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从头算和ABEEMσπ/MM对（CH3OH）n（n=3～12）和[M（CH3OH）n]+（M=Na,K）团簇的研究: 应用从头计算（ab initio）和原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场方法（ABEEMσπ/MM）对环状甲醇团簇（CH3OH）n（n=3～12）体系、[Na（CH3OH）n]+（n=3～6）体系和[K（CH3OH）n]+...; 于泳博刘翠宫利东杨忠志; 关键词：ABEEMΣΠ/MM; 文献传递

卤素离子水溶液体系的从头计算和ABEEM浮动电荷分子力场研究: 采用量子化学方法计算X-（H2O）n（X-=F-/Cl-/Br-/I-,n=1～6）团簇体系的结构、结合能和电荷分布。结果表明,团簇体系最稳定构型是H2O中H直接与卤素离子配位;当外层配位水分子数为3～5时,F-被水分子...; 王宁刘翠宫利东; 关键词：卤素离子分子动力学模拟; 文献传递

Fapy-G对碱基氢键复合物影响的理论研究被引量：4: 2014年; 应用量子化学方法对2，6-二氨基4-羟基-5．甲酰胺嘧啶（Fapy-G）与正常碱基作用形成的20种氧化碱基对的多种性质进行了理论分析，碱基G的c8位被氧化后N7和N9位分别增加一个H原子，使其由氢键受体变成氢键供体，N7，N9及06原子所带的电荷变负，同时06作为氢键受体的能力增强．与碱基单体相比，碱基对中形成氢键的受体原子所带的电荷平均减小0．05e；供体H原子所带的电荷平均增大0．02e．Fapy—G分子中六元环上受体N原子参与形成氢键时，环的呼吸振动模式和N与对位C的振动模式的振动频率蓝移；与氢键相关的振动频率红移．所有氧化碱基对中，NH…N比NH…O氢键作用更强，且在NH…N氢键中，在六元环上的供体N原子形成的氢键比在氨基或开环上的供体N原子形成的氢键强．Fapy—G与碱基A作用结合能区域顺序为1〉2〉4〉3，与碱基T（R）作用区域顺序为3=4〉1〉2；水溶液使Fapy—G与碱基C作用的结合能减弱程度最大，结合能达到41．84—58．58kJ／mol，且使碱基对结合能力次序发生改变．; 刘翠张千慧宫利东卢丽男杨忠志; 关键词：量子化学方法氢键电荷分布结合能

应用从头计算和ABEEMσπ极化力场方法对ML_n(M=Na^+/K^+;L=NMA,H_2O;n=1～6)的研究被引量：2: 2016年; 本文使用从头计算MP2/6-311++G(2d,2p)//B3LYP/6-31+G(d,p)和ABEEM??极化力场(ABEEM??/MM)方法,对MLn(M=Na+/K+;L=N-methlylacetamide,H2O;n=1~6)体系的结构、结合能和电荷分布进行系统研究.研究结果表明,ABEEM??/MM所获得的各种物理量与从头算结果符合很好,其中键长的平均绝对偏差(AAD)接近0.03?,键角的AAD小于0.69°,结合能的AAD小于5%,ABEEM??的电荷分布与从头算的电荷分布的线性相关系数均在0.97以上.; 宫利东任伟贺张樱露李伟波杨忠志; 关键词：水合离子 ABEEMΣΠ/MM

尿素与甘氨酸二肽相互作用的量子化学研究被引量：2: 2016年; 应用高水平量子化学计算方法 MP2/6-311++G(d,p)//B3LYP/6-311++G(d,p)对尿素与甘氨酸二肽形成的复合物Urea(Gly)2进行了结构优化和频率计算.结果表明:尿素与甘氨酸二肽之间通过3种类型的氢键形成稳定复合物:第1种是甘氨酸二肽的氧与尿素的氢形成的OG…HU,第2种是尿素中的氧与甘氨酸二肽中亚氨基的氢形成的OU…HNG,第3种是由尿素中的氧与甘氨酸二肽中的甲基氢形成的OU…HCG.氢键强度为OU…HNG>OG…HU>OU…HCG.在Urea(Gly)2复合物中形成氢键位置上的原子的电荷变化明显.复合物所含氢键强度越大,结合能越大.; 宫利东张慧郝争争; 关键词：尿素量子化学计算氢键结合能

水合锌(Ⅱ)团簇Zn^(2+)(H_2O)_n(n=10～12)的理论化学研究被引量：5: 2014年; 应用高水平量子化学方法 MP2/6-311++G(2d,2p)//M062X/6-311+G(d,p)对气相中的Zn2+(H2O)n(n=10~12)团簇进行优化,获得其多种稳定结构,计算并比较不同Zn2+的配位数下的结合能及电荷分布.结果表明:当n=10~12时,Zn2+的配位数可以为4、5或6,其中最稳定结构的Zn2+配位数为5或6.随着水分子数的增加,体系最稳定结构的氢键数和离子与内层水分子中氧的距离RZn-O都在不断增加.; 宫利东宋洋; 关键词：量子化学计算配位数电荷分布

从头算和ABEEMσπ/MM对(CH_3OH)_n(n=3～12)和[Na(CH_3OH)_n]^+(n=3～6)体系的研究被引量：1: 2016年; 采用从头算方法(ab initio)和原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场方法(ABEEMσπ/MM),对甲醇团簇(CH_3OH)n(n=3~12)和[Na(CH_3OH)_n]^+(n=3~6)体系的结构、电荷分布和结合能进行研究.依据从头算结果构建上述体系的ABEEMσπ/MM浮动电荷势能函数,并确定相关参数.结果表明,ABEEMσπ/MM所获得的结构和结合能等均优于OPLS/AA力场,并与从头算结果相符,其中键长的平均绝对偏差(AAD)小于0.004 nm,键长、键角和结合能的相对均方根偏差(RRMSD)分别小于3.8%,1.7%和6.8%;电荷分布与从头算结果的线性相关系数均大于0.99.; 于泳博刘翠宫利东; 关键词：从头算钠离子分子间相互作用

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辽宁省高等学校优秀人才支持计划(LJQ2013111)