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国家自然科学基金(30640048)

作品数：9 被引量：42H指数：4
相关作者：聂刘旺张莉陈文郑萍萍曹承和更多>>
相关机构：安徽师范大学黄山学院更多>>
发文基金：国家自然科学基金安徽省高校生物环境与生态安全重点实验室基金安徽省学术与技术带头人基金更多>>
相关领域：生物学更多>>

文献类型

  • 9篇中文期刊文章

领域

  • 9篇生物学

主题

  • 3篇控制区
  • 2篇线粒体控制区
  • 2篇SMART技...
  • 2篇CDNA文库
  • 1篇大蟾蜍
  • 1篇大鳄龟
  • 1篇地理居群
  • 1篇英文
  • 1篇中华鳖
  • 1篇中华大蟾蜍
  • 1篇饰纹姬蛙
  • 1篇平胸龟
  • 1篇全长
  • 1篇总RNA
  • 1篇蟾蜍
  • 1篇鳄龟
  • 1篇微卫星
  • 1篇系统发生关系
  • 1篇系统进化
  • 1篇系统进化关系

机构

  • 8篇安徽师范大学
  • 1篇黄山学院

作者

  • 8篇聂刘旺
  • 2篇曹承和
  • 2篇郑萍萍
  • 2篇陈文
  • 2篇张莉
  • 1篇唐鑫生
  • 1篇芮金龙
  • 1篇李洁
  • 1篇张雁
  • 1篇汪宁
  • 1篇葛永斌
  • 1篇彭巧玲
  • 1篇宋娇莲
  • 1篇许竟成
  • 1篇张颖
  • 1篇熊磊
  • 1篇颜亮

传媒

  • 2篇生命科学研究
  • 2篇生物学杂志
  • 2篇Zoolog...
  • 1篇动物学杂志
  • 1篇Journa...
  • 1篇安徽师范大学...

