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棉花抗逆相关PUB基因家族分析及其功能验证: 棉花（Gossypiumspp.）是最重要的纤维作物，随着植棉区向北方盐碱地、新疆、内蒙古、沿海滩涂发展，棉花非生物胁迫研究成为棉花育种中的重要内容之一。PUB是含有U-box结构域的一类泛素连接酶，在多种植物中研究发现...; 舒娜; 关键词：棉花非生物胁迫; 文献传递

棉花GbRvd的亚细胞定位及其超表达烟草抗病性分析被引量：3: 2016年; 【目的】研究棉花NB-LRR家族基因GbRvd的亚细胞定位及超表达烟草的黄萎病抗性,为解析GbRvd介导的植物抗黄萎病机制提供依据。【方法】对真核表达载体pJCV52进行改造,在SpeⅠ酶切位点插入gfp,使其兼具亚细胞定位的功能,命名为GPJCV52。应用Gateway技术构建GbRvd的亚细胞定位和超表达载体,并分别转化农杆菌GV3101。利用生物信息学和农杆菌介导的烟草瞬时表达技术对GbRvd分别进行亚细胞定位预测与观察。采用农杆菌介导法转化烟草,并通过组织培养技术获得转基因植株。运用PCR对超表达GbRvd的烟草进行阳性植株筛选,且利用半定量RT-PCR对阳性转基因植株进行表达检测。制备棉花黄萎病菌孢子悬浮液,通过灌根法对T_3代转基因烟草株系进行接种,利用5级标准统计发病情况并计算病情指数。【结果】利用在线分析软件ProtComp预测GbRvd为一种胞外(分泌)蛋白;GbRvd的跨膜预测结果显示其包含3个跨膜域;在线分析软件Wo LF PSORT预测结果显示GbRvd在细胞膜、内质网及叶绿体的预测分值分别为7、3和1,表明GbRvd主要存在于植物细胞膜上。利用农杆菌介导的烟草瞬时表达技术进一步对GbRvd的亚细胞定位进行观察,结果显示在单独表达GFP蛋白的烟草细胞中,荧光信号在细胞核、细胞质和细胞膜均有分布;而GbRvd与GFP融合表达后的荧光信号主要分布于烟草表皮细胞质和细胞膜。综合生物信息学分析和亚细胞定位观察结果,表明细胞膜和细胞质是GbRvd的主要分布位置。利用农杆菌介导和组织培养获得了转基因烟草植株,通过对转基因烟草植株的PCR检测显示,阳性转基因烟草植株能够通过PCR扩增出与预期大小一致的目的条带,而野生型植株未出现相应条带;阳性转基因烟草植株半定量RT-PCR同样能够检测出与预期大小一致的目的条带,由此表明GbRvd成功整合于烟草基因组并能够进行正常转录�; 杨占武杨君张艳吴金华李志坤王省芬吴立强张桂寅马峙英; 关键词：棉花亚细胞定位转基因烟草黄萎病

Comprehensive analysis of NAC transcription factors in diploid Gossypium: sequence conservation and expression analysis uncover their roles during fiber development被引量：12: 2016年; Determining how function evolves following gene duplication is necessary for understanding gene expansion.Transcription factors(TFs)are a class of proteins that regulate gene expression by binding to specific cis-acting elements in the promoters of target genes,subsequently activating or repressing their transcription.In the present study,we systematically examined the functional diversification of the NAC transcription factor(NAC-TFs)family by analyzing their chromosomal location,structure,phylogeny,and expression pattern in Gossypium raimondii(Gr)and G.arboreum(Ga).The 145 and 141 NAC genes identified in the Gr and Ga genomes,respectively,were annotated and divided into 18 subfamilies,which showed distinct divergence in gene structure and expression patterns during fiber development.In addition,when the functional parameters were examined,clear divergence was observed within tandem clusters,which suggested that subfunctionalization had occurred among duplicate genes.The expression patterns of homologous gene pairs also changed,suggestive of the diversification of gene function during the evolution of diploid cotton.These findings provide insights into the mechanisms underlying the functional differentiation of duplicated NAC-TFs genes in two diploid cotton species.; Haihong ShangZhongna WangChangsong ZouZhen ZhangWeijie LiJunwen LiYuzhen ShiWankui GongTingting ChenAiying LiuJuwu GongQun GeYoulu Yuan; 关键词：亚洲棉序列保守性

