南京林业大学森林资源与环境学院国家林业局林木遗传和基因工程重点实验室
- 作品数:52 被引量:618H指数:16
- 相关作者:黄焱周猛邓明文潘向艳单文娟更多>>
- 相关机构:福建农林大学林学院中国林业科学研究院热带林业研究所西南师范大学生命科学学院生物系更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划上海市科技兴农重点攻关项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 百合属野生种及品种亲缘关系的ISSR分析被引量:5
- 2012年
- 利用ISSR分子标记对14个百合野生种及7个栽培品种的亲缘关系进行分析。用15条引物扩增出150条谱带,均为多态谱带。UPGMA聚类分析结果将野生种基本分为2个类群,与形态分类的百合组和卷瓣组基本相符;宜昌百合与岷江百合亲缘关系较近。栽培品种分为2个类群,东方系为一个类群,麝香系与亚洲系为另一类群。麝香系与亚洲系比东方百合距卷瓣组百合亲缘关系更近。ISSR分子标记技术适合百合属植物的组间亲缘关系分析。
- 吴祝华施季森席梦利姜福星邓明文
- 关键词:百合属亲缘关系ISSR
- 杉木成熟合子胚器官发生和体胚发生被引量:23
- 2006年
- 以杉木成熟合子胚为起始外植体,研究基本培养基、不同种类的细胞分裂素及生长素对杉木器官发生和体胚发生及不定芽生根的影响,并用石蜡切片法观察不定芽和体胚的发生和发育过程.结果表明:DCR+6-BA 1.0mg·L-1+TDZ 0.002 mg·L-1+NAA 0.1 mg·L-1对成熟合子胚诱导不定芽最有效;DCR+6-BA 1.0 mg·L-1+TDZ 0.003mg·L-1+NAA 0.1 mg·L-1是成熟合子胚诱导体胚的最佳培养基;不定芽在DCR基本培养基中可有效伸长;1/4MS+IBA 0.2 mg·L-1+NAA 0.1 mg·L-1对不定芽生根最有效.石蜡切片观察表明:不定芽有2种发生方式,一种是表皮及表皮下的3~4层细胞分生组织化发育而成,另一种是外植体内部的小维管束脱分化发育而成.2种发生方式均为直接器官发生途径.
- 席梦利施季森
- 关键词:杉木成熟合子胚器官发生体胚发生
- 东方百合的器官发生与体胚发生研究
- 以东方百合栽培品种'Sorbonne'、'Siberia'、'Tiber'的试管苗鳞片和叶片为外植体,研究了6-BA0.3~2.0 mg/L、KT0.5~2.0mg/L、NAA0.1~2.0mg/L、2,4D0.5~2....
- 胡凤荣席梦利池坚施季森
- 关键词:东方百合器官发生体胚发生
- 喜树形成层的发育及周年活动被引量:4
- 2006年
- 喜树Camptotheca acuminata具非叠生形成层。形成层在进一步发育的过程中,纺锤状原始细胞的长度随着枝龄的增加而变长,射线原始细胞的长度随着枝龄的增加而变短。其形成层活动与大多数散孔材树种相似,具有明显的周期性。3月份芽萌动以后,形成层开始活动,4~5月份形成层活动最为旺盛,10月份以后进入休眠状态。淀粉储量的消长与形成层活动周期有很强的相关关系。3—4月份形成层恢复活动以后,淀粉储量逐渐减少甚至消失。8月份淀粉开始积累,9月份淀粉很快消失。11月份又重新积累,直到翌年3月份以后才开始消失。
- 席梦利施季森包少康
- 关键词:植物学喜树形成层发育
- 杨树部分基因起始密码子AUG侧翼序列特征分析被引量:2
- 2008年
- 对297条杨树基因序列的起始密码子AUG侧翼区序列(-20位点-+6位点)的碱基分布特性进行了统计学分析,并对高表达基因和低表达基因翻译起始位点侧翼序列碱基的保守性和关联性进行了对比分析。结果表明:紧邻起始密码子5′端的-1、-2、-3、-4、-5和-6位点均强烈偏好A,+4位点强烈偏好G,同时高表达和低表达基因的-20位到+4位中某些位点的保守性存在较大差异,其中高表达基因的-6,-3和+4位可能与其高表达的特性有关;通过关联性分析可以看出,在起始密码子侧翼序列的某些特定区域碱基之间的关联性可能也与翻译起始效率有关系;相关性分析表明低表达基因的AUGCAI主要受到"AUG"侧翼区序列的GC含量的影响,低表达基因在"AUG"侧翼区富集GC对翻译有一定影响。
