江苏省卫生厅面上基金(H200642)
- 作品数：2 被引量：7H指数：1
- 相关作者：阚清杨洋周晓玉张晓群张盼更多>>
- 相关机构：南京医科大学南京医科大学附属南京儿童医院南京医科大学第二附属医院更多>>
- 发文基金：江苏省卫生厅面上基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- miRNA-126＊靶基因预测及其相关信号通路的生物信息学分析被引量：6
- 2013年
- 目的通过对miRNA-126*进行靶基因预测及信号通路生物信息学分析,以期为miRNA-126*靶基因相关实验及其调控肺发育机制的深入研究奠定基础。方法首先利用microRNA(miRNA)芯片技术分别检测胎龄16 d、19 d和21 d胎鼠肺组织中miRNA-126*的表达水平,进而应用miRGen2.0数据库通过生物信息学方法预测其可能的靶基因,然后对其靶基因集合应用Cytoscape及其插件BiNGO进行功能富集分析(GO-analysis),最后应用DAVID数据库进行靶基因信号转导通路富集分析(KEGG Pathway analysis)。结果 miRNA-126*表达量在胎龄16 d、19 d和21 d 3组胎肺组织间逐渐上升。miRNA-126*预测靶基因共有422个,其靶基因集合功能富集于葡萄糖醛酸转移酶、糖代谢等分子功能,多细胞器官发育、发育进程等生物学过程及细胞分隔、细胞器界膜等细胞组分上。信号转导通路则显著富集于RNA降解信号通路,以及朊蛋白疾病信号通路中。结论本研究结果提示miRNA-126*参与了大鼠胎肺发育过程,为今后研究肺发育提供理论基础。
- 杨洋阚清张盼张晓群周晓光周晓玉
- 关键词：生物信息学肺发育
- miRNA-126/miRNA-126*在大鼠正常胎肺发育过程中的作用被引量：1
- 2012年
- 目的探讨miRNA-126/miRNA-126*在大鼠胎肺发育中的表达水平及其作用。方法 12只孕鼠随机分为3组,每组4只,3组仔鼠分别于胎龄16 d、19 d组和21 d时取出,运用苏木精-伊红染色在仔鼠胎肺发育的这3个关键时期对胎肺进行形态学观察,随后通过建立microRNA(miRNA)芯片,了解miRNA-126/miRNA-126*在3组仔鼠胎肺中的基本表达趋势,进而挑选出miRNA-126*并应用real-time PCR对其表达水平行进一步研究。结果 miRNA-126在3组芯片间表达无明显差异,而miRNA-126*随着肺发育进程表达量逐渐上升;采用real-time PCR对miRNA-126*表达进行进一步检测,结果亦显示miRNA-126*随着肺发育进程表达量逐渐上升,组间两两比较差异均有统计学意义(P<0.05)。结论 miRNA-126*可能在大鼠胎肺发育中起着重要作用。
- 杨洋阚清邱洁浦晓丹张盼张晓群周晓玉
- 关键词：肺发育