乙烯诱导短季棉叶片衰老中抗氧化物酶及基因的变化被引量：1: 2014年; 室内条件下,分析了乙烯诱导的短季棉叶片衰老过程中,过氧化氢酶、超氧化物歧化酶、抗坏血酸过氧化物酶以及过氧化物酶的活性变化,并对不同酶编码基因的表达差异也进行了研究;此外还探讨了过氧化氢在乙烯对不同酶类调控中的作用。结果表明,乙烯诱导的叶片衰老中,过氧化氢酶、超氧化物歧化酶、抗坏血酸过氧化物酶的活性及基因表达都逐渐降低,过氧化物酶的活性及基因表达则逐步升高;然而,当过氧化氢清除剂或者抑制剂存在时,乙烯对抗氧化物酶及其基因表达不产生影响,过氧化氢介导了乙烯对不同抗氧化物酶的调控。; 孟艳艳冯常辉庞朝友宋美珍蓝家样张胜昔范术丽; 关键词：乙烯短季棉叶片衰老过氧化氢基因表达

NaCl和Na_2CO_3对不同棉花基因组的DNA甲基化影响被引量：13: 2014年; 【目的】探究不同盐胁迫后的棉花基因组DNA甲基化变化情况,并比较分析叶片和根部DNA甲基化变化差异,进而探究DNA甲基化与棉花耐盐性之间的关系。【方法】以陆地棉耐盐品种中9806和盐敏感品种中S9612为试验材料,分别用NaCl和Na2CO3(浓度均为0.4%)处理。提取对照和处理材料的DNA,进行双酶切、连接、预扩增和选择性扩增,然后采用MSAP技术(甲基化敏感扩增多态性)分析棉花幼苗在盐胁迫前后的DNA甲基化情况。从聚丙烯酰胺凝胶中回收纯化多态性片段并进行测序,通过NCBI进行比对分析;设计引物,用实时荧光定量PCR对多态性片段在棉花幼苗中的表达量进行验证。【结果】盐胁迫分析表明不同类型盐胁迫对棉花幼苗的影响不同;0.4%的中性盐NaCl对棉花幼苗的影响相对较小,各部分组织的形态变化不明显,而0.4%的碱性盐Na2CO3对棉花幼苗的影响较大,使棉花幼苗子叶变软,茎基部和根部发黑;MSAP分析结果表明,NaCl胁迫后中9806和中S9612叶片的甲基化比率分别为23.5%和27.7%,其中,全甲基化比率分别为20.3%和22.9%,根部的甲基化比率分别为24.7%和27.1%,其中,全甲基化比率分别为19.6%和21.6%;Na2CO3胁迫后中9806和中S9612叶片的甲基化比率分别为28.9%和28.1%,其中,全甲基化比率分别为24.3%和24.5,根部的甲基化比率分别为25.7%和27.6%,其中,全甲基化比率分别为21.5%和24.0%。叶片和根部甲基化水平存在差异,随着盐类型由中性盐向碱性盐转变的过程中,基因组DNA甲基化水平迅速增加,并在Na2CO3处达到最大值。通过分析胁迫以后的甲基化状态,在NaCl和Na2CO3胁迫后,中9806叶片的甲基化条带所占多态性条带比率分别为40.00%和50.00%,去甲基化条带所占多态性条带比率分别为54.12%和46.67%,中9806根部的甲基化条带所占多态性条带比率分别为35.53%和43.59%,去甲基化条带所占多态性条带比率分别为56.58%和51.28%。而中S9; 陆许可王德龙阴祖军王俊娟樊伟丽王帅赵小洁张天豹叶武威; 关键词：棉花 DNA甲基化 MSAP 实时荧光定量PCR

UFD2结构域在棉花和其他24种植物中的进化分析: 2017年; UFD2(ubiquitin fusion degradation-2)结构域是UFD2蛋白序列上一段高度保守的序列,该结构域在植物的UFD2和RKP2类泛素连接酶中都存在,UFD2结构域在植物中普遍存在,但是关于该结构域在植物中的研究还比较少。为研究含UFD2结构域的蛋白及基因在棉花和其它一些植物中的进化,以及4种棉花内的进化,本研究在已完成测序的4种棉花和其他24种植物的基因组数据库中,以酵母的UFD2(Gen Bank:Z74238.1)基因序列以及拟南芥中鉴定At UFD2(At5g15400)为参考序列通过同源比对的方法获得所有含有UFD2结构域的蛋白序列、CDS序列和基因全序列,然后用Bio Edit、Clustal X18.3、MEGA6.0、GSDS2.0等生物信息学工具对其进行序列特征、多序列比对、系统进化、基因结构等分析,从棉花和其他24种植物中共鉴定出63个基因,系统进化分析显示可分为两大类,且与植物中UFD2和RKP两类对应上,所有植物都含有UFD2类蛋白,但含有UFD2结构域的RKP类蛋白只有部分植物有。UFD2类蛋白的UFD2结构域的序列长度约是RKP类蛋白中UFD2结构域的2倍,UFD2结构域对应在基因上区域UFD2类基因有13个内含子,而RKP类只有4或5个,棉花中的6个RPK类蛋白的UFD2结构域序列完全一致,而7个UFD2类蛋白的UFD2结构域有4个差异位置共7个氨基酸位点,结果表明:两类含有UFD2结构域的蛋白在进化上独立,同一类蛋白的进化和物种进化基本一致,棉花中的RKP棉花基因保守度高于UFD2类基因的。; 舒娜舒娜韩明格崔瑞峰王德龙王帅王德龙樊伟丽王俊娟郭晓宁; 关键词：进化棉花

