木糖
  • 1篇高通量
  • 1篇高通量克隆
  • 1篇高通量筛选
  • 1篇Β-木糖苷酶
  • 1篇Β-葡萄糖苷...
  • 1篇MUTATI...
  • 1篇SES
  • 1篇TAXOL
  • 1篇LYC
  • 1篇N-
  • 1篇I

机构

  • 2篇中国医学科学...
  • 1篇北京协和医学...

作者

  • 3篇朱平
  • 2篇李慧仙
  • 1篇陈天娇

传媒

  • 2篇菌物研究
  • 1篇Acta P...
  • 1篇中国医药生物...

年份

  • 1篇2019
  • 3篇2013
4 条 记 录,以下是 1-4
排序方式:
Combinatorial mutation on the β-glycosidase specific to 7-β-xylosyltaxanes and increasing the mutated enzyme production by engineering the recombinant yeast被引量:3
2019年
Taxol is a 'blockbuster' antitumor drug produced by Taxus species with extremely low amount, while its analogue 7-β-xylosyl-10-deacetyltaxol is generally much higher in the plants. Both the fungal enzymes LXYL-P1à1 and LXYL-P1à2 can convert 7-β-xylosyl-10-deacetyltaxol into10-deacetyltaxol for Taxol semi-synthesis. Of them, LXYL-P1à2 is twice more active than LXYLP1à1, but there are only 11 significantly different amino acids in terms of the polarity and acidic-basic properties between them. In this study, single and multiple site-directed mutations at the 11 sites from LXYL-P1à1 to LXYL-P1à2 were performed to define the amino acids with upward bias in activities and to acquire variants with improved catalytic properties. Among all the 17 mutants, E12(A72 T/V91 S) was the most active and even displayed 2.8-and 3-fold higher than LXYL-P1à2 on β-xylosidase andβ-glucosidase activities. The possible mechanism for such improvement was proposed by homology modeling and molecular docking between E12 and 7-β-xylosyl-10-deacetyltaxol. The recombinant yeast GS115-P1 E12-7 was constructed by introducing variant E12, the molecular chaperone gene pdi and the bacterial hemoglobin gene vhb. This engineered yeast rendered 4 times higher biomass enzyme activity than GS115-3.5 K-P1à2 that had been used for demo-scale fermentation. Thus, GS115-P1 E12-7 becomes a promising candidate to replace GS115-3.5 K-P1à2 for industrial purpose.
Jing-Jing ChenXiao LiangFen WangYan-Hua WenTian-Jiao ChenWan-Cang LiuTing GongJin-Ling YangPing Zhu
关键词:MUTATIONDOCKINGYEASTTAXOL
7-木糖紫杉烷糖基水解酶Lxyl-p1-2基因突变库与高通量筛选体系的构建
2013年
