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上海市科学技术委员会资助项目(11ZRl430200)

作品数:2 被引量:7H指数:1
相关作者:郭琪李觉胡忠义秦莲花高诗会更多>>
相关机构:同济大学附属肺科医院同济大学苏州大学更多>>
发文基金:上海市科学技术委员会资助项目国家科技重大专项更多>>
相关领域:医药卫生更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇医药卫生

主题

  • 2篇分枝杆菌
  • 2篇杆菌
  • 1篇遗传学
  • 1篇异烟肼
  • 1篇异烟肼耐药
  • 1篇异烟肼耐药性
  • 1篇耐药
  • 1篇耐药性
  • 1篇结核
  • 1篇结核分枝杆菌
  • 1篇菌属
  • 1篇焦磷酸
  • 1篇焦磷酸测序
  • 1篇分枝杆菌属
  • 1篇META分析
  • 1篇测序

机构

  • 1篇上海市肺科医...
  • 1篇苏州大学
  • 1篇同济大学
  • 1篇同济大学附属...

作者

  • 1篇赵英伟
  • 1篇高诗会
  • 1篇李觉
  • 1篇秦莲花
  • 1篇郭琪
  • 1篇胡忠义

传媒

  • 1篇中华结核和呼...
  • 1篇中华检验医学...

年份

  • 1篇2013
  • 1篇2012
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
一种五联重复序列在分枝杆菌简单序列重复区间分型中的应用研究被引量:1
2012年
目的分析微卫星5联简单重复序列在分枝杆菌基因组中的分布情况,并评价其简单序列重复区间(ISSR)分型能力,为分枝杆菌的基因分型及流行病学研究提供新的研究工具。方法实验菌株为17株分枝杆菌菌株和41株MTB临床分离株,17株分枝杆菌菌株包括分枝杆菌标准株15株、MTB临床菌株1株和MTB无毒株(H37Ra)1株。利用MICdb2.0软件分析微卫星数据库收录的分枝杆菌基因组中5联简单重复序列(CAGCG)n的分布特征,并以该序列为基础设计ISSR引物(5’-CAGCGCAGCGCAGCG-3’),用于分枝杆菌种间和种内菌株的基因分型分析。结果生物信息学分析显示(CAGCG)n在数据库收录的大部分分枝杆菌基因组中均有较高含量,其中在H37Rv、CDCl551、牛分枝杆菌和鸟分枝杆菌基因组中出现的次数分别为40、39、39和33次,且主要分布在编码序列区(分别为39、36、38和30次)。ISSR引物对分枝杆菌菌种的基因分型分析显示,15种常见菌种聚为2大簇,第1簇含有2个亚型,第2簇含有4个亚型,种间表现出高度的遗传多样性;ISSR引物对MTB临床菌株的分析结果显示,41株菌株聚为2簇,各簇分别有2个亚型,提示该引物对种内菌株也表现出良好的分辨力。结论以(CAGCG)n建立的ISSR分型体系,可用于分枝杆菌种间和种内菌株的遗传多样性分析。
高诗会胡忠义赵英伟秦莲花
关键词:分枝杆菌属
焦磷酸测序技术检测结核分枝杆菌异烟肼耐药性的Meta分析被引量:6
2013年
目的采用Meta分析方法综合定量评价国内外焦磷酸测序技术快速诊断异烟肼耐药的诊断价值。方法检索PubMed、Web of Science、Elsevier、中国知识资源总库(CNKI)、万方和维普,制定文献纳入排除标准,对纳入文献进行质量评分,提取纳入研究的特征信息。检验异质性并根据其结果选择相应的效应模型;采用Meta—Discl.4和Statal0.0软件进行综合定量分析;最后进行敏感性分析。结果检索相关文献114篇,最后纳入9篇。将焦磷酸测序与常规测序相比,其结果一致率100%。以细菌学药敏为金标准.焦磷酸测序检测katG基因时标本总数945份,加权敏感度、特异度及95%可信区间分别是0.77(0.73,0.80),1.00(O.99,1.00)。SROC曲线下面积为98.82%,纳入文献稳定性好。只检测inhA基因时的加权敏感度为0.19(0.15,0.24)、特异度为1.00(0.98,1.00)。结论焦磷酸测序技术检测结核分枝杆菌异烟肼耐药性有很高的特异度,在异烟肼耐药初筛时具有很高的临床价值,是药敏检测的有效辅助手段。(中华检验医学杂志,2013,36:329-332)
郭琪李觉胡忠义郑瑞娟
关键词:分枝杆菌结核异烟肼META分析
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