国家自然科学基金(30572278)
- 作品数：4 被引量：12H指数：2
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- 相关机构：军事医学科学院病原微生物生物安全国家重点实验室西北农林科技大学更多>>
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- 相关领域：生物学医药卫生理学农业科学更多>>
- 大肠杆菌O157:H7 sRNA基因E40缺失突变株的构建
- 2010年
- 目的:利用Red系统构建肠出血性大肠杆菌O157:H7的sRNA基因E40缺失突变株。方法:选取本实验室预测并经过实验验证的sRNA基因,根据NCBI上相应的序列,设计2对引物分别扩增该sRNA基因的上下游分别长464和455bp的同源臂,经PCR扩增,构建到相应的载体,最后以构建好的含上下游同源臂和卡那霉素抗性基因的长约2500bp的线性片段作为打靶片段,在Red重组系统的作用下与sRNA基因E40的上下游同源区域发生同组,从而把sRNA基因从基因组上置换下来,之后利用质粒pCP20将FRT位点间的卡那霉素抗性基因消除。结果与结论:构建了出血性大肠杆菌O157:H7的sRNA基因E40的缺失突变株,为进一步研究sRNA基因在出血性大肠杆菌O157:H7生长及致病过程中所起的功能奠定了良好的基础。
- 王刚王刚宋兰马延周围张德礼岳俊杰
- 关键词：肠出血性大肠杆菌O157:H7SRNARED重组系统
- 幽门螺杆菌Lpp20蛋白的生物信息学分析被引量：5
- 2009年
- 目的:分析幽门螺杆菌Lpp20蛋白的主要化学和免疫学分子特征,为基因工程疫苗和诊断抗原的研究奠定基础。方法:根据Lpp20蛋白的氨基酸序列,应用生物信息学工具分析其蛋白序列,预测其信号肽、跨膜区、疏水性、二级结构、三级结构等性质。结果:Lpp20蛋白具有一段信号肽、脂蛋白信号肽酶切位点及脂盒模体,没有跨膜区,可能是一个外周膜蛋白;Lpp20蛋白的二级结构以α螺旋为主,其三级结构为一个致密的球状。结论:为基于幽门螺杆菌Lpp20蛋白的疫苗开发打下了基础。
- 岳俊杰李北平周围高原王月兰梁龙
- 关键词：幽门螺杆菌生物信息学
- 幽门螺杆菌TNF-α诱导蛋白的生物信息学分析被引量：6
- 2009年
- 肿瘤坏死因子诱导蛋白Tipα是幽门螺杆菌特有的一个膜相关蛋白。它可以激活核因子κB,并诱导多种细胞因子和趋化因子的表达,导致胃炎和随后的肿瘤发生。它是幽门螺杆菌和胃癌发生之间的关键分子。本文利用生物信息学工具分析Tipα序列,预测其信号肽、跨膜区、疏水性、二级结构、三级结构等性质。结果:Tipα具有一段信号肽、脂蛋白信号肽酶切位点及脂盒模体。另外该蛋白没有跨膜区,可能是一个外周膜蛋白。Tipα的三级结构说明,该蛋白形成了一个致密的球状结构,Tipα的二级结构以α螺旋为主。
- 岳俊杰谭明峰李北平牛超周围王月兰梁龙
- 关键词：肿瘤坏死因子-Α诱导蛋白生物信息学
- 细菌黏附素序列模体分析被引量：1
- 2008年
- 目的:认识细菌黏附素序列保守的特征,更好地理解细菌黏附的机理。方法:利用InterProScan、MEME等分析工具对实验确认的155条细菌黏附素序列进行模体搜索。结果:用InterProScan在155个黏附素序列中搜索到119个模体,通过MEME分析发现了50个模体。结论:发现了一些与黏附功能相关的模体,为在细菌基因组内搜索黏附素序列奠定了基础。
- 岳俊杰谭明峰周围王夏李北平王月兰梁龙
- 关键词：黏附素细菌
