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国家自然科学基金(21076090)

作品数:11 被引量:78H指数:6
相关作者:林炜铁罗剑飞蔡小龙李敬源唐水水更多>>
相关机构:华南理工大学阿德莱德大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
相关领域:环境科学与工程生物学轻工技术与工程农业科学更多>>

文献类型

  • 11篇中文期刊文章

领域

  • 4篇生物学
  • 4篇环境科学与工...
  • 3篇轻工技术与工...
  • 2篇农业科学
  • 1篇化学工程

主题

  • 3篇养殖
  • 3篇养殖水体
  • 2篇对虾
  • 2篇对虾养殖
  • 2篇微生物
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  • 2篇微生物群落结...
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  • 1篇氮素
  • 1篇氮素循环
  • 1篇氮循环
  • 1篇氧化菌
  • 1篇氧化酶
  • 1篇荧光
  • 1篇荧光原位杂交

机构

  • 9篇华南理工大学
  • 1篇阿德莱德大学

作者

  • 9篇林炜铁
  • 5篇罗剑飞
  • 4篇蔡小龙
  • 3篇李敬源
  • 2篇李会琴
  • 2篇唐水水
  • 1篇何庆
  • 1篇杨晓苹
  • 1篇高利海
  • 1篇井洪珍
  • 1篇刘通讯
  • 1篇王原
  • 1篇刘昕

传媒

  • 3篇微生物学报
  • 2篇食品科学
  • 1篇生物技术通报
  • 1篇食品与发酵工...
  • 1篇微生物学通报
  • 1篇Journa...
  • 1篇Chines...
  • 1篇现代食品科技

