山东省医药卫生科技发展计划项目(2011HZ058)
- 作品数:3 被引量:10H指数:2
- 相关作者:徐爱强刘尧林小娟杨静王海岩更多>>
- 相关机构:山东大学山东省疾病预防控制中心济宁医学院更多>>
- 发文基金:山东省医药卫生科技发展计划项目山东科技发展计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 临沂市脑膜炎/脑炎症候群监测病例埃可病毒30型的分离及其基因特征分析
- 2011年
- 目的 调查山东省临沂市脑膜炎/脑炎症候群(AMES)病例中人类肠道病毒病原谱的构成,分析主要病原体埃可病毒30型的基因特征.方法 采集AMES病例的脑脊液、粪便和(或)咽拭子标本,所有标本经预处理后,接种RD、Hep-2细胞分离病毒,阳性分离物采用血清学和分子生物学方法鉴定型别,与GenBank检索到的其他Echo30毒株进行同源性比较,并构建VP1完整编码区系统进化树研究其遗传进化规律.结果 2010年4-12月,共采集101例病例的222份标本(脑脊液56份,咽拭子94份,粪便72份),其中34例患者的47份标本(脑脊液4份,咽拭子18份,粪便25份)中分离到HEV,11例鉴定为Echo30.通过同源性分析,发现其核苷酸同源性与2003年山东省泰安市、章丘市及江苏省分离株最近(91.2%~95.4%),与原型株差异较大(17.9%~19.6%);11株临沂分离株之间核苷酸差异为0~10.2%.系统进化树分析显示,临沂分离株属于基因型6的3个不同分支,提示来自3个传播链的Echo30病毒在临沂市共同循环.结论 山东省临沂市2010年AMES病例标本的优势分离株为Echo30,与国外分离株属于不同的进化分支,具有不同的基因特征.
- 杨静张晓丽陶泽新王海岩林小娟季圣翔刘尧张玉军徐爱强
- 关键词:脑炎病毒性种系发生
- 山东省急性出血性结膜炎病原学鉴定及其柯萨奇A24病毒基因特征分析被引量:5
- 2012年
- 为明确2010年引起山东省青岛市、临沂市急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)流行的病原,采集26例患者的眼结膜拭子标本,分别采用实时荧光定量PCR(Real time-PCR)和细胞培养方法进行检测。Real time-PCR结果显示,17份标本柯萨奇病毒A组24型(Coxsackievirus A24,CVA24)阳性,阳性率为65.39%,肠道病毒70型(Enterovirus 70,EV70)和腺病毒均为阴性;使用Hep-2细胞共分离到10株病毒,通过VP1区基因扩增及核苷酸序列测定,10株病毒均鉴定为CVA24,同源性分析显示其核苷酸和氨基酸同源性分别为99.3%~100.0%和99.5%~100.0%,在系统进化树上聚集成一簇,本次分离的毒株与山东省急性弛缓性麻痹(AFP)病例中分离到的毒株序列差异较大,分别属于5个不同的进化分支。提示CVA24可能为引起两地AHC流行的病原,且属于同一传播链。
- 杨静林艺王海岩陶泽新李岩陈鹏裴耀文纪峰林小娟王显军刘尧徐爱强
- 关键词:急性出血性结膜炎分子进化
- 基于环境污水监测的埃可病毒11型的循环动态变化及其基因特征分析被引量:5
- 2014年
- 为探讨山东省环境污水监测中埃可病毒11型(Echovirus 11,Echo11)的动态变化及分子流行病学特征,本研究对山东省2011~2012年环境污水监测分离到的Echo11毒株进行了VP1区核酸扩增和序列测定,并与1994~2010年山东省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)监测系统中Echo11分离株以及国外同型毒株进行同源性分析和系统发生学分析。结果显示:2011~2012年山东省济南市和临沂市共分离到Echo11 94株,其时间分布具有季节性特征,夏秋季高峰明显。分离毒株之间核苷酸和氨基酸同源性分别为89.5%~100.0%和95.4%~100.0%;与原型株(Gregory)之间核苷酸和氨基酸同源性分别为76.6%~79.7%和90.4%~92.5%。山东环境分离株全部属于A基因型,毒株之间核苷酸变异较大,提示山东地区存在多个传播链共循环。本研究描述了山东省环境污水中Echo11分离株的动态变化和遗传特征,结果证明环境污水监测是探索人类肠道病毒动态流行和遗传变异的重要手段。
- 李文凤陶泽新杨静林小娟刘尧纪峰王海岩王素婷宋立志徐爱强
- 关键词:基因特征分子流行病学环境监测