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短小芽孢杆菌表面活性素基因克隆及其抑菌活性研究被引量：2: 2016年; 以短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)DX01菌株为供试对象,以其基因组DNA为模板,通过PCR扩增,成功克隆出表面活性素基因。构建了原核表达载体pET28a-SURF1,在大肠杆菌BL21中进行了IPTG诱导表达,经过柱纯化和聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),证实pET28a-SURF1在大肠杆菌BL21中成功表达。通过玉米小斑病病菌分生孢子萌发试验、对玉米小斑病病和稻瘟病病菌平板抑菌试验,测定了表面活性素融合蛋白对玉米小斑病病菌和稻瘟病两种病菌的抑菌活性。; 程杰杰孙帅欣殷超凡陈云鹏; 关键词：短小芽孢杆菌原核表达抑菌活性

短小芽胞杆菌抑菌蛋白TasA基因克隆及功能分析被引量：7: 2014年; 为了研究短小芽胞杆菌Bacillus pumilus DX01菌株的抑菌相关基因的功能,采用PCR方法从DX01基因组DNA中扩增出编码TasA基因的全长DNA序列,并构建原核表达载体pET2-TasA,在大肠杆菌Escherichia coli BL21中表达获得TasA基因的融合表达蛋白,分别利用悬滴法和平板打饼法检测融合蛋白对玉米小斑病菌(Bipolaris maydis)分生孢子萌发和对玉米小斑病菌及水稻稻瘟病菌菌丝体生长的抑制活性,结果表明TasA融合蛋白对这2种植物病原真菌的生长有着显著的抑制作用。TasA基因包含1个780bp的完整开放阅读框(GenBank:KC692521),编码259个氨基酸残基;该序列与B.subtilis菌株PEBS2501(GenBank::FJ713581)、B.amyloliquefaciens HF-01(GenBank:JF781312)和B.subtilis菌株BWST7003(GenBank:AP012496)同源抑菌蛋白基因序列相似性达99%。原核表达产物经SDS-PAGE分析检测到约32.3kDa的融合蛋白;经Ni-NTA柱纯化后的融合蛋白对供试病原菌均有显著的抑制作用。经测定发酵液的TasA融合蛋白产率为28μg/mL,短小芽胞杆菌抑菌蛋白TasA基因具有良好的抑菌效果。; 刘通陈云鹏李琼洁顾振芳; 关键词：抑菌蛋白抑菌活性

短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)DX01转座突变株的构建及转化体系的优化被引量：5: 2011年; Tn5转座子及其衍生载体被广泛应用于革兰氏阴性菌的基因功能研究,但尚未见有利用Tn5转座子导入革兰氏阳性菌短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)DX01菌株的报道。本研究通过构建Tn5转座载体,对短小芽孢杆菌DX01菌株进行了Tn5转座插入诱变,获得了大量的突变株。同时,考察了感受态细胞培养浓度、电击电压、电击缓冲液及复苏培养基的选择等对DX01电转化效果的影响,建立了实验条件下的最佳电转条件。从1 109个转化子中随机抽取20个继代培养15代后,进行了稳定性分析;对转化子的PCR及Southern blot分析证实Tn5已随机插入到DX01基因组中。; 胡晓璐沈新迁傅科鹤顾振芳陈云鹏; 关键词：短小芽孢杆菌突变电击转化

