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海洋放线菌SMA-1代谢物多样性研究: 2014年; 以一株分离自黄海海泥(山东日照附近)的海洋放线菌SMA-1为研究对象,利用单菌多次级代谢物(One Strain Many Compounds,OSMAC)方法来增加其代谢物多样性,通过薄层层析和生物活性追踪检测其代谢谱变化,从其中一个活性较强的斑点分离鉴定出活性化合物Naseseazine B,最终建立了一套快速研究海洋放线菌代谢物多样性的培养和分析分离方法。; 潘钊龙熊智强刘巧霞郝玉有王勇; 关键词：薄层色谱

CYP725A4分子序列分析与结构建模: 2011年; CYP725A4在大肠杆菌等原核宿主中难以实现高效功能表达,是制约紫杉醇异源合成的瓶颈之一.文中利用生物信息学方法对该酶分子的序列进行疏水性和跨膜区分析,构建了其分子进化树,在此基础上用同源建模方法构建了其天然态以及切除N端跨膜区后的三级结构,并对CYP725A4实现功能表达所必需的辅助还原酶也进行了天然态和切除N端跨膜区后的三级结构建模.所构建的结构模型经PROCHECK验证具有较好的可靠性.; 蒙海林汪建峰王勇张嗣良王小宁; 关键词：生物信息学细胞色素P450酶

3种药用植物内生真菌的多样性分析及产生物碱菌株的筛选被引量：3: 2013年; 目的探究药用植物蛇足石杉、曼地亚红豆杉和南方红豆杉内生真菌的多样性,以及从中筛选产生物碱的内生真菌。方法用传统的表面灭菌和组织剪切法处理植物样品,通过加有抗细菌抗生素的真菌培养基分离和富集植物内生真菌。根据内生真菌的表型特征和ITS序列,对其进行分类和多样性分析,并用Neighbour-Joining的方法构建系统进化树。利用Dragendorff试验检测各内生真菌的发酵液,筛选具有产生物碱潜力的菌株。结果从3种植物中共分离到764株内生真菌,挑选出具有代表性表型特征的菌株83株,对ITS序列进行比对和多样性分析表明,这些菌株分布于子囊菌门(Ascomycota)的3个纲、18个属。最后,采用Dragendorff试验从这83株真菌中筛选出青霉菌属(Penicillium)B14菌株具有产生物碱的潜力。讨论三种药用植物含有丰富多样的内生真菌分布。采用Dragendorff试验检测发酵液中的生物碱,该方法快速简便,能有效提高筛选速率,可应用于产生物碱微生物的高通量筛选。; 杨迎迎熊智强王勇; 关键词：药用植物内生真菌多样性生物碱

复杂天然产物合成人工生物系统的设计与构建被引量：1: 2013年; 天然产物是人类疾病预防和治疗药物的最重要来源。合成生物学技术的蓬勃发展为天然产物的开发注入了全新的活力。文中重点介绍了如何利用合成生物技术进行复杂天然产物合成人工生物系统的设计与构建,包括与此相关的生物元件理性设计、生物元件挖掘、途径装配与集成,模块的组装与系统的适配等内容。; 汪建峰蒙海林熊智强王勇; 关键词：合成生物学

一株真菌所产环缩酚酸肽类化合物的分离和鉴定: 2014年; 对一株真菌ZME及其所产的次级代谢产物进行分离鉴定。通过形态观察和ITS测序对真菌ZME进行菌株鉴定,并对其发酵液上清液和菌丝体分别用乙酸乙酯和甲醇萃取;萃取后的有机试剂粗提物经硅胶柱层析和半制备HPLC分离纯化;纯化后的各组分利用光谱分析进行结构解析。结果表明,真菌ZME初步判断属于Beauveria felina。对这株真菌次级代谢物结构解析,共鉴定5个化合物Isaridin B、Isaridin A、Roseocardin、Roseotoxin B和Destruxin B,这5个化合物均为环缩酚酸肽类化合物,其中Roseocardin具有抗细菌活性。; 张明娥熊智强刘巧霞杨迎迎王勇