年份

  • 1篇2010
  • 3篇2008
  • 5篇2007
共 9 条 记 录，以下是 1-9
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排序方式：
黑斑蛙精巢组织cDNA文库的构建及泛素基因序列的分析(英文)被引量：3
2007年
采用SMART(switching mechanismat 5 end of RNA transcript)技术构建了黑斑蛙(Rana nigromaculata)精巢组织全长cDNA文库。一步法提取成体蛙精巢组织总RNA,用PowerscriptTM反转录酶逆转录合成第一链cD-NA;再用LD-PCR合成双链cDNA;经过SfiⅠ酶切和Chroma spin-400柱分离后,500bp以上的片段与λTriplEx2载体连接,再用GigapackⅢGold Packaging Extract包装蛋白包装,即获得原始文库。原始文库进行扩增后得到扩增文库。经检测原始文库的滴度分别为2.0×106pfu/mL和2.4×106pfu/mL,扩增后的文库滴度分别为0.48×109pfu/mL和3.0×109pfu/mL,重组率均在90%以上。通过E.coliBM25.8菌株将文库转化为pTriplEx2质粒,挑选一阳性克隆进行PCR检测,其插入片段平均长度约为1.0kb。挑取一阳性克隆分别从5′端和3′端进行测序,得到一长约1171bp的序列。经序列分析知,该序列含有完整的编码框,可编码305个氨基酸,是一全长cDNA序列。提示所建文库是可以用于全长cDNA的筛选。结果表明,所构建的黑斑蛙精巢组织cDNA文库的各项指标均满足建库的基本要求。该文库将为蛙类及两栖类的已知或未知的功能基因及新基因的获得及其研究提供可靠资源;另外,该文库还将为研究蛙类动物的性别决定和分化相关基因及其表达提供直接的分子资料。
郑萍萍陈文李洁芮金龙聂刘旺
关键词：黑斑蛙总RNASMART技术CDNA文库泛素
鳄龟科和平胸龟科线粒体控制区序列分析和结构比较被引量：10
2008年
本文参照龟类近缘种的线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)控制区(control region,CR)及邻接序列,设计了二对特异引物,采用PCR和测序技术,获得了大鳄龟(Macroclemys temminckii)、小鳄龟(Chelydra serpentina)和平胸龟(Platysternon megacephalum)mtDNA CR区序列,其长度分别为1062bp、1124bp和1119bp;A+T的含量分别为68.93%、69.34%和69.44%。序列分析显示,三种龟CR区3'末端均存在丰富的微卫星序列,其中大鳄龟和小鳄龟各有一段2bp的TA序列分别重复20和15次;小鳄龟另有一段5bp的TATAT序列重复13次;平胸龟则是一段10bp的AGTATGTTAT序列重复4次和一段17bp的GTTGTTATATAACATAT序列重复13次。本文还结合GenBank中已发表的其他6种龟鳖类动物的控制区序列,探讨了龟鳖类动物微卫星序列的类型及分布,结果表明:9种龟鳖类动物都存在丰富的微卫星序列,且微卫星所在位置及序列存在很大差异。
颜亮张雁汪宁张莉聂刘旺
关键词：大鳄龟小鳄龟平胸龟控制区微卫星
基于线粒体ND4基因探讨水龟组系统发生关系(英文)被引量：2
2007年
水龟组由旧大陆潮龟科的拟水龟属、眼斑龟属和新大陆龟科的水龟属组成,这三个属以前一直被认为是同属的,但没有得到形态学和染色体等方面的认同.本文测定了四眼斑水龟和黄喉拟水龟线粒体基因组的ND4基因,用部分ND4基因及相邻tRNA基因共985bp的序列(包含简约信息位点235bp)讨论了它们的系统进化关系.MP树和ML树显示:在水龟属中,牟氏水龟和木雕水龟亲缘关系最近,与星点水龟亲缘关系次之,石纹水龟位于水龟属的基部,与水龟属其它物种的亲缘关系较远.拟水龟属与眼斑龟属在潮龟科是姐妹群关系,但与龟科水电属亲缘关系较远.本文结果支持潮龟科和龟科的单系起源,二者为非姐妹群.
聂刘旺宋娇莲张颖曹承和
关键词：系统进化关系ND4基因
中华大蟾蜍精巢组织全长cDNA文库的构建及泛素延伸蛋白基因Bg-ubi52的获得被引量：10
2007年
运用SMART技术构建了中华大蟾蜍（Bufo bufo gargarizans）精巢全长cDNA文库。提取中华大蟾蜍精巢总RNA，用Clontech公司SMART^TM cDNA文库构建试剂盒反转录合成第一链cDNA，LD-PCR扩增获得全长cDNA双链；经SfiⅠ酶切、层析柱分离后，500bp以上的片段与λTriplEx2载体连接并包装，建成原始文库。经鉴定，原始文库滴度为2．21×10^6pfu／ml，重组率为91％；文库扩增后的滴度为2．94×10^9pfu／ml，重组率为93．7％。插入片段大小分布于0．4～2．0kb之间，平均长度约为1．0kb，说明已构建文库质量较高，为进一步筛选、克隆精巢特异表达基因奠定了基础。从该文库中克隆到了泛素延伸蛋白基因，全长561bp，包含完整的5′和3′非编码区，编码128个氨基酸，即泛素的76个氨基酸后融合了52个氮基酸的核糖体L40蛋白。
陈文郑萍萍聂刘旺
关键词：中华大蟾蜍CDNA文库SMART技术
The complete mitochondrial genome of the Keeled box turtle Pyxidea mouhotii and phylogenetic analysis of major turtle groups被引量：3
2008年
