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国家自然科学基金(s30370235)
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1
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发文基金:
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Characterization of Bacterial Community Structure and Diversity in Rhizosphere Soils of Three Plants in Rapidly Changing Salt Marshes Using 16S rDNA
被引量:19
2007年
在在长江河口的本国的 Phragmites 南极光和 Scirpus mariqueter 和相异的 Spartina alterniflora 的根围土壤的细菌的社区的结构和差异被构造 16S ribosomal 脱氧核糖核酸(rDNA ) 调查克隆图书馆。细菌的差异被把克隆放进运作的分类单位(OTU ) 确定在 > 的顺序类似的水平的组 97% 。398 克隆定序的结果的种系发生的分析在这些工厂的根围土壤显示了细菌的高差异。门 Proteobacteria 的 Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria,和 Deltaproteobacteria 的成员最充满 rhizobacteria。结合的 Chao 1 非参量的差异评估者 Simpson 的索引(1/D ) 相互被使用定序从每个图书馆获得评估全部的顺序差异和份量上的数据比较优势的水平。结果显示出那 Phragmites, Scirpus,和包含的 Spartina 根围土壤 200, 668,和 382 OTU 分别地。在 Spartina 和 Phragmites 根围土壤的细菌的社区显示了 1/D 揭示的种类优势,而在 Scirpus 根围土壤的细菌的社区有种类丰富的均匀分布。总的来说,从根围土壤的 16S rDNA 克隆图书馆的分析显示在细菌的作文的变化可以在植物群落与种类作文的移动附随地发生。
WANG Meng CHEN Jia-Kuan LI Bo
关键词:
盐沼
菌群结构
细菌多样性
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