对7-木糖紫杉烷糖基水解酶Lxyl-p1-2基因进行定向进化的初步研究,确定易错PCR条件、优化克隆连接方法、建立基于48微孔板高通量筛选模型。利用易错PCR技术对Lxyl-pl-2基因进行随机突变,比较不同浓度M聋’进行易错PCR,每组随机挑取10个克隆进行测序。序列分析表明:在M聋’浓度为7mmol/L条件下,碱基平均突变率为0.12%,即对于Lxyl-p1-2基因(2.4kb)来说,每个基因序列平均有3个碱基突变,达到构建突变文库的频率要求,选择该条件作为易错PCR条件。利用in-fusion技术将Lxyl-p1-2突变基因克隆到pPIC3.5K载体中,获得大量重组突变质粒。该研究优化了in-fusion连接反应中基因片段和载体片段的摩尔比,并探讨了基因片段与载体片段问同源序列长度对in—fusion连接效率的影响。试验结果表明:基因片段与载体片段的摩尔比最佳梯度为5:1;同源序列长度的选择成为影响in—fusion连接效率的关键因素之一。当同源序列长度为100bp时连接效率达到最大值,且显著高于同源序列长度为15~50bp的连接效率,此时阳性重组率提高至90%左右。与常规酶切一连接法相比,in-fusion法具有明显优势,同时将克隆周期由3~4d缩短为1~2d。挑取单菌落,在48微孔培养板上进行培养、诱导表达2d后,取菌液进行酶活测定(底物PNP-Xyl)。以野生型为例,β-木糖苷酶的酶活013405均数μ=3.415,其数据组标准差为δ=±0.078,数值符合正态分布的原理,建立统计学野生型均数分布范围和48微孔板高通量筛选,为后续突变体筛选提供基础。
李慧仙朱平
关键词:易错PCR
同源区段长度对In-Fusion技术连接效率的影响被引量:5
2013年
目的在目的基因原载体(DNA 模板)与克隆载体相同的条件下,探讨了 PCR 扩增片段(含目的基因)的末端与载体间同源区段长度对 In-Fusion 连接效率的影响,并建立以In-Fusion 技术为基础的高通量克隆方法。方法以糖基水解酶 Lxyl-p1-2(2.4 kb)基因突变库的构建为例,设计引物使目的基因的两端分别与线性化载体末端含有15~200 bp 重叠序列,并通过易错 PCR 方法获得含目的基因的 PCR 扩增片段,运用 In-Fusion 技术将 PCR 扩增片段定向克隆至表达载体 pPIC3.5K 中。结果对于长度大约为2.4 kb 的较大片段 DNA 的克隆, PCR 扩增片段的末端与载体间最适同源区段长度约为100 bp,此时连接效率最高,其阳性重组率高达90%左右,是常规酶切连接法的3倍。与后者相比,该技术将克隆周期由3~4 d 缩短为1~2 d。结论优化的同源区段长度可以显著提高 In-Fusion 技术对于2.4 kb 目的基因与载体的连接效率,该方法尤其适用于定向进化过程中基因突变库的构建。
李慧仙朱平
关键词:高通量克隆
7-木糖紫杉烷糖基水解酶Lxyl-p1-1及Lxyl-p1-2的催化特性被引量:1
2013年
糖基水解酶Lxy-l p1-1和Lxy-l p1-2是天然药物活性物质与功能国家重点实验室,卫生部天然药物生物合成重点实验室克隆自真菌香菇的重组蛋白,具有β-木糖苷酶/β-葡萄糖苷酶双重活性,能专一性水解脱除7-木糖-10-去乙酰紫杉醇等的木糖基,生成的C-7位羟基化产物可以作为前体半合成重要的抗肿瘤药物紫杉醇或其类似物。前期工作显示:Lxy-l p1-1和Lxy-lp1-2的序列同源性高达97%,但后者的催化活性是前者的2倍以上;Lxy-l p1-2水解生色底物PNP-Xyl的最适温度为50℃,最适pH为4.0。为系统地观察两酶的催化特性,在对天然药物活性物质与功能国家重点实验室,卫生部天然药物生物合成重点实验室构建的工程酵母进行培养、诱导7 d后冷冻干燥菌体。将冷干的菌体破碎得到蛋白粗提物,再经过Ni亲和色谱和HPLC凝胶色谱法制备和纯化得到Lxy-l p1-1和Lxy-l p1-2重组蛋白。以生色底物PNP-Xyl和PNP-Glc及7-木糖紫杉烷底物7-木糖-10-去乙酰紫杉醇(XDT)与重组酶进行反应,重点测定Lxy-l p1-2水解XDT的最适温度和最适pH,并在最适条件下测定重组酶对不同底物的动力学参数。试验结果表明:Lxy-l p1-2水解底物XDT的最适温度为45℃,最适pH为4.5;动力学测定结果显示:Lxy-l p1-1和Lxy-l p1-2的β-葡萄糖苷酶活性均显著高于其β-木糖苷酶活性,这与之前的研究结果相一致;Lxy-l p1-1对于底物PNP-Xyl,PNP-Glc和XDT的kcat/Km值分别低于Lxy-lp1-2对于上述3种底物的kcat/Km值(0.77 s-1×mM-1,1.65 s-1×mM-1和0.30 s-1×mM-1vs.1.67 s-1×mM-1,2.85 s-1×mM-1和1.07 s-1×mM-1)。
陈天娇朱平
关键词:Β-木糖苷酶Β-葡萄糖苷酶
共1页<1>
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