国家科技重大专项(2006BDA01A09)
- 作品数：22 被引量：72H指数：4
- 相关作者：陈国宏徐琪张海波赵文明张依裕更多>>
- 相关机构：扬州大学贵州大学常州市立华畜禽有限公司更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家科技支撑计划国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学理学更多>>
- 浙东白鹅和四季鹅GH基因外显子多态性分析被引量：3
- 2009年
- 以浙东白鹅和四季鹅为试验材料,采用PCR-SSCP技术,对鹅GH基因5个外显子序列进行多态性分析。结果表明:鹅GH基因外显子2和4发现了4个SNP多态位点,分别为外显子2的C39T、C74T突变和外显子4的T291C、G297A突变,其中C74T突变为错义突变,其他3个均为同义突变。在GH基因外显子2SNP位点上,浙东白鹅和四季鹅分别以等位基因D和A为优势等位基因;在外显子4SNP位点上,2个鹅群体均以等位基因A为优势等位基因。在外显子2和4多态位点上,浙东白鹅和四季鹅均处于Hardy-Weinberg平衡。
- 朱洪生陈清吴信生赵文明程金花樊月钢陈国宏
- 关键词：GH基因单核苷酸多态性
- 鸭脂蛋白脂酶基因内含子5多态性及其与肉质和脂肪性状的关联分析被引量：3
- 2009年
- 根据鸡脂蛋白脂酶(LPL)基因序列设计引物对樱桃谷鸭和苏牧麻鸭LPL基因内含子5进行PCR-SSCP检测,并分析其多态对肉质和脂肪性状的遗传效应。结果表明,检测到3种基因型:AA、AB和BB,1个双碱基突变:243～244bp(TA→AT),2个SNP:G265A和G269A;该座位在2个群体中均为中度多态,并偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),基因型分布差异显著(P<0.05);在樱桃谷鸭群体中,AB型个体的pH值显著高于AA型,失水率显著高于BB型(P<0.05);苏牧麻鸭中AB型个体的总胆固醇显著高于AA和BB型个体(P<0.05)。
- 张依裕徐琪段修军张海波孙国波赵文明陈国宏
- 关键词：家鸭LPL基因
- 鸭A-FABP基因内含子1多态性与肌内脂肪和血清甘油三酯含量相关研究被引量：2
- 2010年
- 本研究旨在探讨鸭脂肪型脂肪酸结合蛋白(Adipocyte Fatty Acid-Binding Protein,A-FABP)基因部分序列多态与鸭肌内脂肪和血清甘油三酯含量关系。根据鸭A-FABPmRNA序列和鸡A-FABP基因组序列设计1对引物扩增鸭A-FABP基因内含子1序列。同时根据扩增产物设计4对引物,利用PCR-SSCP对鸭A-FABP基因部分序列进行多态性研究并探究序列多态性与鸭肌内脂肪和血清甘油三酯含量的关系。结果表明:克隆序列包含鸭A-FABP基因外显子1、2部分序列和完整的内含子1序列,与鸡A-FABP基因内含子1同源性为75.1%;经SS-CP检测,发现引物P1扩增片段有3处碱基突变,引物P3有6处碱基突变,这些突变分别产生了3种和8种基因型。在P1位点樱桃谷鸭和苏牧麻鸭偏离了Hardy-Weinberg平衡(P<0.01),金定鸭基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),在P3位点3个群体均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。同时,这些基因型在不同群体中分布存在显著或极显著差异(P<0.05或P<0.01)。最小二乘分析显示,肌内脂肪和血清甘油三酯含量在各群体中有显著差异(P<0.05),P1和P3位点各基因型对肌内脂肪含量无显著影响(P>0.05),仅在P3位点CD基因型个体血清甘油三酯含量显著高于其他基因型个体(P<0.05)。结果提示,鸭A-FABP基因内含子1多态对血清甘油三酯含量有一定影响,但是否影响鸭肌内脂肪沉积,还需进一步研究。
