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新疆泥火山中度嗜盐菌WS1的16S rDNA分析被引量：4: 2010年; [目的]了解在新疆泥火山群这一特殊生境条件下一株中度嗜盐菌种属关系。[方法]从新疆泥火山分离得到中度嗜盐菌WS1,测定其生理生化指标,并采用真细菌16SrDNA通用引物PCR扩增WS1菌株的16SrDNA,将得到的片段在NCBI Genbank数据库中通过Blast软件对其进行同源性检索,使用PHYLIP3.65软件构建系统发育树。[结果]该菌能够在浓度0～15%NaCl的条件下生长;PCR扩增得到的片段长度为1 423 bp;同源性比对表明,该菌株与多种涅斯捷连科氏菌的16S rDNA序列同源性高达99%;系统发育树显示WS1菌株与涅斯捷连科氏菌的亲缘关系最近。[结论]结合生理生化指标,初步确定WS1菌株可能是耐盐涅斯捷连科氏菌属的一个亚种。; 李建辉路盼盼张亚平; 关键词：泥火山 RDNA 同源性分析

新疆泥火山群土壤细菌群落的DGGE分析被引量：1: 2010年; 采用变性梯度凝胶电泳(DGGE)指纹图谱技术,对新疆乌苏泥火山区土壤细菌群落的16S rDNA V3区进行电泳分离,并用Quantity one软件对图谱进行聚类分析,对主要条带进行回收测序.DGGE图谱显示,各土样细菌的组成有显著差异.聚类分析表明,相同月份、不同深度土样细菌组成相近.特异条带的回收测序结果表明,假单胞菌属是泥火山土壤优势菌群.新疆泥火山区土壤细菌多态性明显,并容易受生态、气候等因素影响,但优势菌群受此影响较小.; 李建辉路盼盼张亚平; 关键词：泥火山 RDNA

新疆泥火山群土壤真菌群落的DGGE分析被引量：1: 2014年; 采用DGGE指纹图谱技术对新疆乌苏的泥火山区的土壤真菌群落18SrDNA进行电泳分离,通过Quantity one软件对图谱进行聚类分析,并对主要条带进行回收测序。DGGE图谱聚类分析显示,五月份表层土真菌的种类和数量丰富。群落结构在相同季节垂直分布上相似性较高,聚集到一个分支上;而不同季节土样真菌组成差异较大。特异条带的回收测序结果表明,泥火山真菌优势菌群为链格孢属真菌和多枝横梗霉属。新疆泥火山土壤真菌的多样性较高但数量偏少,受气候环境因素的影响较大,优势菌群受此影响较小。; 张亚平曹小妮路盼盼余鹏李建辉; 关键词：泥火山 DGGE

新疆泥火山土壤宏基因组DNA的提取方法研究被引量：1: 2010年; [目的]寻找一种有效的泥火山土壤宏基因组DNA的提取方法。[方法]分别采用CTAB法、SDS加酶法、实验室改进法、试剂盒法提取泥火山土壤宏基因组,比较4种方法的提取效果。[结果]试剂盒法的提取效率最高、纯度最好;实验室改进法次之;SDS加酶法提取量最多。实验室改进法获得的DNA稀释10倍可直接用于PCR扩增。[结论]从经济和DNA质量的角度考虑,实验室改进法可作为新疆泥火山土壤宏基因组DNA提取最有效的方法。; 李建辉路盼盼张亚平; 关键词：泥火山

新疆玛纳斯水库周边湿地土壤中放线菌群落结构的多样性分析被引量：2: 2015年; 为了解新疆玛纳斯小海子水库周边典型湿地的放线菌的群落结构及遗传的多样性,本研究采用变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gelelectrophoresis,DGGE)技术对玛纳斯湿地土壤中放线菌群落的16S r DNA V3区进行电泳分离,并用Quantity one软件对图谱进行分析,对主要条带进行回收测序及序列比对并构建系统发育树。DGGE图谱显示,植物丰富度不同的区域中土壤放线菌的多样性指数(H)、丰富度(S)和均匀度(EH)有显著的差异(P<0.5),放线菌的多样性指数、丰度均为:沼泽土>草甸土>盐碱土。特异性条带回收测序结果表明,链霉菌属属于该区域放线菌中的最优菌群。; 王晓亮冯丽孙燕飞吴梦纤章芳张亚平; 关键词：DGGE RDNA 放线菌

