国家自然科学基金(31061160184)
- 作品数：4 被引量：32H指数：4
- 相关作者：陈之端应俊生路安民欧阳铖人李志敏更多>>
- 相关机构：中国科学院植物研究所中国科学院云南师范大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 关于种域的Rapoport法则检验、算法比较及中域效应消减--以云南无量山种子植物为例被引量：7
- 2010年
- Rapoport法则是物种分布幅度在环境梯度上的统计分布特征,与物种丰富度的梯度格局密切相关。关于Rapoport法则普适性检验的争论被认为与数据统计方法有关,但对这些算法有效性的评价还很少见。以云南无量山种子植物在海拔梯度上的分布数据为例,比较4种常用的Rapoport法则检验算法,并按照海拔分布幅度等级将全部物种分成4组后,再比较不同算法的结果。分析表明,中点法和上限法的检验结果受中域效应的显著影响,Steven方法受影响较小,而逐种法可以回避MDE影响。按海拔幅度分组统计,可以显著削弱MDE的影响,但是数据本身误差的效应有所放大。综合所采用的分析方法,无量山种子植物海拔分布整体格局中存在Rapoport法则;而山顶附近存在局部的反Rapoport法则现象,与植物群落类型的更替对应,可能与山顶气候效应有关。
- 梁军沈泽昊
- 关键词：海拔梯度
- 中国西南地区与台湾种子植物间断分布现象被引量：10
- 2012年
- 中国西南地区和台湾植物的间断分布是东亚生物地理学上一个十分有趣的研究课题。该文对种子植物进行了统计,发现有50属具有该分布式样的种对或种(包括变种和亚种);30属呈台-琼(至粤南)-西南间断分布,而其中大多数类群的分布区在粤南-桂南-滇南,即中国热带线以南。统计结果显示,有41属被子植物在台湾和西南之间呈连续分布;有35属从台湾分布至海南(和/或华南)或至福建(和华南)。中国台湾和大陆之间类群的连续分布,以及两者植物区系的巨大相似性表明,台湾作为大陆性岛屿,与中国大陆曾经属于一个统一的植物区系。新近纪以来台湾中央山脉和中国西南至东喜马拉雅地区均经历了海拔升高的过程,形成相似的低至中、高山生境;在第四纪冰期,一些类群在这两个地区之间形成连续的分布区。后来全球气温升高,这些植物类群从低海拔向高海拔山区迁移,由于华东至华中和华南缺少高山生境,使得原来连续分布的某些类群或其祖先类群在中国西南和台湾两地之间灭绝,从而形成间断分布。同时,台湾与大陆失去陆地连接后造成分类群在台湾和西南地区的隔离分化,以及中国南端热带生境的不连续性导致热带植物属种分布区的破碎也是形成台湾和西南间断分布的重要因素。最后将西南和台湾间断分布类群归纳为3种类型:孑遗型、分化型和热带型。
- 陈之端应俊生路安民
- 关键词：种子植物
- 生命之树及其应用被引量：7
- 2014年
- 生命之树的概念由达尔文在1859年提出,用以反映分类群的亲缘关系和进化历史。近30年来,随着建树性状种类的多样化、数据量的快速增长以及建树方法的不断发展和完善,生命之树的规模越来越大,可信度也越来越高。分子生物学、生态学、基因组学、生物信息学及计算机科学等的快速发展,使得生命之树成为开展学科间交叉研究的桥梁,其用途日益广泛。本文综述了生命之树研究的历史和现状,介绍了生命之树在以下几个方面的应用:(1)通过构建不同尺度的生命之树,理解生物类群间的系统发育关系;(2)通过时间估算和地理分布区重建,推测现存生物的起源和地理分布格局及其成因;(3)基于时间树,结合生态、环境因子及关键创新性状,探讨生物的多样化进程和成因;(4)揭示生物多样性的来源和格局,预测生物多样性动态变化,并提出相应的保护策略。最后,本文评估了生命之树在目前海量数据情况下遇到的序列比对困难、基因树冲突、"流浪类群"干扰等建树难题,并指出了构建"超大树"的发展趋势。
- 鲁丽敏孙苗张景博李洪雷林立杨拓陈闽陈之端
- 关键词：生命之树系统发育生物地理生物多样性系统发育多样性
- DNA条形码在中国金合欢属中的应用被引量：8
- 2013年
- 根据形态特征难以准确地辨别金合欢属植物,DNA条形码技术提供了一种准确地鉴定物种的方法。本文利用条形码技术对中国金合欢属物种的序列(psbA-trnH、matK、rbcL和ITS)及其不同组合进行比较,通过计算种内和种间变异进行barcoding gap分析,运用Wilcoxon秩和检验比较不同序列的变异性,构建系统树。结果表明:4个片段均存在barcoding gap,ITS序列种间变异率较psbA-trnH、rbcL和matK序列有明显优势,单片段ITS正确鉴定率最高,ITS+rbcL片段联合条码的正确鉴定率最高,因此我们认为ITS片段或条形码组合ITS+rbcL是金合欢属的快速鉴别最理想的条码。
- 欧阳铖人孙航李志敏张建文
- 关键词：ITSRBCLMATKPSBA-TRNHDNA条形码物种鉴定
