中国热带农业科学院热带生物技术研究所
- 作品数:5,135 被引量:17,705H指数:43
- 相关作者:戴好富梅文莉金志强郑学勤徐碧玉更多>>
- 相关机构:海南大学农学院海南大学环境与植物保护学院海南大学热带农林学院更多>>
- 发文基金:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家自然科学基金海南省自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 蓖麻基因组中一种Mutator-like类型MITEs元件的结构分析和鉴定
- 2012年
- 利用生物信息学方法,对蓖麻基因组Mutator-like类型MITEs元件进行了分析和鉴定。结果表明,蓖麻基因组上共鉴定出76个小于3 kb的Mutator-like类型MITEs元件,其中长度小于1 000 bp的元件有53个,占69.7%。这些MITEs元件中有42个位于基因间隔区,11个位于基因内含子区,位于5'UTR和3'UTR区的分别有8个和4个,另有1个位于基因编码区。29个MITEs元件带有转座酶以外的功能基因片段,成为pack-MITEs。多个pack-MITEs带有相同的非转座酶基因片段。Mutator-like类型的MITEs对蓖麻基因的表达和基因组的进化有潜在的影响,值得深入分析。
- 周新成王海燕胡梅珍李正绪卢诚王文泉
- 关键词:MITES蓖麻转座子
- 甘蔗EST-SSR标记的开发和多样性分析被引量:2
- 2012年
- 运用生物信息学分析方法对甘蔗(Saccharum spp.)的282 809条表达序列标签(ESTs)进行分析,共获得Unigene 138 590条,发掘出分布于10 086条Unigene的10 505个微卫星(EST-SSR)位点,SSR发生频率为7.26%,平均9.22 kb出现1个SSR。在7个杂交甘蔗品种中,三核苷酸基元的SSR数量最多(74.95个/Mb),其次为二核苷酸基元的SSR(22.95个/Mb),二者占总数的90.27%。以CCG/CGG、AG/CT为重复基元的SSR是最常见的EST-SSR类型,富含G/C的EST-SSR占据极明显的优势。与拟南芥和水稻cDNA序列内SSR的比较表明,富含G/C的SSR可能是禾本科植物SSR的一个共同特点。研究发现,SSR在EST与基因组序列之间以及在不同甘蔗品种之间的分布存在差别,具有丰富的多样性。此外,从EST数据分析获得杂交甘蔗品种的16个保守基因,从中发掘了9个SSR位点。最后,利用Primer3和e-PCR软件设计了一批具有物种特异性和通用性的EST-SSR PCR引物,相关数据可以通过http://59.50.66.49/SSR/sugarcane/sugarcane.EST-SSR.tgz链接从因特网下载。该研究结果可为开展甘蔗遗传多样性分析、种质资源鉴定和分子辅助育种提供参考。
- 黄启星张雨良王俊刚伍苏然张树珍郭安平
- 关键词:甘蔗ESTSSR微卫星
- 急性氨氮胁迫对红螯螯虾血细胞凋亡的影响被引量:5
- 2017年
- 氨氮是水产养殖过程中的常见毒性污染物之一,为探讨氨氮对红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)血细胞的细胞毒性机制,研究了氨氮胁迫作用下红螯螯虾血细胞凋亡状态的变化。以17.6mg/L氨氮对红螯螯虾幼虾进行急性胁迫,于胁迫后的0、48、72和96h取血淋巴,应用流式细胞术测定血细胞总数(THC)、胞内游离Ca^(2+)含量、线粒体膜电位(MMP)和血细胞凋亡率。结果显示,红螯螯虾的THC在胁迫的72h开始有显著的下降,在96h时达到最低值;血细胞胞内游离Ca^(2+)含量在48h开始有显著的升高,在96h达到最高值;血细胞MMP在72h开始有显著的下降,在96h达到最低值;血细胞凋亡率在72h开始有显著的升高,在96h时达到最高值,为9.39%。这些结果表明,胞内游离Ca^(2+)含量是对氨氮胁迫最为敏感的指标;氨氮急性胁迫诱导红螯螯虾血细胞发生了Ca^(2+)参与调节、线粒体通路相关的细胞凋亡,从而导致了THC的下降。
- 潘训彬张秀霞冼健安
- 关键词:氨氮血细胞流式细胞术
- 一种连锁香蕉采收车
- 本实用新型提出了一种连锁香蕉采收车,所述连锁香蕉采收车包括前后把手,与把手相连的车体和车体下方的车轮,所述车体分成上下两层,下层辅助上层承接压力,所述连锁香蕉采收车的把手上固定有套环,两辆连锁香蕉采收车的前后把手相对使两...