棉花纤维品质改良相关基因研究进展被引量：16: 2016年; 棉纤维是优良的、使用最为广泛的天然纤维。随着人们生活水平的提高,对天然纯棉织物的需求不断增加,同时对品质的要求也愈来愈高。因此,提高棉纤维产量和品质成为当前棉花遗传育种的重要目标,对棉纤维发育相关基因的克隆与功能研究是实现这一目标的重要基础。棉纤维发育由4个明显但又重叠的时期组成,包括纤维细胞的起始、伸长(初生壁合成)、次生壁合成和脱水成熟。起始是影响纤维细胞数量的重要时期,而纤维长度和强度的决定发生在次生壁合成期和脱水成熟期。棉纤维发育是一个复杂而有序的过程,由大量的基因参与调控。目前,已经有一些在棉纤维发育过程中发挥重要作用的基因被报道,包括各种转录因子、参与激素代谢基因、编码细胞壁蛋白和细胞骨架蛋白基因、活性氧代谢相关基因、以及参与糖和脂类代谢的基因等。文中对已报道的这些与棉花纤维发育相关基因的克隆和功能分析进行了系统总结,以期为棉花纤维发育及品质改良研究提供参考。; 杨君马峙英王省芬; 关键词：棉花纤维基因

毛棉苗期抗旱性状的QTL定位被引量：6: 2017年; 【目的】通过分析毛棉苗期抗旱相关性状的数量性状位点(Quantitative trait locus,QTL),以期检测稳定的主效QTL,促进栽培品种抗旱性状遗传改良及提高抗旱育种效率。【方法】以四倍体野生种毛棉(Gossypium tomentosum)和陆地棉品种中棉所12(CCRI 12)的种间杂种F2及其F2:3家系为研究材料,用于基因型分型的F2有188个系,用于表型分型的F2:3家系有149个株系。分别在干旱胁迫和正常灌水2个环境下调查表型数据。采用复合区间作图法对F2:3家系苗期相关性状抗旱系数进行QTL定位。【结果】对苗期相关性状抗旱系数的QTL定位分析,共得到16个QTL,其中与株高、叶片数、叶绿素含量、脯氨酸含量、丙二醛含量抗旱系数相关的QTL分别有5个、1个、3个、3个、4个,分布在13条染色体上。来自毛棉的5个加性QTL分别为qSHDC-19-1、qSHDC-19-2、qSLNDC-5-1、qMDADC-24-1、qMDADC-24-2,其加性效应值为0.10~0.22,解释变异9.4%~25.8%。【结论】这些与抗旱相关的QTL有助于棉花抗旱分子标记辅助选择。; 郑巨云George OluochKhan Muhammad Kashif Riaz周忠丽王星星蔡小彦李雪源王春英王玉红刘方王坤波; 关键词：种间杂交苗期抗旱数量性状位点

棉花功能基因组研究进展被引量：3: 2017年; 棉花是重要的经济作物。近年来棉花功能基因组研究发展迅速,高通量测序技术应用于棉花研究,二倍体和四倍体棉花基因组测序陆续完成,棉花全基因组重测序及关联分析相继涌现,大量的棉花功能基因被分离鉴定。本文回顾了棉花功能基因组研究的历程,重点介绍了棉花基因组测序和棉花栽培品种全基因组关联分析相关研究成果,并总结了棉花纤维和腺体发育中的关键功能基因及棉花抗旱、抗盐碱等功能基因研究进展,为全面了解棉花重要农艺性状形成的遗传基础和棉花遗传改良提供理论参考。; 左东云叶武威程海亮王德龙张友平王俊娟王巧连陈修贵陆许可宋国立; 关键词：棉花基因组测序纤维发育腺体抗逆

黄萎病菌胁迫下沉默HyPRP1基因的棉花转录组分析: 本研究利用VIGS技术对HyPRP1基因进行了沉默,并提取到棉株高质量的RNA;通过转录组测序技术获得了丰富和可靠的基因序列、注释、表达等数据。黄萎病菌胁迫12 h后,HyPRP1沉默棉花有1790个基因发生了差异表达,...; 杨君王省芬王伟巧张艳李志坤马峙英; 关键词：黄萎病棉花; 文献传递

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国家高技术研究发展计划(2013AA102601)

文献类型

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