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陕西省卫生厅科学研究基金(08H22)
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李亚蓉
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肠道病毒71型中国西安分离株全基因组核苷酸序列分析
2010年
目的 分析肠道病毒71型西安分离株(XA87-2008)全基因组核苷酸序列特征.方法 参考相关毒株序列,设计7对可重叠扩增全基因组的引物.提取一株2008年分离自西安市儿童医院手足口病病例标本的病毒基因组RNA,合成cDNA,进而扩增出7个目的片段,插入T载体克隆,对阳性克隆测序.利用MegAlign进行同源性分析,MEGA4软件进行进化分析.结果 XA87-2008毒株基因组全序7 414 bp,同源性分析与安徽阜阳2008年毒株高度同源,与其它基因亚型相差较大;进化分析显示其VP1区和全基因组序列均与C4基因亚型在同一进化支.结论 XA87-2008毒株为C4亚型,在进化关系上与近年来中国大陆流行株关系密切.
卢晓玲
郑海潮
杜全丽
黄银娟
李一为
杨扬
李亚蓉
马超锋
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肠道病毒71型
同源性分析
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