宁波市自然科学基金(2012A610207) 作品数:10 被引量:137 H指数:7 相关作者: 郭俊明 肖丙秀 夏天 蒋孝明 邵永富 更多>> 相关机构: 宁波大学 宁波大学医学院附属医院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 宁波市自然科学基金 宁波市科技创新团队项目 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 更多>>
反义长链非编码RNA与基因表达调控 被引量:7 2013年 反义长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类与其它转录物序列互补的内源性lncRNA。它们通过转录抑制、染色质重塑、核内RNA-RNA相互作用和胞浆RNA-RNA相互作用等机制,在转录及转录后水平调控靶基因的表达。反义lncRNA参与了X染色体失活、基因组印记及一些疾病的发生和发展过程,有希望成为疾病治疗的新靶点。 蒋孝明 邵永富 肖丙秀 郭俊明关键词:长链非编码RNA 基因表达 环状RNA:竞争性内源RNA新成员 被引量:9 2013年 环状RNA(circRNA)广泛存在于各种生物细胞中,具有结构稳定、丰度高和组织特异性表达等特征。最近的研究表明,一些circRNA作为竞争性内源RNA(ceRNA)来发挥基因表达调控的作用。circRNA利用其microRNA(miRNA)应答元件结合miRNA,以阻断miRNA对其靶标表达的抑制作用,从而调控其他相关RNA的表达水平。circRNA在基因表达调控中重要作用的发现不仅丰富了人们对ceRNA调控网络的认识,而且提示circRNA在药物开发和疾病诊治中具有良好的应用前景。 夏天 蒋孝明 陈晓敏 邵永富 肖丙秀 郭俊明关键词:MICRORNA 基因表达调控 竞争性内源RNA:一种全新的基因表达调控模式 被引量:9 2012年 竞争性内源RNA(ceRNA)假说是一种全新的基因表达调控模式:mRNA、假基因转录物和长链非编码RNA等转录物通过microRNA应答元件竞争结合相同的microRNA来调控各自的表达水平,从而影响细胞的功能.迄今为止,多家实验室已从生物信息学、细胞生物学和动物实验等层面验证了该假说.本文追溯了ceRNA假说提出的历程,讨论了ceRNA调控网络的影响因素,并提出了一些有待进一步完善的内容.ceRNA假说大大拓展了人类基因组中功能遗传信息的范畴,也为解析一些人类疾病发生的机制提供了新线索. 夏天 肖丙秀 郭俊明关键词:基因表达调控 转录物 核仁小RNA在肿瘤发生中的作用 被引量:2 2012年 核仁小RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)是一类真核细胞核仁中的60~300个核苷酸长度的非编码RNA,主要参与rRNA和其它小RNA转录后的成熟加工过程.它们与肿瘤的关系曾一度被人们所忽视,然而,近年来有关snoRNA新功能的研究证明,它们与肿瘤的发生、发展密切相关.snoRNA以多种方式参与肿瘤的发生:一些snoRNA(如:U50、SNORD12、SNORD12b、SNORD12c、SNORD44和h5sn2等)具有抑癌活性,而另一些snoRNA(如:SNORD33、SNORD66、SNORD76、SNORD112、SNORD113、SNORD114、SNORA42、U70C和ACA59B等)具有促癌活性.另外,编码snoRNA基因的异常也被发现与肿瘤的发生有关.因此,开展snoRNA与肿瘤关系的研究将有可能为肿瘤诊治提供新线索. 肖丙秀 夏天 郭俊明关键词:肿瘤 肿瘤发生 抑癌活性 长链非编码RNA的作用机制及其研究方法 被引量:67 2013年 长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)通过多种机制发挥其生物学功能,这些机制包括基因印记、染色质重塑、细胞周期调控、剪接调控、mRNA降解和翻译调控等。lncRNA通过这些作用机制在不同水平进行基因表达调控。在研究lncRNA功能的过程中,研究方法的建立和应用起着非常重要的作用。