国家自然科学基金(31170234)
- 作品数：2 被引量：12H指数：1
- 相关作者：耿梦婷吴晓慧范洁郭建春姚远更多>>
- 相关机构：中国热带农业科学院海南大学更多>>
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- 番木瓜酸性转化酶基因家族预测及生物信息学初步分析被引量：11
- 2014年
- 酸性转化酶参与了番木瓜果实中蔗糖的韧皮部卸载,调控果实中糖类的积累。本文利用番木瓜基因组数据库信息,发现了番木瓜基因组中含有6个酸性转化酶基因,分别为细胞壁转化酶基因（CpCWINV1-3）和液泡转化酶基因（CpVINV1-3）。这些基因由3-7个外显子组成,其中CpCWINV1、CpVINV1和CpVINV2的N端均具有一个跨膜区域。蛋白质3D结构预测分析表明,CpCWINV1、CpVINV1和CpVINV2具有典型的N端β-螺旋桨模块（β-propeller module）和C端β-三明治模块（β-sandwich module）,而CpCWINV3和CpVINV3的桨叶I上,均没有保守区NDPNG/A;CpCWINV2和CpVINV3均缺失了β-三明治模块。推测番木瓜细胞壁转化酶CpCWINV1、液泡转化酶CpVINV1和CpVINV2能正确履行催化蔗糖分解的功能。本研究有助于我们进一步揭示酸性转化酶在番木瓜果实发育及糖类积累过程中的作用。
- 严丹凤吴晓慧耿梦婷范洁姚远李瑞梅郭建春
- 关键词：番木瓜酸性转化酶生物信息学分析
- 木薯转化酶抑制子MeINH3基因的克隆及生物信息学分析被引量：1
- 2014年
- 转化酶抑制子调控转化酶的活性,在植物的糖代谢过程中具有重要作用。为了研究木薯的转化酶抑制子,本实验利用木薯基因组数据库分析及RT-PCR方法,从木薯中分离了1个木薯转化酶抑制子MeINH3的cDNA序列。MeINH3序列长度为564 bp,包含528 bp的完整开放阅读框,编码127个氨基酸,N端有16个氨基酸残基的信号肽,4个保守的半胱氨酸残基可形成两个二硫桥。亚细胞定位预测表明,MeINH3蛋白定位于胞外。根据生物信息学分析结果,推测其可能抑制木薯细胞壁转化酶活性。
- 吴晓慧耿梦婷范洁姚远符少萍胡新文郭建春
- 关键词：木薯基因克隆生物信息学分析
