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国家自然科学基金(30830016)

作品数:7 被引量:37H指数:3
相关作者:杨光李树珍张盼周旭明万慧荣更多>>
相关机构:南京师范大学中国科学院中国科学院研究生院更多>>
发文基金:国家自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家教育部博士点基金更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 7篇中文期刊文章

领域

  • 7篇生物学

主题

  • 3篇系统发育
  • 2篇英文
  • 2篇进化
  • 1篇原核表达
  • 1篇原核表达载体
  • 1篇中华白海豚
  • 1篇爬行类
  • 1篇染色
  • 1篇染色体
  • 1篇染色体涂染
  • 1篇转座
  • 1篇转座子
  • 1篇系统发育分析
  • 1篇系统发育基因...
  • 1篇系统发育树
  • 1篇系统发育与进...
  • 1篇内含子
  • 1篇鲸类
  • 1篇鲸目
  • 1篇基因

机构

  • 6篇南京师范大学
  • 1篇徐州医学院
  • 1篇中国科学院
  • 1篇河南师范大学
  • 1篇中国科学院研...

作者

  • 5篇杨光
  • 2篇李树珍
  • 2篇张盼
  • 2篇周旭明
  • 1篇陈卓
  • 1篇沈玮
  • 1篇周开亚
  • 1篇陈晓虹
  • 1篇曹祥荣
  • 1篇杨云霞
  • 1篇魏辅文
  • 1篇万慧荣
  • 1篇潘少坤
  • 1篇孙丽君
  • 1篇杨梅
  • 1篇徐士霞
  • 1篇罗红梅
  • 1篇方琳
  • 1篇胡小翠
  • 1篇熊晔

传媒

  • 4篇兽类学报
  • 1篇四川动物
  • 1篇扬州大学学报...
  • 1篇Integr...