The complete mitochondrial genome (16,837 bp) from the Keeled box turtle (Pyxidea mouhotii) was determined. The genome content, gene order, and base composition conformed to the consensus vertebrate type mtDNA. However, a remarkable feature was found in this molecule: a large number of (ATTATATC) n direct tandem repeats followed by (TA) n microsatellite at the 3′ end of the control region (D-loop), which might be useful as molecular markers for studying population genetics and helpful for species identification and conser- vation. Besides, to review phylogenetic relationships among major turtle lineages, maximum-likelihood (ML) and Bayesian (BI) analyses were conducted based on concatenated sequences of 13 protein-coding genes from 16 taxa. The resultant ML and BI analyses showed homological topologies, which only differed on the exact placement of Platysternon. Nevertheless, the results strongly supported that 1) Pyxidea mouhotii and Cuora aurocapitata formed a monophyletic clade, whereas Cyclemys atripons was not closer to the Pyxidea-Cuora than to Chinemys reevesii, suggesting that Cyclemys and the Cuora group (containing Pyxidea) may have originated from two ancestors; 2) the Geoemydidae with Testudinidae was a sister group rather than with the Emydidae.
Li Zhang Liuwang Nie Chenghe Cao Ying Zhang
关键词：线粒体基因组海龟
龟鳖类线粒体全基因组的比较研究被引量：7
2007年
在基因组水平上,比较分析了已登录GenBank的19种龟鳖类线粒体全基因组的结构特征.结果表明:1)除平胸龟、扁陆龟外,其余17种龟鳖类线粒体基因组结构、基因排列顺序均与典型的脊椎动物相似,显示龟鳖类线粒体基因组在进化上十分保守:2)19种龟鳖类线粒体全基因组和各部分的碱基组成均表现出高AT、低G含量的偏向,在控制区中表现尤为明显:3)除中华鳖和白腹摄龟外,其余种类的某些蛋白编码基因中都存在一个或多个额外插入的核苷酸:4)除侧颈龟亚目的非洲侧颈龟外,其余18种曲颈龟线粒体DNA的"WANCY"区中都存在轻链复制起始点(OL),且它们的二级结构、核苷酸组成高度保守,推测该结构可能是曲颈龟亚目的一个共同特征:5)部分龟鳖类线粒体基因组控制区3′端存在大片段(200￣450 bp)的重复序列,某些龟鳖类中有由(AT)构成的微卫星序列,并且这些拷贝序列在种间表现出一定的差异,其可作为特异的分子标记,对于龟鳖类动物系统学的研究、亲缘关系的鉴定、物种多样性的保护和研究等方面具有重要的参考价值.
张莉聂刘旺
关键词：线粒体全基因组基因组结构控制区串联重复序列
不同产地中华鳖的线粒体控制区序列分析及结构比较被引量：2
2010年
采用PCR特异引物,扩增了两产地中华鳖(Pelodiscus sinensis)个体的mtDNA控制区(CR)及其邻近片段,测序获得了长度分别为1830bp和1630bp的序列。结合GenBank中已发表的韩国产中华鳖mtDNA的CR区序列,比较了3个产地中华鳖的CR区结构。分析显示:中华鳖不同产地mtDNA CR区DNA中的A+T含量分别为60.5%、63.6%和64.8%,它们的5′、3′末端以及CSB1-CSB2之间均存在丰富的可变数目串联重复序列(variable numbers oftandem repeats,VNTR)。基于mtDNA CR区序列和结构分析,显示中华鳖不同产地的野生个体中存在丰富的遗传多样性。
熊磊聂刘旺
关键词：中华鳖线粒体DNA控制区
福建大头蛙五个地理居群核型多样性被引量：1
2007年
采用骨髓细胞蒸汽固定法制备染色体标本,研究了产于安徽、浙江、江西、福建和湖南5个地理居群福建大头蛙的核型。结果表明:5居群样本的细胞染色体数均为2n=22,NF=44,核型模式为7+4。福建居群11对染色体全为中部着丝粒染色体;其它4个居群中的NO.3为亚中部着丝粒染色体,其余为中部着丝粒染色体;各居群中NO.3和NO.7的相对长度和臂比值存在显著或极显著差异。显示不同地理居群福建大头蛙的核型具有丰富的多样性。
许竟成唐鑫生彭巧玲聂刘旺
关键词：居群福建大头蛙
饰纹姬蛙7个Dmrt基因DM结构域的克隆及序列分析被引量：5
2008年
采用简并PCR技术扩增了饰纹姬蛙(Microhyla ornata)Dmrt基因的DM结构域,经分子克隆、SSCP和DNA序列分析,获得了该基因家族的7个成员并分别命名为MoDmrt1a、MoDmrt1b、MoDmrt3a1、MoDmrt3a2、MoDmrt3a3、MoDmrt3b和MoDmrt5.与不同进化地位其他动物相关的Dmrt基因进行比对和聚类分析,结果显示该基因在系统进化上具有高度的保守性.
葛永斌曹承和聂刘旺
关键词：饰纹姬蛙DMRT基因DM结构域简并PCR保守性
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