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生物技术专业课程设置改革的探索与实践被引量：5: 2013年; 以各高校间学生认知能力和地区资源的差异为生物技术专业课程设置改革的切入点,通过对普通生物学课程的解构,普通生物化学课程的梳理,妥善处理现代生物技术概论课和"四大工程课"的关系,巧妙连接生物专业英语课和双语教学课等举措,使生物技术专业实现了可持续发展。实践证明:只有在掌握学生认知能力和地区资源的基础上,进行生物技术专业课程设置的改革,才能真正实现生物技术专业课程设置改革的目标,达到培养目标和人才培养规格的要求。; 李天星; 关键词：课程设置地区资源高等教育改革生物技术专业

含好氧不产氧光合基因簇和Xanthorhodopsin-like基因的Sphingomonas sp.MIM37:基因组及光促生长分析被引量：3: 2015年; 【目的】菌株MIM37为具有两种光能利用途径的光合异养细菌,分析其基因组和光照对生长的影响,为理解光能利用途径、光营养生物多样性以及光合作用的进化和功能等提供线索。【方法】采用平板涂布划线法分离菌株,结合形态观察及16S r RNA基因和光合基因序列同源性与系统发育分析进行初步分类鉴定;以分光光度法和荧光显微观察法测定光照和黑暗培养下培养液细胞浓度和单细胞体积;构建片段长度为300-500 bp的Illumina PE文库,以Illumina Hiseq2000进行基因组测序,以SOAPdenovo和Gap Closer组装序列,以RAST在线软件注释基因组。【结果】从内蒙古腾格里沙漠天鹅湖表层水中分离获得一株细菌MIM37,经16S r RNA基因、puf M和视紫质基因同源性和系统发育分析均显示其与Sphingomonas属亲缘关系最为密切;相对黑暗培养,光照刺激下的最大细胞浓度和单细胞体积大小分别提高了1.2和5.6倍;基因组注释显示MIM37代谢途径多样,含典型好氧菌的呼吸电子传递链,具有完整的好氧不产氧细菌的光合基因簇及Xanthorhodopsin-like视紫质蛋白基因,合成铁载体,还原重金属,降解微囊藻毒素和多环芳烃类等。【结论】MIM37属于Sphingomonas属,具有两种光能利用途径,光照可明显促进其生长,多样的代谢模式可能使其在自然环境中极具竞争力、分布广泛并具有应用于修复环境污染的潜力。; 张星星刘亚鹏袁博赵吉睿王瑞刚冯福应; 关键词：视紫质 RRNA 基因组

乌梁素海富营养化湖区浮游细菌多样性及系统发育分析被引量：30: 2009年; 水生生态系统富营养化与细菌群落之间的关系尚不明确。本文通过构建和分析16SrRNA基因片段克隆文库,以期揭示乌梁素海富营养化水体细菌的多样性及其系统发育关系,并探讨富营养化与细菌多样性之间的关系。利用HaeIII对文库中的87个克隆子进行单酶切,产生了23种带型,文库覆盖度达到了73.6%,反映出文库有较好的代表性。选择每种OTU的一个代表克隆进行测序分析,基因序列系统发育分析结果表明,乌梁素海中多数细菌与淡水生态系统中常见的细菌门类相同,即α-,β-,γ-Proteobacteria,Bacteroidetes,Actinobacteria,它们分别占总菌数的10.3%、41.4%、4.6%和6.9%,其中β-Proteobacteria和Bacteroidetes是优势细菌类群。与典型淡水生态系统细菌群落组成不同的是,乌梁素海中存在约10.3%的轻度嗜盐碱细菌。水体中83.9%的细菌与已培养的细菌的同源性低于97%,其中58.9%的细菌未能鉴定到属;其余总菌数16.1%的克隆与具有降解污染物生物活性的已知菌相近。Bacteroidetes、Firmicutes和β-Proteobacteria中的某些类群成为优势菌群可能是对乌梁素海水体富营养化的响应。; 孙鑫鑫刘惠荣冯福应孟建宇李蘅玛丽娜; 关键词：乌梁素海浮游细菌 RFLP 系统发育分析

