您的位置: 专家智库 > >

上海市自然科学基金(04ZR14049)

作品数:5 被引量:40H指数:3
相关作者:贺佳吴骋贺宪民柳伟伟虞慧婷更多>>
相关机构:第二军医大学复旦大学更多>>
发文基金:上海市自然科学基金国家自然科学基金更多>>
相关领域:医药卫生生物学理学更多>>

文献类型

  • 5篇中文期刊文章

领域

  • 2篇生物学
  • 2篇医药卫生
  • 1篇理学

主题

  • 2篇微阵列
  • 2篇基因
  • 2篇基因表达
  • 2篇基因表达数据
  • 2篇肝癌
  • 2篇贝叶斯
  • 2篇SVMS
  • 1篇调控网络
  • 1篇预后
  • 1篇预后影响
  • 1篇预后影响因素
  • 1篇原发性
  • 1篇原发性肝癌
  • 1篇支持向量
  • 1篇支持向量机
  • 1篇数据分析
  • 1篇数据挖掘
  • 1篇网络
  • 1篇微阵列技术
  • 1篇向量

机构

  • 5篇第二军医大学
  • 1篇复旦大学

作者

  • 5篇吴骋
  • 5篇贺佳
  • 2篇虞慧婷
  • 2篇王志勇
  • 2篇贺宪民
  • 2篇柳伟伟
  • 1篇付旭平
  • 1篇马修强
  • 1篇武建虎
  • 1篇张智坚

传媒

  • 3篇中国卫生统计
  • 1篇第二军医大学...
  • 1篇数理统计与管...

年份

  • 1篇2008
  • 3篇2006
  • 1篇2005
5 条 记 录,以下是 1-5
排序方式:
SVMs在微阵列表达数据分析中的应用被引量:1
2005年
微阵列技术允许同时录制成百万的基因表达水平。但由于经费和工艺的限制,目前研究者获得的表达数据集往往包含少量的样本,而基因表达的测量值却有上万条。很多传统的统计方法无法分析这样的数据,本文结合数据挖掘中统计学习理论的相关知识,详细介绍了一种有监督分析方法———支持向量机(SVMs)在微阵列表达数据分析中的应用。
吴骋王志勇贺佳贺宪民
关键词:微阵列基因表达数据支持向量机
关联规则及其在肝癌病人资料分析中的应用被引量:20
2006年
目的探讨关联规则方法在肝癌病人资料分析中的应用研究。方法采用基于列联表的χ2检验和可信度提高的规则剪除方法,通过设置最小支持度和最小可信度对肝癌资料进行关联规则分析。结果设置最小支持度和最小可信度分别为0·10和0·60,样本例数1457例,所得结果根据列联系数C>0·45获得51条规则,作用度lift>2·4得到19条规则;考虑规则后件为肝癌是否复发得到19条规则。这些规则揭示了影响肝癌复发的变量值及变量值的组合,并且反映了数据中高度相关的变量值间的关系。结论在肝癌病人资料中应用关联规则分析可以揭示多因素间潜在的、有价值的关系。
武建虎贺佳贺宪民张智坚马修强吴骋
关键词:肝癌关联规则数据挖掘
基于贝叶斯网络的原发性肝癌预后影响因素相互关系研究被引量:4
2008年
目的运用贝叶斯网络(Bayesian network,BNT)分析肝癌病人资料,探索肝癌预后影响因素间的相互关系。方法依据最小描述长度(Mini mal Description Length,MDL)准则学习网络结构,对完整数据运用极大似然估计(Maxi mumlikelihood esti mation,MLE)获得网络参数,对含有缺失值的数据运用期望最大化(Expectation Maxi mization,EM)算法进行参数学习,并与完整数据的MLE估计进行比较,衡量BNT学习含有缺失值数据的能力。结果通过对含有1441个样本的肝癌资料的学习,构建了一个含有49个结点,62条有向边的BNT模型,并获得各结点参数。网络中的有向边反映肝癌预后影响因素之间的相互作用或影响,网络参数反映其强度。分析了直接影响肝癌预后和分期的指标,并依据网络参数,判断肝癌分期及预后情况。结论BNT模型具有较强的处理缺失数据的能力,应用BNT分析肝癌病人资料,揭示了影响肝癌预后的多因素间,多层次的多重因果关系,并从概率角度定量描述各因素间的影响强度。
虞慧婷吴骋柳伟伟贺佳
关键词:原发性肝癌贝叶斯网络
SVMs在基因表达谱数据分析中的应用被引量:2
2006年
吴骋王志勇贺佳
关键词:基因表达谱数据分析基因表达水平基因表达数据微阵列技术
基因调控网络模型构建方法被引量:13
2006年
基因调控网络的研究从基因之间相互作用的角度揭示复杂的生命现象,是功能基因组学研究的重要内容,也是当前生物信息学研究的前沿。基因芯片技术在生物信息学中的应用为基因调控网络的研究提供大量可供研究与分析的基础数据。本文介绍了基因调控网络的起源与近年来的发展情况,详细说明了基因调控网络构建的前提与基本原理,并分析几种经典调控网络模型:布尔网络模型、线性及非线性模型和贝叶斯网络模型,阐述各种模型构建的基本原理和算法,结合基因芯片的数据特点,探讨各种模型的优缺点及其适用情况,对各种网络模型进行分析与总结。
虞慧婷吴骋柳伟伟付旭平贺佳
关键词:基因调控网络非线性模型贝叶斯模型
共1页<1>
聚类工具0