年份

  • 4篇2013
  • 3篇2012
  • 4篇2011
11 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
Enrichment, isolation and identification of sulfur-oxidizing bacteria from sulfide removing bioreactor被引量:10
2013年
Sulfur-oxidizing bacteria (SOB) are the main microorganisms that participate in the natural sulfur cycle. To obtain SOBwith high sulfur-oxidizing ability under aerobic or anaerobic conditions, aerobic and anaerobic enrichmentswere carried out. Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) profiles showed that the microbial community changed according to the thiosulfate utilizationduring enrichments, and Rhodopseudomonas and Halothiobacilluswere the predominant bacteria in anaerobic enrichment and aerobic enrichment, respectively,which mainly contributed to the thiosulfate oxidization in the enrichments. Based on the enriched cultures, six isolateswere isolated from the aerobic enrichment and four isolateswere obtained from the anaerobic enrichment. Phylogenetic analysis suggested the 16S rRNA gene of isolates belonged to the genus Acinetobacter, Rhodopseudomonas, Pseudomonas, Halothiobacillus,0chrobactrum, Paracoccus, Thiobacillus, and Alcaligenes, respectively. The tests suggested isolates related to Halothiobacillus and Rhodopseudomonas had the highest thiosulfate oxidizing ability under aerobic or anaerobic conditions, respectively; Paracoccus and Alcaligenes could aerobically and anaerobically oxidize thiosulfate. Based on the DGGE and thiosulfate oxidizing ability analysis, Rhodopseudomonas and Halothiobacilluswere found to be the main SOB in the sulfide-removing reactor, andwere responsible for the sulfur-oxidizing in the treatment system.
Jianfei LuoGuoliang TianWeitie Lin
关键词:ENRICHMENT
典型对虾养殖水体中参与硝化与反硝化过程的微生物群落结构被引量:20
2012年
【目的】本研究旨在分析典型虾塘养殖水体中参与氮循环关键过程的菌群多样性,为指导实际对虾养殖水体中NH 4+和NO 2-的微生物降解、水体氮素污染控制以及虾塘养殖氮素循环的有效管理提供科学依据。【方法】使用聚合酶链式反应及变性梯度凝胶电泳技术(Polymerase Chain Reaction-Denaturing Gradient GelElectrophoresis,PCR-DGGE)从8个不同地点的虾塘水样中确定代表性水样,以此为典型水样进行研究,构建了氨单加氧酶基因(amoA)、亚硝酸盐氧化还原酶基因(nxrA)、亚硝酸盐还原酶基因(nirS)的克隆文库。利用限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)技术将克隆文库进行酶切分析。【结果】通过序列多态性分析,表明amoA基因克隆文库中所有序列都属于变形杆菌门β亚纲(β-Proteobacteria),分别为亚硝化单细胞菌属(Nitrosomonas)(81%)和亚硝化螺旋菌属(Nitrosospira)(19%)2个属。nxrA基因克隆文库检测到α-Proteobacteria和δ-Proteobacteria两个亚纲,其中硝化杆菌属(Nitrobacter)是优势菌群,占整个文库的92%,仅有一个类群属于δ亚纲的脱硫杆菌科(Desulfobacteraceae)(8%)。nirS基因文库群落结构相对于amoA和nxrA基因文库较复杂,分别为α-Proteobacteria、β-Proteobacteria亚纲和Actinobacteria,序列分析表明,25%的类群为固氮弧菌属(Azoarcus),25%的类群为(Polymorphum),20%的类群为需氧去氮菌属(Thauera),10%的类群为(Sophophora),10%的的类群为链霉菌属(Streptomyces),5%的类群为(Brachymonas),5%的类群为(Ruegeria)。【结论】典型虾塘养殖水环境中氮素循环关键过程的菌群多样性丰富,其中亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)和硝化杆菌属(Nitrobacter)分别是此环境中主要的氨氧化作用推动者和亚硝酸盐氧化作用推动者,而在反硝化重要环节中,固氮弧菌属等多种菌群都起着推动作用。