三种碳源对乌梁素海好氧不产氧光合细菌群落结构的影响被引量：4: 2014年; 好氧不产氧光合细菌（AAPB）营光合异养,在水体碳循环中起着重要作用.但是,碳源对AAPB群落结构的影响尚不明确.本文基于16S rDNA和光合反应中心合成中的关键基因——pufM基因,运用变性梯度凝胶电泳（DGGE）技术,比较分析了在微生物分离培养中常用的3种碳源（葡萄糖、丙酮酸钠、酵母提取物）对乌梁素海水体总细菌及AAPB群落结构的影响.结果表明,不同碳源诱导7~21 d后,水体总细菌群落丰富度及多样性指数均有不同程度的提升,AAPB群落则呈现先升后降的趋势.3种碳源中,丙酮酸钠添加后对总细菌及AAPB菌群的丰富度和多样性的提升效果最好.测序及系统发育结果表明,乌梁素海水体经诱导后新检测到了一些原环境中未发现的菌属,一些具有特殊碳代谢能力的菌属丰度得到了提升.本研究为充分认识和理解AAPB的生态学作用和意义,及其富集、分离和培养提供了基础依据.; 赵吉睿巩瑞红李畅游王瑞刚陈晨陈勿力吉玛牛晓峰冯福应; 关键词：碳源群落结构变性梯度凝胶电泳乌梁素海

乌梁素海可培养细菌丰度和多样性分析被引量：3: 2010年; 在水生生态系统中,细菌是复杂有机物和矿质元素转化的最重要的贡献者,丰度和多样性是了解其作用和功能、并有效利用的前提和关键。本文通过对乌梁素海富营养化湖区的可培养浮游细菌数量统计和多样性进行分析,以期揭示可培养浮游细菌的丰度和多样性,探讨他们与乌梁素海富营养化之间的关系。研究结果表明,乌梁素海水体中浮游细菌总数为0.1×10^6-0.6×10^7cfu/L。乌梁素海富营养化湖区可培养浮游细菌划线培养获得的41菌株,分属于27个分类单元,与数据库中已知的芽孢杆菌属（Bacillus）、类芽孢杆菌属（Paenibacillus）、微球菌属（Mi-crococcus）、杆状菌（brevundimonas）、苯丙酮酸莫拉氏菌（Marinibacillus）、假单胞菌属（Pseudomonas）细菌和动性球菌属（Planococcus）具有很高的相似性,γ-proteobacteria中的某些类群成为优势菌群可能是对乌梁素海水体富营养化的响应,为今后开发利用乌梁素海生物资源和修复乌梁素海生态环境提供了依据。; 赵春霞刘惠荣冯福应何一平; 关键词：乌梁素海可培养细菌微生物多样性 RDNA

基于pufM基因的乌梁素海富营养化湖区好氧不产氧光合细菌系统发育多样性分析被引量：10: 2010年; 好氧不产氧光合细菌(AAPB)的多样性在海洋中已经广泛研究,但在富营养化湖泊中却研究甚少。通过构建和分析AAPB光合中心合成中的关键基因pufM克隆文库,以期揭示乌梁素海富营养化湖区AAPB分布及其系统发育多样性,探讨其在富营养化湖泊中的功能和作用。对乌梁素海红圪卜湖区水体文库中的52个克隆子进行分析,产生了28个OTU,文库覆盖度达到71.4%,反映出文库有较好的代表性。同源性和系统发育分析结果表明,乌梁素海红圪卜湖区AAPB有较高的多样性,与我们之前所发现的同一湖区总细菌多样性较低形成鲜明对比。所获得的序列分属7个亚群,即γ-Proteobacteria(44.2%,含Group-1,-2和-3共3个亚群)、β-Proteobacteria(21.2%)、Rhodobacter-like(7.69%)及2个未知亚群unknown Group-1(21.2%)和Group-2(5.77%)。其中γ-Proteobacteria占到总克隆的44.2%,在低盐的乌梁素海环境中出现高比例的γ-Proteobacteria之前并未见类似报道,并且乌梁素海中存在一些可能是富营养化湖泊特有的AAPB。这表明AAPB可能在富营养化湖泊生态系统的维持和稳定中有重要作用。; 何一平曾永辉袁博刘惠荣冯福应; 关键词：群落结构系统发育分析

