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国家自然科学基金(30860178)

作品数:5 被引量:20H指数:4
相关作者:和凤美朱永平杨晓虹武芸芸田璐更多>>
相关机构:云南农业大学昆明学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 5篇中文期刊文章

领域

  • 3篇农业科学
  • 2篇生物学

主题

  • 3篇基因
  • 2篇基因家族
  • 1篇多靶点
  • 1篇抑制消减杂交
  • 1篇杂交
  • 1篇舌瓣
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇生物信息学分...
  • 1篇石斛
  • 1篇特异
  • 1篇特异表达
  • 1篇铁皮石斛
  • 1篇奇花
  • 1篇总RNA
  • 1篇总RNA提取
  • 1篇文库构建
  • 1篇系统进化树
  • 1篇纤维素
  • 1篇纤维素合成酶

机构

  • 5篇云南农业大学
  • 2篇昆明学院

作者

  • 5篇和凤美
  • 4篇朱永平
  • 2篇田璐
  • 2篇杨晓虹
  • 2篇武芸芸
  • 1篇关文灵
  • 1篇吴红芝
  • 1篇杨德

传媒

  • 1篇河南农业科学
  • 1篇西北植物学报
  • 1篇植物研究
  • 1篇分子植物育种
  • 1篇现代农业科技

年份

  • 1篇2019
  • 1篇2018
  • 1篇2012
  • 1篇2011
  • 1篇2010
5 条 记 录,以下是 1-5
排序方式:
铁皮石斛纤维素合成酶超级基因家族生物信息学分析被引量:6
2019年
纤维素合成酶超级基因家族是植物体纤维素合成的重要基因。为研究铁皮石斛纤维素合成酶和类纤维素合成酶基因(CESA/CSL)家族的功能,利用从铁皮石斛转录组中鉴定出的32个在茎中高表达量的纤维素合成酶超级基因家族成员为研究对象,使用MEGA5.0、GSDS、SMART、TMHMM、WoLFPSORT等软件对其构建系统进化树,并对基因结构及蛋白质保守结构域、跨膜结构和亚细胞定位等进行综合分析。结果显示,CESA/CSL基因在铁皮石斛不同组织中表达的数目和表达量均不同,具有组织表达特异性。铁皮石斛茎中表达量较高的CESA/CSL基因家族可分为6个亚族,外显子数目1~21个。CESA/CSL基因编码的蛋白质保守性较强,除CSLA亚族外,其余亚族均含有该基因家族的保守结构域Cellulosesynthase。CESA/CSL蛋白主要分布于质膜上,大部分具有跨膜结构域。
兰晓天胡淞冯磊田英男和凤美
关键词:铁皮石斛生物信息学基因表达
墨兰多舌奇花MADS特异表达基因筛选及分析被引量:5
2011年
以墨兰‘南菊’为代表,用抑制消减杂交和基因芯片相结合技术构建墨兰多舌与正格花舌间的差异表达基因文库,筛选与花形态建成相关的MADS差异表达基因并构建系统进化树。结果表明:在多舌瓣中筛选出32个上调表达MADS基因,包括TM6、AG、AP1、DEF1、AP3及PI基因。其中有10个基因与AGL17、AGL29、FUI聚为一类,12个基因与其他的MADS基因归为一类。这些MADS基因参与了多舌瓣发生,并可能扮演了重要角色。该研究可为从兰花多舌变化的角度阐明墨兰奇花形成的分子机理及培育中国兰花新奇优良品种提供思路和理论依据。
朱永平杨德杨晓虹关文灵吴红芝和凤美
关键词:基因家族系统进化树
莲瓣王捧瓣与舌瓣SSH文库构建及EST序列分析
2012年
为了探索兰花舌瓣形成的分子机制,本研究利用消减抑制杂交技术构建了莲瓣王(Cymbidium lianpanTang et Wang)捧瓣与舌瓣间的cDNA文库。对正向文库中随机挑选的147个阳性克隆测序,组装、拼接,找到37个唯一序列,其中包含25个单一序列和12个拼接序列。经同源性比对,这些EST分别归类于蛋白质折叠,结合、未知功能、应激反应、光合作用、转录调控、信号传导、生物合成、新陈代谢、MADS等10类。通过对MADS-box基因的系统进化树分析,可初步推测MADS-Contig1和MADS-Contig2属于A类基因中的SQUA-like亚家族基因。
武芸芸田璐朱永平和凤美
关键词:舌瓣抑制消减杂交
墨兰B类PI基因多靶点CRISPR/Cas9载体构建被引量:4
2018年
MADS基因家族对植物成花具有重要作用,在兰花中,目前还没有利用CRISPR/Cas9进行基因编辑的相关报道。墨兰(Cymbidium sinense) B类PISTILLATA (PI)基因可能与墨兰舌瓣的形成有关,为了进一步验证其PI基因的功能,本研究利用在线软件CRISPR-P设计3个靶点,并采用Overlapping-PCR技术和Golden Gate cloning策略构建了墨兰PI基因CRISPR/Cas9的多重sg RNA载体系统,经PCR、酶切和测序验证,植物编辑载体已构建成功。为在墨兰中实现该基因的定向突变提供了理论依据,同时也为在兰花基因组中应用CRISPR/Cas9基因编辑技术进行基因的定点突变修饰提供参考。
吴林鲜兰晓天朱永平胡淞田英男冯磊刘修远万希文何静和凤美
关键词:MADS-BOXPI基因功能
墨兰舌瓣总RNA提取方法比较研究被引量:6
2010年
为获得墨兰舌瓣总RNA最佳提取方法,以墨兰"南菊"舌瓣为材料,利用CTAB法、华舜植物叶总RNA提取试剂盒、Trizol法、天根RNAsimple总RNA提取试剂盒、Bioteke通用植物总RNA提取试剂盒、Bioteke通用植物总RNA提取试剂盒DNaseI过柱消化法、宝生物RNAiso-mate for Plant Tissue及宝生物RNAiso-mate for Plant Tissue改良法提取舌瓣总RNA。通过RNA产率、纯度、电泳图谱和RT-PCR等分析,确立适用于墨兰舌瓣RNA分离的方法。结果表明:宝生物RNAiso-mate for Plant Tissue改良法提取的RNA除了28S,18S,5SrRNA清晰条带外,RNA的得率和纯度优于其他供试方法。RT-PCR结果进一步证实宝生物RNAiso-mate for Plant Tissue改良法提取的总RNA可用于进一步的分子生物学试验。
朱永平田璐武芸芸和凤美杨晓虹
关键词:总RNA
共1页<1>
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