- 张海波徐琪张依裕段修军孙莉陈国宏
- 关键词：A-FABP基因肌内脂肪血清甘油三酯
- 鹅IDH1基因的分离、序列分析及表达特征研究被引量：2
- 2009年
- 为阐明鹅肥肝形成的机制,使用mRNA差异显示技术研究朗德鹅和溆浦鹅在超饲养和正常饲养条件下肝脏基因表达差异。基因IDH1被证实在2个品种鹅肝脏中表达受到显著抑制(P<0.05)。结果,得到了该基因1269 bp的CDS序列,与鸡IDH1有95%的同源性。序列分析表明,该序列含有1个1248 bp的开放读码框(ORF),编码含415个氨基酸的蛋白质,该蛋白质序列存在1个保守结构域Icd,与其它物种该蛋白的同源性分别为:鸡99%、大鼠89%、人90%、猿90%、牛88%、小鼠88%。应用生物信息学的方法对该蛋白质的功能和结构进行了分析。组织表达分析表明,鹅IDH1基因在肝脏中表达丰富,在脾、肾和肌胃中中等表达,在其它组织中表达量较低。研究结果显示,超饲可以抑制鹅肝脏IDH1基因mRNA的表达。
- 赵阿勇陈国宏卢立志周圻
- 关键词：肥肝MRNA差异显示IDH1荧光定量PCR
- 鸭ApoVLDL-Ⅱ基因的克隆及其多态与肉质和脂肪性状的关联分析被引量：1
- 2011年
- 本研究设计6对引物,采用克隆测序和PCR-SSCP技术对鸭ApoVLDL-Ⅱ基因进行克隆测序和单核苷酸多态进行检测,并分析其多态对肉质和脂肪性状的遗传效应。结果表明,首次获得鸭ApoVLDL-Ⅱ基因DNA序列3 197 bp(GQ 180104),与番鸭和鸡的同源性分别为94.44%和68.74%;在引物Exon3检测到1910位碱基后插入/缺失2个碱基CC和G2106A突变,产生3种基因型:CC、CD和DD,等位基因D为樱桃谷鸭的优势等位基因,而C则为金定鸭和苏牧麻鸭的优势等位基因,该座位的基因型分布仅苏牧麻鸭符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);在引物Exon4检测到T2723C、C2743T和A2944C突变,产生AA、AB和BB 3种基因型,3个鸭群体中的等位基因B均为优势等位基因,基因型分布均处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);2个多态座位均表现为中度多态,基因型分布仅苏牧麻鸭与金定鸭之间未达到显著差异(P>0.05)。最小二乘分析显示,AA型个体的UFA和EFA分别极显著低于和高于AB和BB(P<0.01);AA型个体的胸肌率显著高于AB(P<0.05),极显著高于BB(P<0.01),揭示鸭ApoVLDL-Ⅱ基因Exon4座位的突变可能影响鸭胸肌率以及脂肪酸的合成和代谢过程,等位基因A可能是EFA和胸肌率的有利等位基因,等位基因B可能为UFA的有利等位基因。
- 张依裕徐琪段修军张海波孙国波赵文明陈国宏
- 关键词：PCR-SSCP性状
- 白羽番鸭生长曲线拟合比较分析被引量：33
- 2009年
- 试验测定不同性别法国白羽番鸭早期体重,用Logistic、Von Bertalanffy和Gompertz 3种非线性生长模型拟合其生长曲线。研究结果表明,白羽番鸭公鸭、母鸭4周龄前生长缓慢,后期公鸭生长快于母鸭;通过比较拟合优度(R2)、残差平方和(E)和进行适合性χ2检验结果发现,Gompertz模型拟合效果最佳。进一步比较不同性别Gompertz模型拟合参数,结果发现公鸭与母鸭相比,有较高的初始体重、极限体重、最大周增重和拐点体重,较低的初始生长速度。公鸭拐点周龄为7.03周,较母鸭的5.37周龄晚;公鸭4周龄前相对生长率小于母鸭,4周龄后则超过母鸭,绝对生长率差异较大。
