国家科技重大专项(2003BA12A08-01)
- 作品数:15 被引量:100H指数:8
- 相关作者:梁国栋付士红王环宇孙肖红吕新军更多>>
- 相关机构:中国疾病预防控制中心新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心广西壮族自治区疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项中美新发和再发传染病合作项目艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 中国分离乙脑病毒与灭活疫苗株(P3株)E基因差异分析被引量:14
- 2006年
- 目的 分析我国近年来从蚊虫及患者标本中分离的乙脑病毒与灭活疫苗株(P3株)之间在E基因区段核苷酸及氨基酸差异。方法 从GenBank中获取相应乙脑病毒株E基因区段核苷酸序列,通过Clustal X(1.8)、DNASTAR、GENEDOC(3.2)等生物学软件进行分析。结果 P3株与福建分离株之间核苷酸同源性在98.3%-98.5%之间、氨基酸同源性在98.2%-98.6%之间;P3株与上海分离株之间核苷酸同源性在88.0%-88.5%之间、氨基酸同源性在98.0%-98.4%之间。E基因区段500个氨基酸中P3株与所有新分离乙脑病毒株之间共存在19个位点的差异,其中在E-76、E-306、E-408处所有新分离毒株与P3株存在共同的差异;在E-160、E-487处福建分离株与P3株存在共同差异;上海分离株与P3株在E-129、E-222、E-227、E-366存在共同差异。结论 上海蚊虫中分离的Ⅰ型乙脑病毒和福建省脑炎患者中分离的Ⅲ型乙脑病毒与P3株在E基因的部分氨基酸位点存在差异,但均不处在影响病毒生物学特性的关键位点。
- 王环宇梁国栋
- 关键词:乙型脑炎病毒E基因
- 我国新分离乙脑病毒02-76株的全基因序列特征被引量:11
- 2006年
- 目的对我国新分离乙脑病毒02-76株进行全基因序列测定和分析,了解乙脑病毒基因组结构及毒力特性。方法设计乙脑病毒全基因组扩增引物,RT-PCR扩增片段,PCR产物直接测序,拼接后获得全基因序列。通过Clustal X(1.8)、DNASTAR、GENEDOC(3.2)等生物学软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析。结果新分离乙脑病毒02.76株全基因组全长10977个核苷酸,从96位到10391位,共10296个核苷酸编码一个开放阅读框,编码3432个氨基酸。与我国1949年分离的Beijing-1株相比较共存在248个核苷酸差异,16个氨基酸差异。与GenBank中选择的29株乙脑病毒全基因序列比较发现,其核苷酸总体差异率为0.6%-15.1%,氨基酸总体差异率为0.2%-4.6%。通过PrM/C区段、E区段、3’NTR区段及全基因序列进行系统进化分析均显示该毒株属于基因3型乙脑病毒。结论新分离的乙脑病毒02-76株属于基因3型,与中国分离株SA-14进化关系最接近。
- 王环宇潘晓玲付士红王雷李铭华Ichiro Kurane梁国栋
- 关键词:脑炎病毒基因种系发生
- 我国虫媒病毒分子生物学研究进展被引量:6
- 2006年
- 王雷梁国栋
- 关键词:虫媒病毒分子生物学研究脊椎动物昆虫叮咬关节痛
- 新疆库蚊分离的0507JS11病毒为Brevidensovirus新成员被引量:5
- 2009年
- 目的揭示新疆库蚊分离的0507JS11病毒的基本特征,明确其分类地位。方法对0507JS11病毒进行细胞感染特点观察、负染电子显微镜(简称电镜)观察、基因组核酸电泳检测、全基因序列测定和系统进化分析。结果0507JS11病毒可以引起Aedes albopictus C6/36细胞病变;完整病毒颗粒呈20面立体对称,直径20nm,无包膜;病毒基因组为长3977nt的单股正链DNA,基因组核酸电泳检测呈大小约4kbp的DNA条带;病毒基因组编码区包括3个开放读码框(open reading flame,ORF),ORF1和ORF2编码非结构蛋白(non—structural protein,NS),ORF3编码衣壳蛋白(capsid protein,VP);全基因序列系统进化分析显示病毒位于Brevidensovirus内一个独立进化分支。结论新疆库蚊分离的0507JSl1病毒为Brevidensovirus新成员。
- 吕新军翟友刚孙肖红付士红王焕琴童苏祥张松梁国栋
- 关键词:库蚊属基因组DNA
- 新疆南部地区蚊虫中病毒分离和初步鉴定被引量:5
- 2009年
- 目的首次从新疆南部地区蚊虫中分离病毒并完成初步鉴定。方法2005年7—8月在新疆南部地区采集蚊虫13491只,分130管进行研磨,取上清同时感染C6/36和Vero细胞进行病毒分离,获得的病毒分离物进行基因组核酸电泳检测和负染电子显微镜(简称电镜)观察。结果获得42个对C6/36细胞致病变(cytopathic effects,CPEs)而对Vero细胞不致病变的病毒分离物。对这42个病毒分离物进行基因组核酸电泳检测发现其中27个为相似的12节段双链RNA(double stranded RNA,dsRNA)病毒,1个为10节段dsRNA病毒,5个为DNA病毒;电镜观察显示了这3类病毒的形态特点,并且发现基因组核酸电泳检测中未获得分类信息的9个病毒分离物具有相似的形态特点,是另外一类病毒。结论新疆南部地区蚊虫中可能存在多种病毒,并且以具12节段dsRNA的病毒占优势。