在酿酒酵母底盘细胞中利用单糖合成稀有人参皂苷Compound K: 人参号称'百草之王',人参皂苷是人参的主要活性成分。由于人参的栽培周期长并面临病虫害和连作障碍等问题,因此给人参皂苷的资源供给和品质控制带来很大的挑战。稀有人参皂苷Compound K(CK)是原人参二醇在C-20S羟基...; 严兴范云魏维王平平刘群芳魏勇军张磊赵国屏岳建民周志华; 关键词：合成生物学; 文献传递

合成生物学与天然产物开发被引量：6: 2011年; 天然产物依然是临床用药的重要来源。合成生物学的诞生为天然产物的开发提供了全新的机遇,传统的微生物药物、植物天然产物等研究领域都因合成生物学而获得新生。重点介绍了合成生物学在天然产物开发中的应用,包括新化合物及其生物合成元件的筛选,基于理性设计的天然产物异源生物合成,人工底盘细胞的系统优化等。; 卢志国汪建峰蒙海林熊智强王勇; 关键词：合成生物学

阿维链霉菌来源的磷脂酰丝氨酸合成酶基因的克隆及其在毕氏酵母中的异源表达: 2014年; 本文旨在构建阿维链霉菌(Streptomyces avermitilis)来源的磷脂酰丝氨酸合成酶基因(pss)的重组质粒,研究其在毕氏酵母中的异源分泌型表达。利用PCR技术克隆阿维链霉菌来源的pss基因,再通过电转化方法将重组质粒pOG-01转入毕氏酵母KM71中,构建重组工程菌KP1。实验结果表明,阿维链霉菌来源的磷酯酰丝氨酸合成酶基因在毕氏酵母KM71中成功表达,2 mL菌体上清催化50 mmol/L卵磷脂,转酯反应的转化率为58%,酶活为4.83 U/mL。; 欧广云熊智强周圣靓王勇李平

基于2-C-甲基-D-赤藓糖醇-4磷酸途径的产紫槐二烯大肠杆菌构建及其补糖策略优化被引量：1: 2014年; 2-C-甲基-D-赤藻糖醇-4-磷酸(2-methyl-D-erythritol-4-phosphate, MEP) 途径是大肠杆菌Escherichiacoli 唯一的萜类前体合成途径,研究表明它比甲羟戊酸(Mevalonate, MVA)途径具有更高的理论产率。但目前有关MEP 途径的调控所知非常有限,故单独强化MEP 途径对萜类异源合成产量的提高效果并不理想。研究中通过引入外源MEP 途径基因强化E. coli 萜类合成的遗传改造策略和发酵过程补糖控制优化,尝试更有效地释放MEP 途径的潜力,建立青蒿素前体——紫槐二烯的高密度发酵过程。研究结果表明共表达阿维链霉菌Streptomyces avermitilis dxs2 基因和枯草芽胞杆菌Bacillus subtilis idi 基因可使紫槐二烯的摇瓶发酵产量比野生菌株提高12.2 倍。随后针对该菌株建立了高密度发酵过程,发现稳定期的中前期(24?72 h) 是产物合成的关键期,通过稳定期补糖速率的调整,明显改善了产物合成速度,使紫槐二烯的产量从2.5 g/L 提高到了4.85 g/L,但不影响产物积累的周期。考虑到72 h 后菌体老化可能会影响产物合成,进一步采取了调整对数期的补糖速率控制菌体生长的策略,使紫槐二烯的产量达到6.1 g/L。研究结果为基于MEP 途径的萜类异源合成工程菌构建及其发酵工艺的建立奠定了基础。; 汪建峰熊智强张嗣良王勇; 关键词：大肠杆菌高密度发酵

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中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-EW-J-12)

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