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黑线仓鼠KiSS-1基因的生物信息学与系统进化研究被引量：2: 2012年; 采用RT-PCR技术克隆得到黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)KiSS-1基因的部分序列,并进行生物信息学分析。结果表明:该段序列共429bp,包含部分5'非翻译区、转录起始位点、信号肽序列以及主要的活性区域。黑线仓鼠KiSS-1编码的蛋白质是一种胞外分泌的亲水性蛋白质,N端含有19个氨基酸组成的信号肽序列,67、121-122位各有一个水解位点,68、69处的磷酸化位点可能与蛋白质活性的获得有关。二级结构预测含有较多的α螺旋和自由卷曲,115-119位的α螺旋在与受体结合中有重要作用。系统进化分析证实该序列与其他物种有较高的同源性,说明该基因在进化中相对保守。通过生物信息学与系统进化分析,有助于进一步揭示KiSS-1的转运加工途径及作用机制。; 张强卜凡莉徐金会薛慧良杨月伟徐来祥; 关键词：黑线仓鼠 KISS-1 生物信息学系统进化分析

黑线仓鼠PPARβ部分编码区克隆与结构特征: 2012年; 参考黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)近缘种PPARβ的cDNA序列设计引物,采用RT-PCR法克隆得到黑线仓鼠PPARβ部分序列,并翻译成氨基酸.利用该结果与其他物种核苷酸及氨基酸序列进行相似性比较、构建系统进化树、一级结构分析、二级结构和空间结构预测.结果表明:得到的480 bp PPARβ序列包括部分外显子4,全部外显子5、6及部分外显子7;共编码159个氨基酸;除人之外,黑线仓鼠PPARβ基因与其他物种的核苷酸相似性均在88%-94%之间,氨基酸相似性均在90%以上;构建进化树得出,黑线仓鼠与鼠类亲缘关系最近,与人的亲缘关系最远;疏水性分析、二级结构预显示该编码区亲水性较强;二级结构、空间结构预测显示该序列含α螺旋较多;空间结构预测看出该段区域含两个典型的锌指结构.; 郑莹莹徐来祥徐金会薛慧良陈蕾; 关键词：黑线仓鼠克隆系统进化空间结构锌指结构

黑线仓鼠CRH基因的编码序列及系统进化分析被引量：2: 2012年; 为探究黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)繁殖功能与促肾上腺皮质激素释放激素(CRH)基因结构的关系,参考近缘种的cDNA序列设计引物,采用RT-PCR法克隆得到了黑线仓鼠CRH基因的部分序列,克隆得到长度为1 112 bp,为外显子1和外显子2的部分序列,包括全部编码区序列564 bp;编码区共编码187个氨基酸,GenBank登录号为JQ416143。利用编码区序列构建系统进化树,结果显示,黑线仓鼠与大鼠、小鼠亲缘关系最近,与其他哺乳动物亲缘关系较近,而与原鸡亲缘关系最远,此结果与物种的进化关系相一致。同时对其编码的蛋白质进行一级结构分析及二级、三级结构预测,得到了CRH的信号肽序列和41个氨基酸组成。本研究首次报道了黑线仓鼠的CRH基因序列,为进一步探究CRH基因奠定基础,对系统分析CRH的功能具有重要的参考价值,同时该cDNA序列可作为物种亲缘关系或遗传距离研究的理想标记。; 张琪薛慧良徐金会陈蕾徐来祥; 关键词：黑线仓鼠系统进化

黑线仓鼠AVP基因部分序列的系统进化及结构分析: 2011年; 根据GenBank中黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)同源物种的AVPcDNA序列设计引物,利用RT-PCR技术得到了黑线仓鼠精氨酸加压素(AVP)基因部分cDNA序列,包括外显子2的全部序列和外显子1、3的部分序列,共433bp,并注册到GenBank(登录号:JN227681)。该段序列共编码143个氨基酸,二级结构预测显示片段中含较多的α螺旋。该序列与其他物种相应区域的比较结果表明其同源性为84%～92%,氨基酸序列同源性为82%～93%。系统进化分析结果与物种亲缘关系的远近一致,该序列的克隆为研究AVP的表达调控机制奠定了基础,将有助于AVP的作用机制的研究及功能分析,同时该cDNA序列可作为物种亲缘关系或遗传距离研究的理想标记。; 王永安卜凡莉徐金会薛慧良徐来祥; 关键词：黑线仓鼠 AVP 克隆系统进化

催乳素受体与黑线仓鼠胎产仔数的关联性被引量：1: 2013年; 黑线仓鼠是生态系统的主要功能群之一,胎产仔数是影响黑线仓鼠种群数量的一个主要因素,催乳素受体(PRLR)又是控制动物胎产仔数的一个主效基因,但PRLR与黑线仓鼠胎产仔数的关联性还不清楚。本研究以具有胎产仔数记录的90只黑线仓鼠为材料,检测PRLR 5'端的SNP,并分析单倍型结构,同时检测试验个体发情期卵巢PRLR的表达量。分析了PRLR 5'端的单倍型结构和发情期卵巢PRLR的表达量与胎产仔数的关联性。结果表明,在黑线仓鼠PRLR 5'端共检测到3个多态性位点,5种单倍型结构;在不同的单倍型结构间,胎产仔数均存在显著差异;除H1和H2之间、H4和H5之间外,其余单倍型间,黑线仓鼠发情期卵巢PRLR的表达量均存在显著差异;并且发情期卵巢PRLR的表达量与胎产仔数存在显著正相关(r=0.982)。因此,在PRLR 5'端检测到的多态性位点显著影响黑线仓鼠的胎产仔数,这为有效控制黑线仓鼠种群数量从分子水平上提供了理论依据。; 薛慧良王东宽徐金会徐来祥; 关键词：黑线仓鼠催乳素受体胎产仔数

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山东省优秀中青年科学家科研奖励基金(BS2010NY012)