中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2013JB018)
- 作品数：2 被引量：13H指数：1
- 相关作者：魏以梁胡兰李彩霞万立华贾竟更多>>
- 相关机构：公安部物证鉴定中心重庆医科大学天津医科大学更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生政治法律更多>>
- 个体识别SNPs位点组合筛选与法医学应用价值初探
- 2014年
- 目的筛选用于包括中国主要民族在内的多个群体个体识别的SNPs位点组合体系。方法以Kidd实验室筛选的86个SNPs位点、欧洲SNPforID组织构建的52-plex SNPs复合检测体系为基础,收集和整理这些位点在HapMap数据库中11个人群的分型数据,计算各位点杂合度和Fst值,筛选杂合度〉0.4,Fst值〈0.06,并在研究人群中处于Hardy-Weinberg和连锁平衡的位点组合。针对这些位点,采用MassARRAY分子阵列技术对自行收集的8个人群（尼日利亚人、坦桑尼亚查加人、印度人、丹麦人、俄罗斯汉特人、中国汉族、藏族、维吾尔族）308份样本进行分型,统计群体遗传学参数。结果按本文标准共筛选出66个SNPs位点,均符合Hardy-Weinberg平衡,之间互不连锁,平均杂合度和Fst值分别为0.475、0.014。在本文收集的8个人群中的随机匹配概率在1.45E-24~4.72E-27之间,累积非父排除率为0.999 995 608~0.999 997 876之间。结论本文筛选的SNPs组合系统具有较强的个体识别能力,可用于本文调查的HapMap数据库中11个人群和本文收集的8个人群的个体识别鉴定。
- 秦翠娇贾竟魏以梁万立华李彩霞胡兰
- 关键词：法医遗传学群体遗传学SNPS
- 30个祖先信息位点的筛选及应用被引量：13
- 2014年
- 使用一组祖先信息SNPs位点(Ancestry informative markers,AIMs)可以分析某人群的遗传成分构成,推断某个体的祖先来源。文章以HapMap数据库9个人群658份样本的分型数据为基础,从30个表型相关基因的282个SNPs位点中筛选出30个AIMs位点,基于微测序-通用芯片技术构建复合检测体系,建立人群等位基因频率数据库,用于东亚、欧洲和非洲人群遗传成分描述及个体种族来源推断。使用这组位点分析HapMap数据库中658份人群样本,初步验证位点的区分效能;使用构建的体系检验5个人群194份无关个体的DNA样本;通过Structure软件分析获取人群的成分构成以及个体的遗传成分,对个体样本进行种族来源推断。结果表明:筛选的30个AIMs位点符合哈迪温伯格平衡(P>0.01),位点之间没有连锁(r2<0.1),658份HapMap数据库样本和194份实验样本的祖先成分分析结果与已知结果完全一致。文章筛选并建立的30个AIMs位点复合检测体系能够有效地实现东亚、欧洲、非洲人群及其混合人群的成分构成和个体遗传成分的分析,该体系可以用于法医DNA检验中个体祖先的来源推断。
- 李彩霞贾竟魏以梁万立华胡兰叶健
- 关键词：分子遗传学