- 吕新军吕志孙肖红付士红王焕琴童苏祥张松梁国栋
- 关键词:蚊科病毒
- 我国蚊虫分离的一种新型胞质多形体病毒被引量:5
- 2008年
- 0507BS3是从中国新疆喀什地区采集的库蚊和按蚊混合蚊标本分离的病毒株,对C6/36细胞致病变而对Ve-ro和BHK-21细胞不致病变。电镜观察显示病毒颗粒呈圆球形,直径约60nm(n=20),无包膜,单层衣壳,衣壳内有中央核。基因组核酸电泳显示基因组包括10条双链RNA(double stranded RNA,dsRNA)片段。病毒第10基因片段核酸序列测定显示该片段全长964bp(GenBankID:FJ150869),具有单一开放读码框,编码长度为275个氨基酸的蛋白,分子量约30.8kD。病毒第10基因片段核酸序列比对未发现相似的病毒核酸序列,氨基酸序列与胞质多形体病毒(Cytoplasmic polyhedrosis virus,CPV)第10基因片段编码的多形体蛋白部分区段匹配。病毒第10基因片段和已知各型CPV第10基因片段核酸序列共同进行系统进化分析显示该病毒位于独立的进化分枝,提示0507BS3病毒可能是一种新型CPV病毒。
- 吕新军吕志孙肖红付士红王焕琴童苏祥张松Attoui H梁国栋
- 关键词:蚊虫
- 新疆分离的0507JS60鉴定为辽宁病毒被引量:14
- 2008年
- 0507JS60是从中国新疆喀什地区采集的库蚊标本分离的病毒株,可以在C6/36细胞上稳定传代。电镜观察显示完整病毒颗粒呈球形,直径55nm(n=10),无包膜,衣壳表面壳粒结构非常清晰。基因组核酸电泳显示基因组包括12条双链RNA(Double stranded RNA,dsRNA)片段。病毒第12基因片段序列测定结果显示该片段全长760bp(GenBankID:FJ157354),具有长度为525bp的单一开放读码框(Single open reading frame,ORF),编码长度为174个氨基酸的蛋白,分子量约18.9kD。病毒第12基因片段序列比对显示与辽宁病毒(Liaoning virus,LNV)核酸序列同源性大于89,氨基酸序列同源性大于91。病毒第12基因片段系统进化分析显示该病毒与LNV病毒位于同一进化分枝内,与LNV-NE9712病毒株进化关系更接近。0507JS60经系统鉴定为LNV,这是首次在东北以外的地区分离到该病毒。
- 吕新军吕志孙肖红付士红王焕琴童苏祥张松Attoui H梁国栋
- 关键词:蚊虫
- 新疆南部地区蜱传虫媒病毒分子生物学调查被引量:9
- 2005年
- 目的了解新疆南部地区蜱传虫媒病毒的种类和分布情况。方法在新疆南部地区的23个采集地36个采集点,采集蜱标本5045只,分别建立蜱标本cDNA文库,用PCR方法检测标本可能携带的病毒。结果黄病毒属引物、加利福尼亚血清组病毒引物对34份cDNA文库检测结果均为阴性;内罗毕病毒属引物和新疆出血热病毒巢式引物在巴楚县蜱标本中检测到新疆出血热(XHF)病毒核酸序列,对检测到的XHF病毒L和S片段进行系统进化分析。结论对新疆南部地区5045只蜱进行四种六对引物的PCR检测,未检出黄病毒属和加利福尼亚血清组病毒核酸序列,获得新疆出血热病毒L和S片段的核酸序列,研究了其分子流行特征。
- 吕新军唐青冯育明郅奇王诚徐丽宏李浩付士红王环宇金鑫梁国栋
- 关键词:虫媒病毒
- 广西北流市分离到基因Ⅰ型流行性乙型脑炎病毒被引量:8
- 2010年
- 目的从广西流行性乙型脑炎(乙脑)监测点之一的北流市分离乙脑病毒并研究其基因分型。方法2006年在广西北流市采集蚊虫标本,在C6/36和BHK-21细胞上进行病毒分离,对病毒分离物进行多种虫媒病毒抗体的酶联免疫吸附试验,获得的乙脑病毒进行E基因扩增、测序和基因分型。结果在北流市采集骚扰阿蚊2588只和三带喙库蚊230只,分61批进行处理,获得3个病毒分离物,酶联免疫吸附试验与乙脑抗体反应,E基因测序后基因分型显示为基因Ⅰ型乙脑病毒。结论从广西蚊虫标本分离到基因Ⅰ型乙脑病毒。
- 莫兆军吕新军谭毅谢长江闭福银李幸乐潘晓玲孙肖红王环宇付士红梁国栋
- 关键词:乙型脑炎病毒E基因基因型蚊虫
- 2005年广西媒介蚊虫中流行性乙型脑炎病毒的分离鉴定被引量:8
- 2010年
- 目的对广西流行性乙型脑炎(乙脑)流行区的蚊虫进行乙脑病毒分离鉴定。方法2005年6、7月在北流市和靖西县居民区的畜圈内采集蚊虫标本,用C6/36和BHK21细胞分离乙脑病毒,用ClustalX(1.8)、Mega3.1等软件进行分离株E基因序列比对和系统进化分析。结果两地共采集三带喙库蚊771只、骚扰阿蚊425只,从三带喙库蚊中分离到3株基因1型乙脑病毒,3株病毒之间E基因片段核苷酸和氨基酸的最大同源性为99.3%和99.8%,与越南毒株之间核苷酸和氨基酸的最大同源性为98.4%和99.6%。结论从2005年采集自广西的蚊虫中分离到3株基因1型乙脑病毒,这是首次报道在广西分离到基因1型乙脑病毒。
- 孙肖红谭毅王环宇莫兆军谢艺红冯云闭福银周开娇孟维珊潘晓玲付士红梁国栋
- 关键词:乙脑病毒