年份

  • 1篇2014
  • 1篇2011
  • 1篇2010
  • 4篇2009
7 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
Distribution and conservation of the Indo–Pacific humpback dolphin in China被引量:2
2009年
The Indo–Pacific humpback dolphin(Sousa chinensis Osbeck,1765)is a threatened species inhabiting the waters of China.Despite being of conservation concern,the distribution and abundance of this species has not been comprehensively evaluated.From 1994 to 2008 we performed over 14000 km of line-transect surveys and adminis-tered over 700 questionnaires to collect basic information on the geographic range and likely abundance of Indo–Pacific humpback dolphins along the southern and eastern coasts of China.Through our study we were able to establish a reporting network of stranding and incidental catches for this species.Our quantitative data suggests that only 76 animals remain around Xiamen,39 in the Hepu Nature Reserve and 114 in the estuary of the Dafengjiang River.Qualitative data from local fishing people and government officials suggests that dolphins may exist year-round in waters off Ningde and Shantou.We found that wild populations of Sousa chinensis in this important region are clearly being affected by human disturbance and habitat deterioration,including underwater blasting,vessel collision,fishing,aquaculture and water pollution.Although some protected areas have been established and this species is protected under Chinese law,there remains virtually no protection for this animal.
Bingyao CHENDongmei ZHENGGuang YANGXinrong XUKaiya ZHOU
关键词:CONSERVATION
短散在元件的筛选方法及其在鲸类和爬行类系统发育与进化研究中的应用被引量:1
2014年
短散在元件(short interspersed repetitive elements,SINEs)是广泛分布于真核生物基因组中的一种反转录转座子。近年来越来越多的研究表明SINEs对基因组的结构、功能和进化起着重要作用,是研究物种系统发育和种群生物学的一个良好分子标记。本文简单介绍了SINEs的特征、基本结构、分离和鉴定,以及近年来SINEs标记在系统发育与进化研究中的应用。
陈卓张杰杨光陈晓虹
关键词:反转座子系统发育
基于13个内含子的序列探讨鲸目的系统发育关系(英文)被引量:1
2011年
本文基于实验室筛选得到的13对内含子标记,在鲸偶蹄目的15个物种中进行有效扩增,并重建了这15个物种的系统发育关系。结果表明,抹香鲸总科(Physeteroidea)位于齿鲸亚目(Odontoceti)的基部,从而支持了传统的齿鲸亚目的单系性。在海豚总科(Delphinoidea)内部,贝斯分析结果支持了鼠海豚科(Phocoenidae)和一角鲸科(Monodontidae)的姐妹群关系,而后再与海豚科(Delphinidae)相聚。系统发育分析同时还强烈支持了海豚科的四个属(Sousa,Tursiops,Stenella,Delphinus)组成一个单系的"复合体"。另外,我们的分析结果并不支持瓶鼻海豚属(Tursiops)和原海豚属(Stenella)的单系性。基于松散分子钟的分歧时间估算与以往文献中的结果没有明显差异。这些研究结果提示,核基因内含子序列有希望解决一些长期存在的鲸类系统发育问题。
熊晔周旭明杨梅张盼杨云霞杨光
关键词:鲸目内含子系统发育分析
DNA池结合DHPLC和直接测序技术在江豚SNPs检测中的应用被引量:20
2009年
选取江豚基因组中的2个已知单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,通过PCR扩增,将PCR产物按基因频率不同制备成0~50%的11个DNA池(DNAp001),用于变性高效液相色谱(denaturing high performance liquid chromatography,DHPLC)和直接测序分析,以探讨DNA池中基因频率的最低要求。结果显示,当稀有等位基因的基因频率不少于5%时可在DHPLC检测过程中明显分辨;而利用DNA池进行直接测序时的基因频率则需达到10%。这提示,为保证DHPLC分析的准确性和可靠性,制备DNA池时等摩尔DNA混合的个体数最好不超过10个。DNA池结合DHPLC技术的高效性与准确性可在大规模的SNPs位点筛选中发挥作用。
李树珍万慧荣杨光
关键词:江豚SNPSDHPLC
重组hIL-24原核表达载体的构建及表达被引量:3
2009年
采用基因克隆的方法构建人白细胞介素(hIL-24)基因的原核表达载体pET-28a(+)-hIL24,在大肠杆菌中诱导表达重组蛋白rhIL-24,SDS-PAGE和Western blotting分析蛋白表达,探讨其最佳诱导表达条件。结果表明:hIL-24基因的表达产物分子质量约25 ku,且以包涵体的形式存在于超声裂解后的沉淀中,重组蛋白rhIL-24可特异性被鼠抗人IL-24单克隆抗体识别。当IPTG终浓度为0.5 mmol.L-1、37℃诱导8 h时,其表达量最高。hIL-24基因在该原核表达系统中的成功表达,为其生物学功能的研究奠定了基础。
胡小翠孙丽君潘少坤罗红梅方琳沈玮曹祥荣
关键词:大肠杆菌原核表达载体
中华白海豚3个MHC基因座位遗传变异的初步分析(英文)被引量:6
2009年
主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex,MHC)基因是由一组紧密连锁的基因组成,是哺乳动物免疫系统中最重要的组成部分。本文选择3个MHC基因座位的第二外元,即:MHC-I类基因和II类基因的DRA和DQB座位,初步调查濒危物种中华白海豚的遗传变异。共鉴定了2个DRA、2个DQB和7个MHC-I等位基因。DRA座位遗传变异非常低,而DQB和MHC-I座位具有相对较高水平的遗传变异。并且,在DQB和MHC-I基因座位的假定的抗原结合位点(Antigen binding sites,ABS),非同义替代明显大于同义替代,提示平衡选择(Balancing selection)维持这两个座位的多态性,而在DRA座位上,并没有检测到平衡选择。系统发生分析表明中华白海豚的MHC等位基因没有聚在一起,而是和其他的物种聚在一起,符合MHC跨种进化(Transspecies evolution)的模式。
徐士霞张盼李树珍周开亚魏辅文杨光
关键词:中华白海豚
哺乳动物系统发育基因组学研究进展被引量:4
2010年
哺乳动物是一类最进化并在地球上占主导地位的动物类群,重建其系统发育关系一直是分子系统学的研究热点。随着越来越多物种全基因组测序的完成,在基因组水平上探讨该类动物的系统发育关系与进化成为研究的热点。本文从全基因组序列,稀有基因组变异及染色体涂染等几个方面简要介绍了当前系统发育基因组学在现生哺乳动物分子系统学中的应用,综合已有的研究归纳整理了胎盘亚纲的总目及目间的系统发育关系,给出了胎盘动物19个目的系统发育树。本文还分析了哺乳动物系统发育基因组学目前所面临的主要问题及未来的发展前景。
周旭明杨光
关键词:系统发育基因组学哺乳动物系统发育树染色体涂染
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