公共文化服务平台

共 7 条记录，以下是 1-6

全选清除导出

排序方式：

甘蔗EST序列的SSR信息分析被引量：5: 2010年; 从NCBI公共数据库获得262 113条甘蔗EST,通过前处理和聚类拼接得到全长为50 058.89 kb的无冗余Unigene 62 565条。在这些序列中搜索出9 482个SSRs,出现频率是15.15%;平均5.28 kb出现1个SSR。三核苷酸重复是主要的类型,占总SSRs的45.92%。CT和CGC是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复的21.22%和8.18%。此外还对筛选出的SSR进行多态性预测,得到了长度在20 bp以上的低级基元一、二、三核苷酸EST-SSR共1 405条,占长度20 bp以上的SSR总数的59.16%。结果为甘蔗EST-SSR标记的开发和相关分子生物学研究提供资料和奠定基础。; 闫学兵阙友雄许莉萍郭晋隆陈如凯潘永保; 关键词：甘蔗表达序列标签简单重复序列

甘蔗细胞质型苹果酸脱氢酶基因的克隆及其表达分析被引量：4: 2012年; 对甘蔗(Saccharum officinarum L.)叶片全长cDNA文库进行测序,获得了1个细胞质型苹果酸脱氢酶(cMDH)基因的全长cDNA序列,命名为Sc-cMDH。生物信息学分析表明,该基因全长1314 bp,开放阅读框为999 bp,编码332个氨基酸。Sc-cMDH与其他植物cMDH的氨基酸序列同源性高达86.5%～97.0%。Sc-cMDH包含典型的NAD+结合基元T11GAAGQI17和催化基元I184WGNH188,还有相当保守的6个半胱氨酸残基,因此推断该基因为细胞质型NAD-MDH。定量PCR分析结果表明,该基因在甘蔗叶片和根中的表达量高于茎。; 徐景升阙友雄颜克伟唐唯其许莉萍高三基郭晋隆董萌陈如凯; 关键词：甘蔗实时定量PCR

甘蔗锌指蛋白基因ShSAP1的克隆与表达模式被引量：10: 2011年; 植物中具有A20/AN1锌指结构域的蛋白与逆境应答密切相关,在甘蔗热带种Saccharum officinarum拔地拉Badila中克隆到一个具有A20/AN1锌指结构域的锌指蛋白基因ShSAP1。为研究ShSAP1的基因结构和表达特性,采用PCR和Southern blotting分析了ShSAP1的基因组结构,通过半定量RT-PCR对ShSAP1在甘蔗不同部位、不同胁迫和不同激素处理下的表达模式进行了分析。结果表明,ShSAP1的5＇UTR区有两段内含子,大小分别为202 bp和1 052 bp,在Badila中有1~2个拷贝;ShSAP1在甘蔗成熟植株根茎叶中均有表达,在茎秆中的表达量随着茎节成熟而递增;在幼苗阶段,ShSAP1的表达能被高盐、模拟干旱、GA3、ABA和ET诱导增强。以上结果表明,ShSAP1可能在甘蔗成熟与逆境应答中具有重要作用。; 李晓君蔡文伟张树珍许莉萍陈萍王俊刚; 关键词：甘蔗 SAP 非生物胁迫

甘蔗MYB2转录因子的电子克隆和生物信息学分析被引量：20: 2011年; 用电子克隆方法获得甘蔗MYB2基因,采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明:甘蔗MYB2基因全长991bp,包含570bp的ORF,编码189个氨基酸。甘蔗MYB2基因包含有MYB功能域,在序列组成、高级结构及活性位点等方面,与玉米等其它植物的MYB2基因具有高度的相似性。研究结果为该基因的实验克隆奠定基础。; 李国印阙友雄许莉萍郭晋隆闫学兵陈如凯; 关键词：甘蔗电子克隆生物信息学

Cry2A基因植物表达载体构建及其转化子生长曲线的建立: 2010年; 根据定向克隆原则,以pCAMBIA2301为载体骨架,Cry2A基因为目的基因,构建了大小为15354 bp的植物表达载体p2AST2301。新载体带有抗虫基因Cry2A和筛选标记基因NPTⅡ,适合通过农杆菌进行遗传转化,并以抗生素G418为筛选底物。同时将新载体转化根癌农杆菌EHA105,获得了用于植物遗传转化的工程菌,并且明确了工程菌D600 nm值在1.0-1.6之间活力最强。; 高世武郭晋隆许莉萍杨颖颖陈如凯; 关键词：根癌农杆菌

甘蔗液泡ATP酶C亚基基因克隆及序列分析被引量：3: 2010年; 根据筛选文库时获得的EST序列信息,利用RACE技术分离了一个甘蔗ATP酶C亚基基因,命名为ShVHA-C。该基因cDNA全长1 312 bp,含有1 056 bp的完整阅读框架,编码351个氨基酸。序列比对及结构预测分析表明,ShVHA-C编码的氨基酸序列与水稻、小麦、苜蓿、绿豆和蓖麻中相应基因氨基酸序列的一致性分别达到94.10%、93.22%、91.15%、91.15%和91.74%,与水稻一致性最高。在整个二级结构中,含有233个α-螺旋(alpha helix),占66.38%;含有5个延伸链(extended strand),占1.42%;含有113个无规则卷曲(random coil),占32.19%。此蛋白不具有导肽。整个多肽链表现为亲水性,没有明显的疏水区域,初步认为甘蔗ShVHA-C编码蛋白是亲水性蛋白。; 许志宇王俊刚杨本鹏张树珍; 关键词：甘蔗糖分积累 V-ATPASE

全选清除导出

共1页<1>

引进国际先进农业科技计划(2010-C21)