实验项目设计及创新型人才培养——以生态学实验项目为例被引量：8: 2013年; 科学设计生态学实验项目,对于生态学实验室的建设和学生的学习效果、学生知识结构、学生专业知识体系的系统性、完整性及创新型人才的培养等方面都具有重要的影响,从而影响到本专业培养目标的实现。在规范的指导下,将与理论课同时开设的实验课,分成实验室的项目和野外实验项目两大部分。从根本上缓解了实验室压力,保证了实验教学质量。巧妙构建实验项目是实现高校实践教学可持续发展乃至整个高等教育可持续发展的一个重要举措。; 李天星; 关键词：实践教学创新型人才高等教育改革生态学

东居延海表层水中可培养细菌系统发育与种群多样性研究被引量：1: 2014年; 东居延海作为内蒙古高原主要湖泊之一,水体中微生物的生存现状尚不明确。该研究利用1/2R2A培养基,从湖泊水样中分离获得74株细菌。16S rDNA序列的系统发育分析表明,α-变形菌纲(α-proteobacteria)的菌株最多,共有39株,约占全部细菌的53%;放线菌纲(Actinobacteria)为第二优势类群,共有19株菌株,占全部菌株的26%;除此之外,还分离获得了9株来自芽孢杆菌纲(Bacilli)、6株来自γ-变形菌纲(γ-proteobacteria)以及1株来自β-变形菌纲(β-proteobacteria)的菌株。这些细菌属于23个属,其中以柄杆菌目(Caulobacterales)短波单胞菌属(Brevundimonas)为优势种群,共9株。; 陈晨王小兵赵吉睿王瑞刚刘惠荣孟建宇; 关键词：系统发育种群多样性 RDNA

乌梁素海小口湖区沉积物细菌多样性及其系统发育分析被引量：4: 2011年; 本文通过构建和分析细菌的16SrRNA基因克隆文库,研究了2008年7月乌梁素海小口湖区沉积物中微生物群落多样性及其系统发育。其中发现小口的49个克隆子主要与δ-proteobacteria(24.5%)Acidobacteria(18.4%),α-proteobacteria(14.3%),γ-proteobacteria(14.3%)和Chloroflexi(14.3%)相关。此外并通过多样性分析发现,富营养化较轻的小口湖区沉积物中细菌数量较多,多样性较完整,分布均匀。与其它相关研究比较发现,乌梁素海小口湖区发现的α-proteobacteria,Bacteroidetes均为淡水湖生态系统(例如太湖)中常见菌群,而Firmicutes,γ-pro-teobacteria等菌群多出现在太湖沉积物中,水体中很少。但是与典型淡水生态系统细菌群落组成不同的是乌梁素海中存在一部分的轻度嗜盐碱细菌。α,γ-proteobacteria,Bacteroidetes和Firmicutes,以及Chloroflexi的某些类群数量优势可能是对乌梁素海水体富营养化的响应。总之,细菌群落与水体富营养化关系紧密,但错综复杂、需要我们进一步深入研究。; 张晓军赵宇龙金一荻冯福应; 关键词：乌梁素海沉积物细菌群落结构系统发育分析

加快实验课程改革,培养创新型人才——以生态学实验课程改革为例被引量：10: 2012年; 制定生态学实验课程的教学大纲、进行合理的课程性质设计、巧妙构建实验项目、加强实验项目管理的系统化和规范化建设、严抓实验课堂教学环节、保证师生论文创作和实验教学的互动等,可以使生态学实验课更好地发挥其在培养创新型人才过程中的作用和价值。; 李天星; 关键词：创新型人才培养

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