短小芽胞杆菌DX01菌株Tn5转座突变株的抑菌活性筛选体系的建立被引量：5: 2012年; 为建立短小芽胞杆菌Bacillus pumilus DX01菌株的Tn5转座突变株抑菌活性的高效筛选体系,采用发酵液平板抑菌法研究了各突变株发酵液对稻瘟病菌Magnaporthe grisea生长的影响,并测定了目标突变株的几丁质酶和蛋白酶活性及发酵液对稻瘟病菌分生孢子萌发的抑制率。从2 633个突变株中筛选出6个抑菌活性较对照菌株DX01显著变化的突变株。对照DX01发酵液对真菌孢子萌发的抑制率为36%,而突变株Tn5-901和Tn5-194则分别为96%和3%,抑菌活性与对照的差异达到极显著水平。其余4个突变株的几丁质酶、蛋白酶活性多重比较结果与发酵液平板抑菌结果并不完全一致,但发酵液平板抑菌法简单、高效,适用于短小芽胞杆菌突变株的抑菌活性初筛。; 胡晓璐陈云鹏沈新迁刘通顾振芳; 关键词：抑菌活性

短小芽孢杆菌转座突变株的GFP标记及在水稻上的定殖被引量：8: 2012年; 【目的】研究GFP标记的短小芽孢杆菌在水稻植株上的定殖规律,为其生物防治应用提供科学依据。【方法】从短小芽孢杆菌GFP标记的转座突变株库中筛选强表达GFP且遗传稳定的突变株,用作水稻植株的定殖示踪。【结果】采用荧光酶标仪、流式细胞术检测及荧光显微镜观察等手段,对1 467株Tn5-egfp随机插入突变株的GFP表达作了定量和定性分析,最终获得8株荧光表达较强的突变株,并对突变株作了T-DNA插入拷贝数鉴定。在开放和封闭系统中,标记菌在水稻幼苗根际土壤中均可以存活15 d以上,且前者标记菌的数量下降相对更慢。【结论】短小芽孢杆菌在根毛区及侧根分生处的数量最多,并在根表面形成菌膜。该菌可通过水稻幼苗根部的伤口或幼嫩根毛等部位侵入根系,主要分布在皮层细胞及其间隙,在植物的维管束内亦可观察到荧光标记菌。研究结果表明该菌在水稻幼苗根际土壤中有着良好的定殖能力。; 沈新迁刘通胡晓璐顾振芳陈云鹏; 关键词：水稻短小芽孢杆菌绿色荧光蛋白定殖

GFP标记的短小芽胞杆菌(Bacillus pumilus)转座突变株的构建初探被引量：5: 2012年; 以水稻叶面附生菌短小芽孢杆菌(B.pumilus)为研究对象,通过构建pMOD-egfp-Tetr转座复合体,采用电击转化法对短小芽孢杆菌DX01菌株进行了Tn5转座插入诱变,获得了大量的转化子。对转化子进行了遗传稳定性分析和分子鉴定,并且在荧光显微镜下观察到了强烈的绿色荧光,研究结果表明外源DNA已经成功整合进细菌的基因组中,gfp基因在短小芽孢杆菌中实现了组成型表达。; 沈新迁胡晓璐刘通孙文良陈云鹏; 关键词：电击转化绿色荧光蛋白

短小芽胞杆菌抑菌相关基因的高效克隆被引量：3: 2014年; 为有效挖掘生防短小芽胞杆菌Bacillus pumilus的抑菌相关基因,对DX01菌株进行了Solexa基因组扫描,并选取其中2个代表性基因TasA和Surf2,以DX01基因组DNA为模板,采用PCR方法对其进行克隆、序列比对及系统进化分析。结果表明,DX01菌株共得到4267个基因,有3145个具有明确生物学功能的蛋白。其中,与短小芽胞杆菌抑菌活性相关的基因(簇)有84个,包括2个细菌防御酶基因、2个细菌生物膜形成相关基因、1个信号转导基因、27个细胞壁降解或水解酶基因、15个抗生素合成或转运基因、4个抑菌蛋白基因、1个次生代谢物合成基因簇及32个细菌鞭毛生物合成与调控相关基因。TasA基因在芽胞杆菌属细菌中具有高度的保守性,各同源基因的序列相似性在92%以上;而Surf2基因的同源基因在该属细菌中具有一定的变异性,有的序列相似性低至73%。; 刘通陈云鹏李琼洁顾振芳

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国家自然科学基金(31071721)