甘肃省科技支撑计划(090NKCAO58)
- 作品数：3 被引量：17H指数：3
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- 葡萄品种亲缘关系的RAPD标记分析被引量：7
- 2013年
- 利用RAPD分子标记技术对22个葡萄品种的亲缘关系进行了分析.研究表明:8个RAPD引物在22个葡萄品种中共扩增出162条带,其中多态性带为121条,多态率高达74%.采用UPGMA聚类分析法构建的系统树,在相似系数为0.425时,将22个葡萄品种分为6类.葡萄品种间的遗传多样性有明显差异.遗传差异小、亲缘关系近的品种很早就聚在一起,如‘黑大粒’和‘前项无核’;而有些品种,如‘藤稔’和‘高妻’,虽然同属巨峰系葡萄且均为同母本的杂交后代,聚类分析却分属于2大类,说明有性杂交的基因重组可表现出不同的基因型.
- 丁洁菲毛娟赵举鹏陈佰鸿
- 关键词：葡萄RAPD亲缘关系聚类分析
- 胡萝卜抗冻蛋白AFP基因的克隆与序列分析被引量：3
- 2013年
- 以胡萝卜幼苗为材料,提取基因组DNA,根据GenBank中的已知序列设计引物,利用聚合酶链式反应技术(PCR)体外扩增获得胡萝卜抗冻蛋白基因(AFP),将其连接到pGEM-Teasy vector载体上,并对其进行生物学信息分析.结果表明:克隆的AFP基因片段全长1 206bp,其中编码区长1 026bp,共编码341个氨基酸,蛋白质分子量为38.048ku,等电点为5.43,该蛋白为亲水性分泌型蛋白,有信号肽存在;其蛋白质二级结构以α-螺旋、β-折叠和无规卷曲为主.与GenBank中(A91926.1)的基因序列和氨基酸序列比较,同源性分别为99.4%和97.6%,表明AFP基因克隆成功.与不同地方品种胡萝卜AFP基因做同源性比较,结果发现不同品种间的AFP基因保持着很高的内同源性.
- 褚明宇陈佰鸿毛娟殷姣姣
- 关键词：胡萝卜抗冻蛋白克隆测序同源性
- 拟南芥转录因子CBF2的克隆与生物信息学分析被引量：7
- 2014年
- 本研究旨在克隆转录因子CBF2并对其进行生物信息学分析得到该基因相关信息。试验以拟南芥基因组DNA为模板,根据GenBank中拟南芥转录因子CBF2(FJ491243.1)已知序列设计引物,回收扩增的目的片段与T-easy载体连接后转入大肠杆菌(E.coli DH5α),经蓝白斑筛选后提取重组体的质粒,经滞后筛选、PCR、酶切鉴定无误后进行测序。经生物信息学分析,该基因全长651 bp,其中编码区长648 bp,编码216个氨基酸,其蛋白的分子式为C1056H1623N293O333S16,相对分子质量为24.26 kDa,等电点为5.00,该蛋白为亲水性非分泌型蛋白,无信号肽存在;其蛋白质二级结构以α-螺旋、β-折叠和无规卷曲为主。肽链可能含有9处丝氨酸磷酸化位点,6处苏氨酸磷酸化位点,以及2处酪氨酸磷酸化位点。本研究通过对CBF2基因的生物信息学分析,获得了该基因的相关信息,并与已有研究结果进行比对分析,推测该基因在植物抗逆过程中有重要的作用。
- 申鹏毛娟刘爱平陈佰鸿
- 关键词：拟南芥转录因子克隆生物信息学