新疆泥火山不同生境土壤微生物数量、酶活性与理化因子的关系被引量：2: 2016年; 为了揭示新疆泥火山不同生境土壤微生物数量与土壤酶活性、理化因子之间的关系,以新疆泥火山区域山地荒漠带、草原带、泥火山口、灌木带4种不同生境为研究对象,用稀释平板法对该区域的细菌、放线菌、真菌进行分离计数,研究土壤的微生物数量、酶活、理化性质,并对其进行方差分析、简单相关分析和主成分分析。结果表明:泥火山不同生境土壤微生物数量具有显著差异,且细菌数量>放线菌数量>真菌数量;土壤微生物数量在不同生境表现为:草原带>山地荒漠带>灌木带>泥火山口;真菌数量与土壤含水量、有机质含量、全氮含量呈极显著正相关,细菌、放线菌数量与有机质含量、全氮含量呈显著正相关;土壤细菌、放线菌数量与土壤转化酶活性呈显著或极显著正相关,与磷酸酶活性呈显著负相关;主成分分析结果显示,有机质含量、全氮含量、全磷含量、含水量、磷酸酶活性、转化酶活性等可以作为影响该区域土壤养分组成的重要因子。由结果可知,新疆泥火山不同生境土壤微生物数量分布均存在显著差异,并与土壤环境因子呈正相关或负相关,可以较好地反映泥火山区域土壤养分的组成情况。; 杨娟张亚平郝志成; 关键词：泥火山不同生境土壤微生物数量土壤酶活性

基于MiSeq测序分析新疆泥火山土壤细菌群落多样性被引量：9: 2016年; 【目的】以新疆乌苏泥火山土壤为研究对象,了解泥火山细菌群落结构及其时空动态变化。【方法】选择泥火山4种不同生境土壤在4、7、11月份采样,应用Illumina Mi Seq测序技术测定泥火山土壤细菌的16S r RNA基因V3–V4变异区序列,分析乌苏泥火山不同生境土壤细菌群落组成。【结果】泥火山土壤细菌在97%的相似水平下共得到OTU个数为29 005,在细菌门水平上共有38种细菌类群,Proteobacteria、Actinobacteria、Bacteroidetes为优势菌群,在属水平上共有72种细菌类群,其中含量最高的是未分类细菌;多样性分析表明生境D的丰度指数和多样性指数最高,将泥火山细菌群落多样性与理化因子结合分析,发现其多样性随着土壤养分的增加而基本降低,说明物种多样性指数与理化因子之间呈负相关关系;OTU水平的分析表明生境A的群落组成在时空动态上没有显著差异,其样品群落组成较为相似,而生境C的物种组成差异较大。【结论】相比较于传统方法,Mi Seq测序能够更全面解析环境样品中微生物多样性,揭示了乌苏泥火山群蕴含着丰富的微生物资源,这将为深入研究泥火山生态系统奠定基础,为合理利用和开发泥火山微生物资源提供指导。; 杨娟郝志成张亚平; 关键词：泥火山优势菌群细菌群落

新疆玛纳斯湿地土壤细菌生理类群数量变化及其与土壤环境的相关分析被引量：2: 2015年; 本研究采用菌落稀释平板法和MPN-Griess法结合Pearson相关分析法，选取玛纳斯湿地6种不同植被（高山蒿草、草甸、芦苇、沼泽、灌木、柽柳湿地）群落生长的湿地土壤作为样地，对各样地的土壤微生物生理类群数量的季节动态及其与土壤环境因子进行相关分析。结果发现，土壤微生物生理类群的数量从大到小依次为氨化细菌〉反硝化细菌〉固氮菌〉亚硝酸细菌〉硝酸细菌。土壤微生物生理类群随季节动态变化总体趋势为：亚硝酸细菌与硝酸细菌数量为5月〉9月〉7月〉11月，氨化细菌和固氮菌的数量为9月〉7月〉5月〉11月，反硝化细菌数量为5月〉7月〉9月〉11月。从土层垂直分布来看，土壤微生物生理类群数量0—10cm土层大于10-20cm土层。各细菌生理类群与不同的土壤环境因子呈不同显著水平的正相关或负相关。以上结果表明玛纳斯湿地不同植被类型和不同土层中细菌生理类群数量的分布均存在显著差异，且与土壤环境因子呈正相关或负相关。; 章芳吴梦纤王晓亮张亚平杨娟郝志成; 关键词：湿地土壤环境

基于形态特征和ITS序列对新疆博乐蘑菇的分类鉴定被引量：2: 2009年; 在新疆博乐90团,20～40 cm地下采得一株伞菌(BL)。首先采用形态学分类法对其进行了宏观和微观的描述,根据生境和形态学特征与大型真菌图鉴对照找到两种相似菌株Agaricus bisporus(双胞蘑菇),Agaricus gennadii(圆孢蘑菇)。然后对该伞菌进行了菌丝体培养,获得了两株生长势不同的菌丝。为了进一步确定分类学地位,采用PCR技术,以rDNA-ITS为分子指标,对子实体和菌丝进行了ITS序列测定与分析。结果表明:生长势强的菌丝(J1)为实验室污染菌,生长势弱的菌丝(J2)为BL的纯菌丝。系统进化树显示BL归为Agaricus bitorquis(双环蘑菇)较为合理。; 刘伟李建辉张亚平

一株动性杆菌的生理学特性研究及其鉴定被引量：1: 2010年; 从新疆泥火山样品中分离得到1株细菌ljh-5,经过16SrDNA分子鉴定,该菌株与动性杆菌属(Planomicrobium)的相似度最高为90%,结合菌株、菌落特征及其生理生化特性,初步鉴定该菌为动性杆菌属新种。并对该菌株生长特性进行研究。; 李建辉路盼盼张亚平; 关键词：泥火山生理生化

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