李敬源林炜铁罗剑飞田国梁
关键词:PCR-DGGE克隆文库系统发育树
南美白对虾养殖底泥中氨氧化细菌与氨氧化古菌多态性分析被引量:11
2011年
【目的】本研究皆在了解虾养殖底泥中氨氧化细菌与氨氧化古菌群落多态性。【方法】以功能基因为基础,构建氨氧化细菌(AOB)与氨氧化古菌(AOA)的氨单加氧酶α亚基基因(amoA)克隆文库。利用限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)技术将克隆文库阳性克隆子进行归类分析分成若干个可操作分类单元(Operational Taxa Units,OTUs)。【结果】通过序列多态性分析,表明AOB amoA基因克隆文库中所有序列都属于变形杆菌门β亚纲(β-Proteobacteria)中的亚硝化单细胞菌属(Nitrosomonas)及Nitrosomonas-like,未发现亚硝化螺旋菌属(Nitrosospira)。AOA amoA基因克隆文库中只有一个OTU序列属于未分类的古菌(Unclassified-Archaea),其余序列都属于泉古菌门(Crenarchaeote)。AOA群落结构单一且存在一个绝对优势类群OTU3,其克隆子数目占克隆文库的57.45%。AOB和AOA amoA基因克隆文库分别包括13个OTUs和9个OTUs,其文库覆盖率分别为73.47%和90.43%。AOB amoA基因克隆文库的Shannon-Wiener指数、Evenness指数、Simpson指数、Richness指数均高于AOA。【结论】虾养殖塘底泥中存在氨氧化古菌的amoA基因,且多态性低于氨氧化细菌,表明氨氧化古菌在虾养殖塘底泥的氮循环中可能具有重要的作用。
高利海林炜铁
关键词:AMOA基因PCR-RFLP分析
对虾养殖水环境宏基因组Fosmid文库的构建被引量:2
2011年
采用包埋法提取大片段基因组DNA,通过低熔点琼脂糖酶法回收40kb左右的DNA,经补平磷酸化、与pCC2FOS载体连接、体外包装和转染EP1300-T1R,构建对虾养殖水环境Fosmid文库。对文库进行鉴定,该文库平均插入片段大小约35kh,共保存8000个克隆,包括了大概8×10^8个微生物细胞。用几丁质酶筛选平板对文库进行初步筛选,筛选到4个阳性克隆子。本试验构建Fosmid文库,初步获取了对虾养殖生态系统的微生物遗传信息,对于从虾池原位环境鉴定并筛选具有潜在益生作用的功能微生物意义重大。
李会琴林炜铁蔡小龙李敬源唐水水
关键词:养殖水体FOSMID文库几丁质酶
普洱茶固态发酵过程中微生物群落结构及变化被引量:17
2013年
以少量茶叶发酵制备普洱茶过程中的茶叶样品为研究对象,采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCRDGGE)技术分别对茶叶中细菌16S rRNA和真菌18S rRNA的PCR产物进行分离,根据基因指纹图谱分析群落结构及其动态变化过程,并对细菌和真菌的主要优势条带进行克隆、测序、构建系统发育树。结果表明:茶叶堆表和堆芯的微生物群落结构差异小;在发酵过程中,细菌和真菌的种类均在二翻时迅速增加,群落结构产生显著变化;而后不同种类的数量随着发酵时间的推进有规律地增加或减少,最后趋于稳定。黑曲霉是发酵前期的优势菌种,芽孢杆菌属和Arxula adeninivorans是普洱茶发酵后期的主要优势菌群。
杨晓苹罗剑飞刘昕刘通讯林炜铁
关键词:普洱茶RRNARRNA
速冻水饺细菌总数FISH检测技术的优化
2013年
探索荧光原位杂交(FISH)技术检测速冻水饺中细菌总数的可行性及特异性,优化样品的快速、准确和便捷的检测体系。采用TAMRA标记的EUB338探针与大肠杆菌进行FISH实验条件的优化,并利用优化的FISH技术对4种速冻水饺中的8个样品进行检测和计数。应用FISH技术检测速冻水饺中细菌总数,理想的样品预处理实验条件为:热固定2 h,4%多聚甲醛固定20 min,系列乙醇脱水5 min,杂交条件为杂交温度为46℃,杂交液中去离子甲酰胺浓度为20%,杂交时间3h,洗脱液中NaCl浓度为225 mmol/L;检测的8个样品中,有2例细菌总数超标。FISH可以特异性的检出速冻水饺中的细菌总数,简便,检测周期短,灵敏度高,为保障食品安全提供更多的理论支持。
井洪珍罗剑飞林炜铁何庆
关键词:荧光原位杂交速冻水饺细菌总数
珠江沉积物中硫酸盐还原菌的分离筛选及其性质鉴定被引量:1
2013年
由于能够形成可以与重金属反应形成沉淀的硫化物,硫酸盐还原菌对于改善水体质量、确保食品和饮水安全上有着重要意义。从珠江沉积物中分离出一株硫酸盐还原菌SCUT-3,该细菌呈杆状、革兰氏染色为阴性,能够以乳酸、乙酸、丙酸作为唯一碳源,以硫酸盐作为电子受体进行生长,不能以葡萄糖、乙醇等作为唯一碳源,硫代硫酸盐和亚硫酸盐为电子受体进行生长。对该细菌的16S rRNA基因和aprA基因序列进行分析,发现其16S rRNA基因与Desulfovibrio acrylicus的16S rRNA基因的一致性最高,达到87%,其aprA基因与Desulfovibrio vulgaris str.Hildenborough的aprA基因一致性最高(通过blastx比对),达到90%。因此可判断其属于脱硫弧菌属(Desulfovibrio),但两基因的序列与已知序列同源性均不超过91%,判断该细菌属于脱硫弧菌属中的一个新种。
王原罗剑飞林炜铁
关键词:硫酸盐还原菌RRNA基因