- 张建斌王必尊王甲水贾彩红王卓苗红霞刘菊华徐碧玉金志强王安邦
- 文献传递
- 甘蔗ShSAP1基因的启动子克隆与序列分析被引量:3
- 2014年
- 启动子在转基因育种中具有重要地位,为了发掘高效的胁迫诱导和组织特异型启动子,提高目的基因的表达效率,根据甘蔗逆境相关蛋白家族基因ShSAP1的基因组序列,利用Genome Walking法对ShSAP1的启动子进行了分离,并对其序列进行了生物信息学分析。分离获得了1243 bp的启动子序列,该序列具有启动子的核心元件,还包含了干旱等胁迫相关的应答元件、MYB/MYC转录因子识别与结合元件、光应答元件及组织特异性相关元件,说明ShSAP1的启动子可能具有逆境应答及组织特异表达特性,值得开展进一步的功能研究。
- 李晓君武媛丽张焱珍杨本鹏张树珍
- 关键词:启动子克隆顺式作用元件
- 饲料脂肪水平对红螯螯虾幼虾生长、肌肉组分、消化酶活力和免疫力的影响被引量:9
- 2018年
- 为探讨红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)幼虾饲料的适宜脂肪水平,配制5种不同脂肪水平(3%、5%、7%、9%和11%)的等氮等能饲料,饲喂红螯螯虾幼虾(0.86±0.11)g 8周,测定其生长性能、肌肉组成、消化酶和免疫相关酶活力。结果显示,随着饲料脂肪水平的上升,红螯螯虾幼虾增重率和特定生长率均呈先上升后下降的趋势,7%和9%组显著高于3%组和11%组,由增重率回归曲线得到饲料最佳脂肪水平为7.44%;饲料脂肪水平对红螯螯虾幼虾肌肉组分、肝胰腺胰蛋白酶活力没有显著影响;随着饲料脂肪水平的上升,肝胰腺脂肪酶活力呈先上升后下降的趋势,7%和9%组显著高于3%组;随着饲料脂肪水平的上升,肝胰腺淀粉酶活力呈现逐渐下降的趋势,11%组显著低于3%和5%组;饲料脂肪水平对红螯螯虾幼虾的总抗氧化能力(T-AOC)、超氧化物歧化酶(SOD)活力和酸性磷酸酶(ACP)活力均无显著影响,碱性磷酸酶(AKP)活力随着饲料脂肪水平的上升呈现先上升后下降的趋势,7%组显著高于3%和11%组。结果表明,适宜的饲料脂肪水平可促进红螯螯虾幼虾的生长,并可一定程度地提高脂肪酶和AKP活力,其适宜的脂肪水平为7%~9%。
- 鲁耀鹏汪蕾张秀霞王冬梅李军涛郑佩华冼健安
- 关键词:红螯螯虾消化酶免疫力
- 卡瓦胡椒及胡椒的RAPD聚类分析被引量:8
- 2005年
- 目的:通过RAPD分析搞清楚卡瓦胡椒与胡椒及胡椒属其它近缘野生种的亲缘关系.方法和结果:采用随机引物80条进行筛选,用从80条随机引物中入选的20条引物,对卡瓦胡椒和胡椒属共计28份材料进行RAPD扩增,均能产生清晰的扩增谱带.重复1~2次,结果稳定可靠.20个引物共扩增出170个条带,其中多态性条带有20条,占总扩增条带数的12%.RAPD分析结果显示在相似系数0.36处对28份种质可划分为6个类型,其中卡瓦胡椒被单独聚为一类,说明卡瓦胡椒与胡椒及其它近缘野生种的亲缘关系有一定的距离.
- 施江辛莉郑楷李建国郑学勤
- 关键词:卡瓦胡椒胡椒RAPD聚类分析
- AtNUDT8过量表达的拟南芥转基因植株被引量:9
- 2010年
- 从拟南芥基因组中克隆AtNUDT8,并与pCHF3相连构建了植物表达载体pCHFN8,采用农杆菌GV3101介导的渗透法转化野生型拟南芥,通过卡那霉素筛选获得了一批经Northern blot检测证实的过量表达AtNUDT8的转基因拟南芥植株。
- 张秀春李文彬夏亦荠彭明
- 关键词:拟南芥
- 糯米香种质资源遗传多样性的RAPD分析被引量:3
- 2011年
- 利用RAPD技术,对12份糯米香种质资源进行遗传多样性研究。从95条随机引物中筛选出41条条带清晰、重复性及多态性好的引物,对12份糯米香种质资源的基因组DNA进行PCR扩增,共扩增出305条带,其中扩增条带的多态位点有120个,在物种水平上,多态性位点百分率为39.34%,表明供试糯米香种质资源遗传多样性较低。遗传相似性在0.734 4~0.963 9之间,12份种质表现出较高的遗传相似性。通过UPGMA构建树状图,当相似系数为0.821时,12份种质资源可以聚为Ⅰ和Ⅱ两个类群,在地理分布图上,来源地相同或较近的种质表现出较为亲密的亲缘关系。
- 吴刚马帅张翠玲庄辉发张家明
- 关键词:RAPD
- 菌酶协同改善花生粕的饲用品质被引量:13
- 2021年
- 花生粕是重要的蛋白饲料原料,但由于其氨基酸不平衡,特别是精氨酸与赖氨酸比例严重失衡(精氨酸与赖氨酸含量比值在3~4,理想的精氨酸与赖氨酸含量比值为1.0),限制了其在动物养殖中的应用。研究了复合酶预处理结合乳酸菌发酵花生粕对其品质的改善。结果表明:经菌酶协同处理后,花生粕粗蛋白质含量由46.4%提高至50.6%,大分子蛋白明显降解为小分子蛋白,酸溶蛋白质含量由2.3%提高至17.8%,多肽含量由1.6%提高至15.7%,蛋氨酸和赖氨酸含量分别提高了77.1%和42.0%,精氨酸降解率为18.7%,精氨酸与赖氨酸含量比值从3.7降低至2.1,总酸含量由0.6%提高到4.7%,其中乳酸含量由0.64 mg/g提高至14.63 mg/g。菌酶协同处理后的花生粕抗氧化性明显增强,其中每克菌酶协同处理后的花生粕对羟自由基的清除能力与171.6 mg VC相当,比花生粕(与47.6 mg VC相当)提高了2.6倍。
- 周佳慧李晓敏李晓敏孙海彦蔡国林
- 关键词:花生粕氨基酸平衡