- 单文娟周猛卫巍童春发施季森
- 关键词:杨树保守性
- 大花蕙兰类原球茎薄切片高频诱导体系的建立被引量:3
- 2008年
- 通过对大花蕙兰离体诱导类原球茎几个主要影响因素的研究,构建优良、高效的离体诱导体系。研究表明,不同外植体类型再生能力有显著差异,其中以类原球茎(protocorn-like body,PLB)横切片(transverse thincell layers,tTCLs)为外植体可获得最高的PLB再生频率,叶片再生频率及数量最低。不同激素配比影响tTCLs的再生能力,其中在1/2 MS+TDZ 1.0 mg/L+KT 0.5 mg/L+NAA 0.5 mg/L上最高诱导频率为91.20%。在上述培养基中添加3.0 mg/L AgNO3可提高tTCLs上PLBs的形成,但作用不显著。可见,以tTCLs为外植体诱导大花蕙兰PLBs切实可行。
- 孙崇波刘玫谢鸣蒋桂华施季森郭方其
- 关键词:大花蕙兰类原球茎离体诱导
- 基因芯片筛选差异表达基因方法比较被引量:5
- 2008年
- 使用计算机模拟数据和真实的芯片数据,对8种筛选差异表达基因的方法进行了比较分析,旨在比较不同方法对基因芯片数据的筛选效果。模拟数据分析表明,所使用的8种方法对均匀分布的差异表达基因有很好的识别、检出作用。算法方面,SAM和Wilcoxon秩和检验方法较好;数据分布方面,正态分布的识别效果较好,卡方分布和指数分布的识别效果较差。杨树cDNA芯片分析表明,SAM、Samroc和回归模型方法相近,而Wilcoxon秩和检验方法与它们有较大差异。
- 单文娟童春发施季森
- 关键词:基因芯片杨树
- 珍珠黄杨不同扦插继代的荧光特性被引量:3
- 2008年
- 利用叶片体内荧光测定技术,检测了通过连续继代扦插的高山引种驯化植物珍珠黄杨的4个不同继代的荧光诱导动力学参数。结果表明:Fv,Fm,Fv/Fm,Fv/Fo,Fm/Fo这5个参数从1990、1994、1998到2000继代呈现逐渐增大规律。后一继代各参数值都比前一继代的大,后续继代(1998、2000继代)Fm/Fo和Fv/Fo明显大于初始继代(1990、1994继代),表明后续继代的PSⅡ潜在活力和光能转换效率较高。荧光诱导动力学从P相到T相的时间逐渐缩短,振荡衰减逐渐加快,暗示光合作用的光、暗反应在初始继代,特别是1990继代受到严重抑制。珍珠黄杨除1990继代的Pq值大于QNP值外,其他3个继代均是QNP值大于Pq值,并且随着继代扦插的进行,QNP在荧光淬灭中所占的比值越来越大,Q的变异趋势与其生长适应能力的变化是一致的。
- 黄焱季孔庶汤庚国
- 关键词:珍珠黄杨叶绿素荧光动力学参数复壮
- 基于Linux平台的林木EST序列分析系统的构建及应用被引量:1
- 2007年
- 利用Phred/Phrap/Consed、cross.match、RepeatMasker、Blast等软件和自主开发程序,基于Linux操作系统,构建了林木EST序列分析系统,完成了从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列的去除、重复序列鉴定、EST序列分类和组装、EST序列功能注释与功能分类以及SSR、SNP的发掘。并通过使用Perl语言结合bioperl模块写的脚本程序使分析过程自动化,从而可以快速地对大批林木EST数据进行分析,为林木的功能基因组学研究提供有用的信息。
- 周猛童春发施季森
- 关键词:林木ESTPERL生物信息学
- 充分利用Bioperl加速生物信息学的研究被引量:6
- 2008年
- Bioperl是Perl语言专门用于生物信息的工具与函数模块集,是世界各地的Perl开发人员在生物信息学、基因组学以及其他生命科学领域的智能结晶,服务于研究生物学问题的生物学家或计算机专家。通过对Bioperl进行了详细的介绍,并利用几个研究中的应用实例充分说明Bioperl在生物信息学研究中的重要地位。
- 周猛童春发施季森
- 关键词:生物信息学