Optimization of Fermentation Media for Enhancing Nitrite-oxidizing Activity by Artificial Neural Network Coupling Genetic Algorithm被引量:2
2012年
Two artificial intelligence techniques, artificial neural network and genetic algorithm, were applied to optimize the fermentation medium for improving the nitrite oxidization rate of nitrite oxidizing bacteria. Experiments were conducted with the composition of medium components obtained by genetic algorithm, and the experimental data were used to build a BP (back propagation) neural network model. The concentrations of six medium components were used as input vectors, and the nitrite oxidization rate was used as output vector of the model. The BP neural network model was used as the objective function of genetic algorithm to find the optimum medium composition for the maximum nitrite oxidization rate. The maximum nitrite oxidization rate was 0.952 g 2 NO-2-N·(g MLSS)-1·d-1 , obtained at the genetic algorithm optimized concentration of medium components (g·L-1 ): NaCl 0.58, MgSO 4 ·7H 2 O 0.14, FeSO 4 ·7H 2 O 0.141, KH 2 PO 4 0.8485, NaNO 2 2.52, and NaHCO 3 3.613. Validation experiments suggest that the experimental results are consistent with the best result predicted by the model. A scale-up experiment shows that the nitrite degraded completely after 34 h when cultured in the optimum medium, which is 10 h less than that cultured in the initial medium.
罗剑飞林炜铁蔡小龙李敬源
关键词:OPTIMIZATION
对虾养殖水体氨氧化菌的多样性分析与硝化作用的特征被引量:1
2011年
为了研究珠三角地区不同空间分布的对虾养殖水体中氨氧化菌多样性的异同与探究养殖水体中氨氧化菌的硝化作用特征,应用PCR-DGGE技术,结合非加权算术平均法(UPGMA)聚类分析和多维尺度分析(MDS)的方法,对珠三角地区7个对虾养殖场的水样中氨氧化菌的多样性进行对比分析,继而构建了模拟养殖生态系统,评估了系统中微生物的硝化能力和硝化作用特征。结果表明:在养殖水体中,氨氧化古菌的类别明显少于氨氧化细菌,各样品间相似性较低,为41%到80%,没有高相似性的聚类;模拟系统中存在连续完整的亚硝化与硝化作用。
蔡小龙林炜铁
关键词:对虾养殖氨氧化菌变性梯度凝胶电泳硝化作用
珠三角养殖水体中参与氮循环的微生物群落结构被引量:10
2012年
【目的】为了研究珠三角地区养殖水体中各种含氮化合物循环转化的特征及其相关功能微生物的群落结构。【方法】构建人工模拟养殖系统,采用15N-稳定性同位素探测技术(stable isotope probing,15N-SIP)标记参与氮素迁移的微生物,通过氯化铯-溴化乙锭密度梯度超高速离心法分离15N标记的DNA,并以此构建含15N-DNA的细菌和古菌16S rRNA基因克隆文库。【结果】15N标记的基因组DNA经过超高速密度梯度离心后成功与14N-DNA分离;对克隆文库序列的分析表明:细菌文库得到的19个可操作分类单元(Operational TaxaUnits,OTUs)分别归为变形菌门(Proteobacteria)和浮霉菌门(Planctomycetes)。变形菌门为绝对优势类群,占整个细菌克隆文库的99.2%,其中优势菌群为丛毛胞菌属(Comamonas)(15.7%)、亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)(12.4%)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)(11.5%)和硝化杆菌属(Nitrobacter)(11.5%);古菌文库得到的9个OTUs归为奇古菌门(Thaumarchaeota)、泉古菌门(Crenarchaeota)和广古菌门(Euryarchaeota)。【结论】将15N-SIP技术应用于珠三角养殖水体氮素循环微生物群落结构的研究中,得到了丰富的氮素循环微生物群落的组成,这些信息为进一步分离纯化氮素降解微生物提供了重要的参考,为营造健康的水产养殖环境提供科学依据。
蔡小龙罗剑飞林炜铁田国梁
关键词:氮素循环
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