目前用于lncRNA研究的主要方法有:微阵列、转录组测序、Northern印迹、实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应、荧光原位杂交、RNA干扰和RNA结合蛋白免疫沉淀等。文章着重介绍了3种前沿方法,即:在线快速预测RNA与蛋白质相互作用的catRAPID、RNA纯化的染色质分离(Chromatin isolation by RNA purification,ChIRP)以及非编码RNA沉默与定位分析技术(Combined knockdown and localization analysis of non-coding RNAs,c-KLAN)。 夏天 肖丙秀 郭俊明关键词:长链非编码RNA 基因表达调控 研究方法 胃肠道肿瘤相关长链非编码RNA研究进展 被引量:1 2015年 长链非编码RNA(long non-coding RNAs,1neRNAs)是一类不参与编码蛋白质,长度超过200个核苷酸的转录产物,具有多种生物学功能。研究发现1neRNAs在胃肠道肿瘤的发生、发展过程中发挥着较为重要的作用,影响肿瘤细胞的增生、血管形成、转移和耐药等。本文在总结胃肠道肿瘤相关1ncRNAs的基础上,重点阐述其与胃肠道肿瘤发生、诊断和治疗的关系。 葛嘉欣 庞倩倩 郭俊明关键词:长链非编码RNA 胃肠道肿瘤 基因表达 竞争性内源RNA与肿瘤发生 被引量:5 2014年 微小RNA(microRNA, miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)等转录物在肿瘤发生发展中发挥着重要作用[1-4],越来越多的研究表明,它们之间存在着复杂的网络关系[5-6]. 蔺新秀 杨蔓 夏天 郭俊明关键词:MICRORNA 肿瘤发生 长链非编码RNA在消化系统肿瘤发生中的作用 被引量:12 2013年 长链非编码RNA(long noncoding RNA,LncRNA)是一类长度大于200核苷酸且不具备蛋白质编码功能的一类RNA分子。近年研究表明,LncRNA与消化系统肿瘤发生的关系非常密切,它们可在表观遗传、转录以及转录后水平广泛参与基因表达调控,影响肿瘤的发生、发展,并且与肿瘤侵袭、转移及患者预后密切相关。深入研究LncRNA与消化系统肿瘤发病的关系有望为消化系统肿瘤的预防和诊治提供新策略。 邵永富 蒋孝明 朱梦颖 杨芳 鲁旭文 郭俊明关键词:长链非编码RNA 消化系统肿瘤 非编码长链RNA与基因表达调控 被引量:17 2012年 近年来,在小鼠全长cDNA文库大规模测序中发现一类新的转录物——非编码长链RNA(long noncoding RNA,lncRNA),引起了科学界的关注.lncRNA长度大于200个核苷酸,无蛋白质编码功能,在真核细胞基因组中被普遍转录.lncRNA种类繁多,数量庞大,占哺乳动物基因组转录物的绝大部分.相对于研究较多的非编码小RNA,lncRNA的功能目前尚不完全清楚.但越来越多的研究发现,lncRNA在多个水平调控基因的表达,在胚胎发育、物种进化、细胞分化和某些疾病如神经退行性疾病及肿瘤的发生过程中起着重要作用.本文在简要介绍lncRNA基本概念的基础上,结合当前研究成果,就lncRNA在转录水平、转录后水平和表观遗传水平调控基因表达的机制作一综述. 史华俊 刘忠 郭俊明关键词:基因表达调控 转录后调控 表观遗传学 环状RNA的生物学功能及其在疾病发生中的作用 被引量:20 2014年 环状RNA(circular RNA,circRNA)主要包括由外显子转录本构成的、经非线性反向剪接形成的内源性RNA分子和内含子来源的环状RNA分子等两类。研究发现,circRNA在人体细胞中广泛表达,在转录后水平具有调控基因表达的重要功能。有些circRNA具有天然微小RNA(microRNA,miRNA)海绵作用,可通过与miRNA结合而抑制其活性,从而调控miRNA靶标发挥作用。circRNA在动脉粥样硬化、神经系统紊乱、糖尿病和肿瘤等疾病发生过程中起着较为重要的作用,深入研究circRNA的结构和功能可使我们更好地了解疾病的发生机制,提高相关疾病的预防和诊断水平。文章就circRNA的形成、功能及其在疾病发生中的作用等做一综述。 李培飞 陈声灿 邵永富 蒋孝明 肖丙秀 郭俊明关键词:基因表达调控