云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(2009CI061)
- 作品数：8 被引量：35H指数：4
- 相关作者：宋建领张富强张文东赵焕云李华春更多>>
- 相关机构：云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室成都军区疾病预防控制中心云南农业大学更多>>
- 发文基金：云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目云南省高层次科技人才培引工程云南省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 猪繁殖与呼吸综合征病毒通用型实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立及初步应用被引量：7
- 2012年
- 根据GenBank登录的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)北美型毒株和欧洲型毒株N蛋白基因保守序列,设计1对特异性引物和1条探针,以ABI公司PRRSV RNA为标准品,优化了PRRSV实时荧光定量RT-PCR检测方法,25μL反应体系引物prrsv-f/prrsv-r(20μmol/L)各0.5μL,探针prrsv-p(10μmol/L)0.5μL为反应最佳工作浓度,标准曲线Ct值和模板启始浓度的log值之间具有良好的线性相关性。特异性、敏感性和重复性检测结果显示,该方法能特异的检测PRRSV北美型毒株和欧洲型毒株,与其他主要猪病病原检测无交叉反应;针对PRRSV RNA标准品检测,灵敏度可以达到10拷贝;重复性检测Ct值变异系数为0.74%～1.52%。用建立的实时荧光定量RT-PCR检测方法,对40份临床样品检测,与商品化试剂盒检测结果完全一致。
- 宋建领高华峰信爱国李华春
- 关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒荧光定量RT-PCR
- 云南2008～2009年H9N2亚型禽流感病毒血凝素和神经氨酸酶基因序列分析被引量：4
- 2011年
- 禽流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)是病毒粒子表面抗原,是亚型划分的重要依据。从云南分离的H9N2亚型禽流感病毒感染鸡胚尿囊液中提取总RNA,采用特异性引物经RT-PCR分别扩增云南毒株10个HA和9个NA基因,纯化后克隆至pMD18-T载体,并对其进行测序。序列比对及系统发育分析结果表明:云南H9N2毒株HA基因核苷酸序列同源性为95.0%～99.7%;NA基因核苷酸序列同源性为86.2%～99.6%。在进化分枝中HA基因均属于欧亚分枝的类CBJ194亚分枝,与CBJ194的核苷酸序列同源性为92.0%～99.1%,NA基因属于CK/BJ/1/94和QaHKG1/97两个分枝。云南毒株HA裂解位点结构具有低致病性病毒分子特征;HA受体结合位点143、145、198和234位氨基酸存在变异,尤其234位氨基酸全部变为L,呈现了人流感受体结合特性。NA糖基化位点61～63、86～88部分毒株存在缺失,部分毒株在143～145位出现新的糖基化位点。
- 宋建领叶丛华田建国张文东赵焕云吕粤岳亮邱薇刘加茂冯子良张思东范泉水张应国张富强
- 关键词：禽流感病毒H9N2亚型血凝素神经氨酸酶
- 云南2株基因Ⅱ型新城疫病毒F基因变异特性分析被引量：6
- 2014年
- 对云南省2个发病鸡场的组织病料进行病原分离，通过血凝、血凝抑制试验和RT-PCR检测，证明分离毒株为新城疫病毒（Newcastle disease virus，NDV）。采用特异性引物经RT-PCR扩增F基因，纯化后克隆至pMD18-T载体，并对其进行测序。序列比对及系统发育分析结果表明，分离获得的云南省2株NDV毒株F基因核苷酸与La Sota株的核苷酸同源性为99．4％～99．6％，与国内外分离的流行毒株SP13和NDV027344核苷酸同源性均为99．7％～99．8％，与F48E9株的核苷酸同源性为89．0％～89．1％；F蛋白氨基酸与La Sota株的氨基酸同源性为99．3％～99．5％，与流行毒株SP13和NDV027344的氨基酸同源性均为99．5％～99．6％，与F48E9株的氨基酸同源性为91．8％～92．0％。系统发育分析结果表明，2株病毒均属于基因Ⅱ型，裂解位点氨基酸为G-R-Q-G-R L，属于弱毒株裂解位点氨基酸排列特征。
- 张文东宋建领赵焕云刘庆亮胡媛媛曾伟张富强
- 关键词：新城疫病毒F基因
- 禽流感病毒M1蛋白表(拟)位定位及免疫检测分析被引量：1
- 2012年
- 为对禽流感病毒(AIV)M1蛋白表(拟)位进行分析,本研究采用针对AIV M1蛋白的型特异性单克隆抗体(MAb),淘选M13噬菌体展示的7肽随机肽库,进行M1蛋白表(拟)位分析。筛选获得共有序列MDRxL或HPR,定位于M1蛋白93～99位(93MDRAVKL99)和222～230位(222HPNSSAGLR230)氨基酸区域。采用ELISA、竞争性ELISA分析不同噬菌体拟位与抗M1的MAb免疫反应性,表明含有MDRxL或HPR基序的噬菌体拟位能够与MAb发生特异性结合,并且其结合能够被天然病毒抗原抑制或阻断,表明拟位多肽真实模拟病毒蛋白上与MAb结合的抗原决定簇或表位,提示M1蛋白93～99位(93MDRAVKL99)和222～230位(222HPNSSAGLR230)氨基酸区域构成AIV型特异性表位。
