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中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2007Z01): 作品数：7 被引量：41H指数：4; 相关作者：马凌波马春艳张凤英乔振国蒋科技更多>>; 相关机构：中国水产科学研究院东海水产研究所华东师范大学上海海洋大学更多>>; 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家科技基础条件平台建设计划国家科技支撑计划更多>>; 相关领域：生物学农业科学天文地球更多>>

单个拟穴青蟹核内多拷贝线粒体COI假基因序列的研究(简报): 2008年; 线粒体DNA（mtDNA）因它的高拷贝数、易扩增、高突变率、中性、低重组和母系遗传等特征．已广泛应用在系统进化和群体遗传研究方面。但是．由于mtDNA本身的特征，如异质性，父系遗传泄漏和非中性以及核线粒体假基因（nuclear mitochondrial pseudogenes，Numts）的存在，可能限制mtDNA的应用。Numts是位于核DNA中与mtDNA具有高度相似性的序列,是线粒体基因向核基因组转移造成的,从低等的真菌和无脊椎动物到高等的脊椎动物和植物都发现有Numts的存在。; 张凤英马凌波乔振国陈立侨; 关键词：拟穴青蟹 COI基因

青蟹种苗规模化生产和种质资源研究: 围绕青蟹种苗生产涉及的饵料生物培养、种蟹培育、蚤状幼体至大眼幼体培育和大眼幼体至4、5期幼蟹中间培育等关键技术,通过对温度、盐度、光照、底质、遮蔽物、换水量、干露、培育密度等影响因子的研究,初步建立了青蟹规模化种苗生产工...; 马凌波乔振国张凤英马春艳; 文献传递

浙江三门湾日本蟳群体线粒体16Sr RNA基因序列多态性被引量：6: 2009年; 采用聚合酶链式反应（PCR）技术对浙江三门野生日本蟳20个个体的mtDNA 16SrRNA基因进行扩增,PCR产物经纯化后进行测序,得到495 bp的核苷酸序列片段。测序结果经比对校正后,获得三群体16SrRNA基因一致序列,片断长为495 bp,其中变异位点15个,简约位点11个,总变异为3.03%。在测得的495 bp目的DNA片段中,碱基T、C、A、G平均组成分别为35.2%、17.9%、35.3%和11.6%,其A＋T含量（70.5%）远高于G＋C含量（29.5%）。在20个个体中共检测到7个单倍型,单倍型多样性为0.642,核苷酸多样性为0.448%。根据Kimura遗传距离的计算结果,各单倍型之间的遗传距离为0.2%-2.68%。16SrRNA构建的NJ系统发育树表明,梭子蟹属的远洋梭子蟹和青蟹属的拟穴青蟹亲缘关系较近,与蟳属的日本蟳亲缘关系较远,与形态和RAPD研究结果一致。; 马春艳马凌波沈盎绿徐兆礼张永赵云龙; 关键词：日本蟳线粒体

凡纳滨对虾引进群体和养殖群体的PCR-RFLP分析被引量：3: 2010年; 采用PCR—RFLP方法，对2008年引进的SPF凡纳滨对虾群体（G0）与2006年引进亲虾繁育的两代群体（G1、C2）的遗传结构进行了分析。使用AluI、raqI、MboI、印eI、s妒I共5种限制性内切酶对线粒体DNA控制区进行单酶切分析，酶切得到的单倍型在2—4个之间，三个群体的复合单倍型类型分别有3个、7个和9个，没有为三个群体所共有的复合单倍型，复合单倍型的分布显示群体间差异显著。三个群体（G0、G1、G2）的核苷酸多样度7r值逐渐增加，分别为0．0333、0．1286、0．1349，复合单倍型多样度h分别为0．6222、0．8500、0．8470，说明养殖群体的遗传多样性大于引进群体。聚类分析的结果表明随着养殖世代的增加，养殖群体与引进群体的差异呈增大的趋势。由此推测G0与G1的亲本存在较大的遗传差异，并且在使用引进群体作为亲本的育种过程中可能出现了种质混杂。; 杨柯马春艳马凌波胡卫国顾德平; 关键词：凡纳滨对虾养殖群体线粒体DNA控制区

拟穴青蟹vasa基因cDNA的特征分析与性腺特异表达被引量：7: 2010年; vasa蛋白属于DEAD家族蛋白,是一种RNA解旋酶,在生殖细胞的分化中具有重要作用。本研究从拟穴青蟹卵巢中克隆得到vasa基因cDNA全长(将其命名为Sp-vasa),Sp-vasa序列长度为2 944 bp,其中开放阅读框(ORF)长度为1 899 bp,编码632个氨基酸,具有DEAD-box家族蛋白的7个高度保守的结构域。半定量RT-PCR结果显示,Sp-vasa只在卵巢和精巢中特异表达,在其它组织则未检测到表达。由此可见,vasa属于拟穴青蟹性腺特异表达基因。因此,Sp-vasa基因可有望作为有效的分子指标研究拟穴青蟹原始生殖细胞的起源、迁移以及生殖腺的发生。; 张凤英马凌波蒋科技张丹陈立侨; 关键词：拟穴青蟹 VASA 克隆性腺