- 张海波段修军张依裕徐琪廖菁王存波陈国宏
- 关键词：白羽番鸭体重
- 白羽番鸭脂联素基因SNP与肌内脂肪和血清总胆固醇的关联分析被引量：5
- 2011年
- 采用PCR-SSCP法对白羽番鸭脂联素基因全编码区和内含子进行多态性检测,并分析其多态对肌内脂肪(IMF)和血清总胆固醇(TC)的遗传效应,为番鸭分子标记辅助选择提供参考。结果表明:3个SNP分别在外显子1和外显子2的编码区发生A167G和G711A突变,为沉默突变,在内含子发生C290T突变;3个SNP位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),均表现为中度多态;关联分析表明,在A167G位点中,AA基因型个体的IMF和TC显著高于BB基因型个体(P<0.05);在C290T位点中,CC基因型个体的IMF显著高于TT基因型个体(P<0.05);其他各位点的各基因型与各性状间没有达到显著性差异(P>0.05)。该研究结果揭示,A167G和C290T位点对脂肪沉积可能有显著性的遗传效应,可作为番鸭的分子育种标记。
- 张依裕徐琪段修军张海波赵文明孙国波陈国宏
- 关键词：脂联素基因SNP白羽番鸭
- 如皋鸡EX-FABP基因遗传多态性及其与肌内脂肪含量的相关分析被引量：5
- 2010年
- 以60周龄和自繁后的12周龄的如皋鸡作为试验材料,采用PCR-SSCP技术对细胞外脂肪酸结合蛋白(EX-FABP)基因进行单核苷酸多态性及遗传特异性分析。结果检测到2个SNP突变,分别为4271 G/A、4281 G/A突变,有3种基因型。最小二乘差异显著性检验结果表明,在60周龄时,AA型含量最高,显著高于AB型(P<0.05);12周龄时,AB型含量最高,BB型最低;60周龄的肌内脂肪含量显著低于12周龄时的含量(P<0.05)。
- 周琼常国斌王克华窦套存廖菁陈国宏
- 关键词：单核苷酸多态性肌内脂肪
- 金定鸭Apo VLDLⅡ基因多态性及其与生产性能的关联分析
- 根据鸡和鸭Apo VLDLⅡ基因序列设计3对特异性引物对金定鸭外显子1、外显子2和外显子4编码区进行扩增,利用PCR-SSCP方法检测单核苷酸多态及其对体重、体尺、屠体、肉质、总蛋白、血清甘油三酯和总胆固醇的遗传效应,结...
- 张依裕徐琪张海波段修军孙国波陈国宏
- 关键词：金定鸭PCR-SSCP
- 文献传递
- 鹅PIT-1基因启动子区转录调控的研究被引量：1
- 2012年
- 为研究垂体特异性转录因子(Pituitary transcription factor 1,PIT-1)启动子的转录调控机制,寻找该基因转录调控的顺式作用元件、反式作用因子和基本转录单位。利用前期染色体步移技术扩增得到鹅PIT-1基因的启动子区序列,经PCR扩增,定向亚克隆至荧光素酶表达载体pGL3-Basic中,把目的片段连接到荧光素酶报告基因载体(pGL-Basic),制备了一系列启动子缺失体(-1 485/-1bp、-1 293/-1bp、-1 014/-1bp、-775/-1bp、-561/-1bp、-353/-1bp和-206/-1bp),并通过限性内切酶酶切、PCR及测序进行鉴定,构建了含有正确目的基因的报告基因重组体,然后瞬时转染GH3细胞,利用荧光素酶报告基因检测试剂盒检测。本试验所克隆的PIT-1基因启动子区具有明显的启动子活性,其中-561/-1bp的启动活性最强,该区域存在有PIT-1、POU3F2、myogenin和GR等多个转录因子结合位点。利用系列缺失法成功构建了荧光素酶报告基因真核表达载体,并且验证了克隆的启动子具有启动活性,找到了正负调控区域及核心启动子区,为进一步研究其转录调控机制奠定了基础。
- 赵荣雪赵文明徐琪段修军董飚孙国波毕瑜林李秀张扬黄正洋陈国宏
- 关键词：PIT-1基因启动子转录调控