- 宋建领张富强李华春杨仕标王金萍
- 关键词：禽流感单克隆抗体表位
- 2009年-2014年云南边境禽流感病毒H5N1亚型神经氨酸酶基因进化分析被引量：2
- 2015年
- 为了解云南边境禽流感病毒H5N1亚型神经氨酸酶(NA)基因变异及进化特征,2009年-2014年期间在云南边境采集境外家禽和野生鸟类棉拭子样品1 500份,经禽流感H5/N1亚型病毒特异性多重RT-PCR检测,对阳性样品进行病毒NA基因扩增、纯化、克隆和测序,并与已知毒株和参考毒株进行序列比对及系统进化分析。结果从1 500份样品中检出禽流感病毒H5N1亚型阳性样品60份;60阳性样品病毒HA基因测序获得21种NA序列,可划分为4个不同进化分支。NA基因与HA基因呈现不同进化关系;云南边境毒株NA aa275位点未发生变异,因此变异毒株对神经氨酸酶抑制剂Oseltamivir(达菲)类抗病毒药物可能无抗性或耐药性;2009年-2014年期间云南边境H5N1亚型病毒NA间具有遗传差异,NA基因进化分支4已成为当地流行的优势毒株。
- 曾伟刘庆亮孔强张文东胡媛媛胡挺松赵焕云段博芳邱薇范泉水张应国宋建领张富强
- 关键词：禽流感病毒H5N1亚型神经氨酸酶基因
- 猪肺炎支原体实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用被引量：8
- 2013年
- 根据GenBank登录的猪肺炎支原体黏附素P97基因(U50901)序列,设计1对特异性引物和1条探针,优化了猪肺炎支原体实时荧光定量PCR检测方法。25μL反应体系,引物MhpF/MhpR(20μmol/L)各0.5μL,探针MhpP(20μmol/L)0.5μL为反应最佳工作浓度,标准曲线Ct值和模板启始浓度的log值之间的线性相关系数为0.997。特异性、敏感性和重复性检测结果显示,该方法能特异地检测猪肺炎支原体,与猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒、伪狂犬病毒、乙型脑炎病毒,猪细小病毒、猪圆环病毒等病原检测无交叉反应;针对猪肺炎支原体阳性质粒标准品检测,灵敏度可以达到10拷贝;重复性检测Ct值变异系数在0.78%～1.16%之间。用建立的实时荧光定量PCR检测方法,对40份临床样品检测,结果表明肺脏拭子与肺脏悬液阳性率完全一致,而鼻腔拭子检出率较低。
- 宋建领高华峰信爱国孙强王娟李华春
- 关键词：猪肺炎支原体荧光定量PCR
- 新城疫病毒云南分离株F基因变异特性分析被引量：4
- 2010年
- 采用RT-PCR技术对云南2007年-2009年采集的948份喉气管拭子或组织样品中新城疫病毒F基因进行检测,获得阳性样品65份,选择30份代表性阳性样品采用特异性引物经RT-PCR扩增F基因,纯化后克隆至pMD18-T载体,并对其进行测序。序列比对及系统发育分析结果表明,新城疫病毒云南分离株F基因核苷酸与疫苗LaSota株之间的同源性为70.5%～99.8%,与F48E9株之间的同源性为70.7%～90.8%。系统发育分析表明,30株病毒中21株属于基因型Ⅶ,裂解位点氨基酸为R-R-Q-K-R-F,与传统认为强毒裂解位点氨基酸序列相同;7株属于基因型Ⅱ,5株裂解位点氨基酸为G-R-Q-G-R-L,属于弱毒株裂解位点氨基酸排列特征,2株裂解位点氨基酸为R-R-Q-K-R-F属于强毒裂解位点氨基酸序列;2株病毒与9个基因型的同源性差异较远。
- 宋建领田建国叶丛华张文东赵焕云吕粤岳亮王金萍邱薇冯子良张思东范泉水张应国张富强
- 关键词：新城疫病毒F基因基因型
- 云南省禽流感、新城疫与3种免疫抑制性病原共感染的检测被引量：4
- 2010年
- 为调查云南省禽流感病毒、新城疫病毒与免疫抑制性病毒混合感染的情况,对云南省2007年1月～2009年10月期间145份禽流感阳性及30份新城疫阳性样品进行禽网状内皮增生病病毒(REV)、J亚群禽白血病病毒(ALV-J)及鸡传染性贫血病毒(CIAV)的检测。禽流感阳性样品中ALV-J的感染阳性率为15.9%,REV的感染阳性率为22.8%,CIAV的感染阳性率为26.9%;新城疫阳性样品中ALV-J的感染阳性率为13.3%,REV的感染阳性率为23.3%,CIAV的感染阳性率为26.7%;共有30份样品发生多重感染,多重感染率为17.1%。对不同区域的4份禽白血病病毒阳性样品、10份禽网状内皮增生病病毒阳性样品、10份禽传染性贫血病毒阳性样品进行了序列比对和系统发育分析。结果表明,云南ALV-J毒株gp85基因与国内外毒株核苷酸及氨基酸同源性分别介于80.4%～96.7%、85.2%～94.5%;REV毒株env基因核苷酸及氨基酸之间的同源性为98.8%～99.8%、97.7%～99.5%;CIAV毒株vp2基因核苷酸及氨基酸之间的同源性为92.4%～100.0%、93.7%～100.0%。
- 宋建领石凤海田建国叶丛华张文东赵焕云吕粤岳亮李华春邱薇冯子良张思东范泉水张应国张富强
- 关键词：新城疫病毒GP85基因ENV基因VP2基因