基于线粒体DNA三种基因序列探讨青蟹属的系统发育关系被引量：3: 2010年; 青蟹属(Scylla)分为4个种的观点得到了大多数学者的支持,但由于分析方法和采用序列的差异,种间系统发育关系仍然没有解决。本文对青蟹属4种24个体的线粒体12S rRNA、16S rRNA和COI基因部分序列进行了测定。对3种序列拼接后,根据不同进化速率采用分组策略,分别以贝叶氏法和最大似然法构建青蟹属的系统进化树并与Neighbor Joining(NJ)树进行比较。结果显示,3种进化树都获得完全一致的拓扑结构,其中贝叶氏法和最大似然法都强烈支持拟穴青蟹S.paramamosain与紫螯青蟹S.tranquebarica是姐妹种(自举值为95%,贝叶氏法后验概率为1.0)。锯缘青蟹S.serrata分化早于拟穴青蟹和紫螯青蟹,为它们的姐妹种(自举值等于60%,贝叶氏法后验概率等于0.95);榄绿青蟹S.olivacea是4种青蟹中最早分化出来的种类。本文明确了青蟹属物种间系统发育关系,为澄清我国青蟹的分类地位进一步提供了分子依据。; 马凌波马春艳张凤英蒋科技; 关键词：线粒体DNA 系统发育

Isolation of Polymorphic Microsatellite Markers in Scylla Paramamosain by 5'Anchored PCR Technique: The mud crab Scylla paramamosain plays a significant role in fishery resources inChina. In this study, we deve...; CUI Haiyu1,2, MA Hongyu1, MA Lingbo1,MA Chunyan1, MA Qunqun1,2 (1. Key Lab of Marine and Estuarine Fisheries Resources and Ecology, Ministry of Agriculture, East China Sea Fisheries Research Institute, ChineseAcademy of Fishery Sciences, Shanghai 200090, China; 关键词：POLYMORPHISM; 文献传递

拟穴青蟹线粒体COI基因序列克隆及SNPs位点分析被引量：5: 2011年; 根据拟穴青蟹(Scylla paramamosain)线粒体全序列设计引物,采用PCR产物双向测序法,克隆了线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因部分序列(761 bp),并筛选、分析了拟穴青蟹的SNPs位点。共分析了采自福建省宁德市的16只拟穴青蟹,另外,从GenBank数据库中下载了31条前人提交的拟穴青蟹COI基因序列(长度在425-522 bp之间)。利用MEGA4.0软件对所有序列进行比对分析,结果表明碱基T、C、A和G的平均含量分别为37.6%、17.8%、28.9%和15.7%,G+C的含量平均为33.5%。分析结果表明,在所克隆的761 bp的COI基因序列中共发现29个SNPs位点,其出现频率为3.8%。在这29个SNPs位点中,13个为C/T转换(占44.8%),12个为A/G转换(占41.4%),2个为A/T颠换(占6.90%),1个为G/C颠换(占3.45%),另有一个位点(201 bp处)发生了A/C颠换和C/T转换两种类型的碱基替换。氨基酸分析表明,在29个SNPs位点中,有9个位点属于非同义突变,引起了氨基酸的变化;其他20个位点属于同义突变,未引起氨基酸的变化。这将为拟穴青蟹遗传背景和群体遗传多样性研究提供新的分子标记。; 马群群马洪雨马春艳崔海玉马凌波; 关键词：拟穴青蟹 COI基因 SNPS 聚合酶链式反应

Species Discrimination of Four Crabs (Genus Scylla) by Mitochondrial COI Gene: The genus Scylla, recently divided into four separate species: S. paramamosain, S. serrata, S.tranquebarica an...; MA Hongyu, MA Chunyan, MA Lingbo , ZHANG Fengying (Key Lab of Marine and Estuarine Fisheries Resources and Ecology, Ministry of Agriculture, East China Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Shanghai 200090, China); 关键词：MTDNA COI; 文献传递

拟穴青蟹线粒体COI基因序列克隆及SNPs位点筛选: 本研究根据拟穴青蟹(Scylla paramamosain)线粒体全序列设计引物,采用PCR产物双向测序法,克隆了线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因部分序列(765bp),并筛选、分析了拟穴青蟹的SNPs位点。共...; 马群群马洪雨马凌波马春艳崔海玉; 关键词：拟穴青蟹 COI基因 SNPS 聚合酶链式反应; 文献传递

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