青岛市科技发展计划项目(11-2-4-5-6-jch)
- 作品数：3 被引量：12H指数：2
- 相关作者：戴洪义张玉刚孙晓茜刘伟刘文莲更多>>
- 相关机构：青岛农业大学更多>>
- 发文基金：青岛市科技发展计划项目国家苹果产业技术体系建设专项山东省优秀中青年科学家科研奖励基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 柱型苹果MADS-box家族的2个同源基因克隆与生物信息学分析被引量：7
- 2012年
- 基于笔者前期进行的柱型苹果转录组测序(RNA-seq)结果,采用RT-PCR方法,从柱型苹果花芽中克隆了MADS-box基因家族的2个同源基因,分别命名为MdSOCla和MdSOClb。分析结果表明,MdSOCla开放阅读框长度为708 bp,编码235个氨基酸,蛋白质分子量为26.95 kDa,等电点为9.13;MdSOClb开放阅读框长度为717 bp,编码238个氨基酸,蛋白质分子量为27.49 kDa,等电点为9.61。MdSOCla和MdSOClb的编码区碱基序列相似性为83.49%,氨基酸的相似性为73.72%。MdSOCla和MdSOClb的第1～75个氨基酸为高度保守的MADS盒结构域,第105～170个为K盒结构域。在构建的SOC1系统进化树中,MdSOCla与MdSOClb与苹果SOC1关系最近,其次为橙SOC1,与拟南芥SOC1同源基因进化关系最远。苹果、橙、大岩桐关系较近而聚为一类,而大豆、豇豆、葡萄、拟南芥、草莓和玉兰聚为一类。蛋白质二级结构预测显示,MdSOCla蛋白有8个α-螺旋,5个β折叠区,13个β-转角;而MdSOClb蛋白有11个α-螺旋,7个β折叠区,11个β-转角。推测二者在花的发育中可能起不同的调控作用。
- 孙晓茜戴洪义张玉刚
- 关键词：柱型苹果MADS-BOX基因克隆
- 柱型苹果MdLAS基因的克隆与转化苹果和烟草的研究
- 柱型苹果(Columnar apple),又称芭蕾苹果(Ballerina apple),最早来自于‘旭’(McIntosh)的一个突变体‘旭威赛克’(McIntosh Wijcik),具有"树冠极紧凑,近似圆柱体,节间...
- 张玉刚韩菲Song Guo-qingWalworth Aaron戴洪义
- 关键词：苹果柱型苹果基因克隆
- 文献传递
- 柱型苹果开花抑制基因FLOW ERING LOCUS C基因的克隆与表达分析被引量：4
- 2015年
- 开花抑制基因FLC(FLOWERING LOCUS C)是春化作用中的关键基因,是控制开花时间的枢纽。本研究采用RT-PCR方法,以柱型苹果杂交后代群体中早花株系为试验材料,克隆得到柱型苹果花发育相关基因Md FLC。结果显示,Md FLC开放阅读框长度为603 bp,编码201个氨基酸,推测蛋白质分子量为47.68 k D,等电点为5.18;Md FLC蛋白二级结构包含9个α-螺旋,2个β-折叠区和12个β-转角,具有MADS典型的结构域。系统进化树分析表明,Md FLC与沙梨FLC进化关系最近,与豌豆的亲缘关系最远。半定量PCR及荧光定量PCR分析结果表明,Md FLC基因在普通型苹果‘富士’及柱型苹果株系(95-31,95-41,95-45,95-107,95-152)的花芽和花不同部位(花瓣,花蕊,花萼,花托)均有表达,在柱型苹果花芽、花瓣、花蕊、花萼及花托中的表达量均低于在富士苹果中对应部位的表达量,在花芽中的表达差异尤为显著,暗示了Md FLC基因参与了柱型苹果花芽分化以及开花进程。
- 刘文莲刘伟柏素花刘更森孙晓茜戴洪义张玉刚
- 关键词：柱型苹果荧光定量PCR
- 柱型苹果GRAS基因家族MdSCR的克隆与生物信息学分析被引量：1
- 2012年
- 以"富士×特拉蒙"杂交后代柱型株系新梢为试材,用同源克隆方法,得到了柱型苹果GRAS基因家族的MdSCR基因,开放阅读框(ORF)长度为1458bp,编码486个氨基酸,推测其蛋白质分子质量为54.894kD,等电点(pI)为5.96,具有GRAS基因家族典型结构域。MdSCR基因与毛果杨(Populus trichocarpa)GRAS转录因子的氨基酸序列具有67.8%的相似性,与江南卷柏(Selaginella moellendorffii)、葡萄(Vitis vinifera)、大豆(Glycine max)的SCARECROW-like氨基酸序列均有58.5%以上的相似性。氨基酸聚类分析表明,苹果和毛果杨、江南卷柏聚类关系最近,其次是葡萄,关系最远的是欧洲赤松;生物信息学分析表明,MdSCR的蛋白质二级结构有208个α-螺旋,54个延伸链和224个无规则折叠区。
- 韩菲戴洪义张玉刚
- 关键词：柱型苹果
