山西农业大学农业生物工程研究所
- 作品数：46 被引量：251H指数：10
- 相关机构：中国农业科学院中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室华南农业大学公共基础课实验教学中心更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金山西省青年科技研究基金山西省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 绿豆生长素响应因子基因家族序列特征及分子进化被引量：1
- 2018年
- 绿豆种子萌发率严重影响和制约其田间产量,研究利用与绿豆种子萌发相关的基因资源具有十分重要的意义。本研究拟通过查询绿豆转录组数据库,分离包含完整ORF的生长素响应因子(ARF)基因家族成员,对比分析该家族成员的蛋白保守结构域,基于氨基酸序列同源性构建系统进化树。结果表明:分离到22个包含完整ORF的ARF基因,其核苷酸序列长度范围为905~3 624 bp,其编码氨基酸序列长度的范围为237~761 aa。其中仅有4个ARF基因包含保守的B3 DNA结合结构域、Auxin响应因子和AUX/IAA家族蛋白结构域,其他基因存在1~2个保守结构域的缺失。系统进化树结果显示,绿豆22个ARF基因与拟南芥12个ARF基因共划分为3大类,9个亚类。这些结果为进一步揭示绿豆ARF基因功能多样性,同时为将来遗传工程改良绿豆品种提供理论参考。
- 王彩萍王丽宋敏刘荣华孙朝霞侯思宇
- 关键词：绿豆基因家族系统进化
- 玉米自交系幼苗生物量积累及根系形态对两种氮素水平的反应及聚类分析被引量：5
- 2019年
- 为探讨低氮胁迫对玉米自交系幼苗生物量和根系形态的影响,以35份玉米自交系为材料,测定了两个氮素水平处理后14d玉米幼苗的单株干重、地上部干重、根干重、根冠比、总根长、根表面积、根体积、根平均直径、侧根数和初生根长。结果表明,低氮胁迫下玉米幼苗根干重、根冠比、根总表面积、根体积、侧根数、根平均直径和初生根长显著增加,地上部干重和单株干重显著减小,而总根长没有明显变化。通过主成分分析和聚类分析发现,同一氮素水平下,玉米幼苗各性状的综合表现存在基因型差异,且在正常氮素和低氮条件下均可以分为6组。低氮处理后,选取的9个自交系地上部氮素积累量均显著降低,PH4CV、B73和XY4的根系氮素积累量显著增加,其余6个自交系显著降低。此外,只有XY4的氮素吸收和利用效率均较高。综合分析表明,XY4是低氮高效型玉米自交系。
- 师赵康赵泽群张远航徐世英王宁王伟杰程皓邢国芳冯万军
- 关键词：玉米氮素生物量积累根系形态聚类分析
- 基于名优谷子品种晋谷21全基因组重测序的分子标记开发被引量：11
- 2018年
- 小米因其营养丰富日益受到重视,而小米的品质是民众选择小米时最为关注的指标。晋谷21米质优异,但由于缺少基因组信息,严重阻碍了其优异米质形成机制的研究。本研究利用高通量测序技术,对晋谷21全基因组进行重测序,获得了14.95 Gb高质量测序数据。进一步将其与豫谷1号参考基因组比较,发掘了169 037个In Del位点和1 167 555个SNP位点,其中长度在13~50 bp之间适于琼脂糖凝胶电泳检测的In Del位点为14 578个。选择其中1个SNP位点和68个In Del位点验证,表明利用二代测序技术开发的In Del和SNP标记真实可靠。基于名优谷子晋谷21重测序数据开发的In Del和SNP分子标记具有通用性,可用于其他谷子、狗尾草和谷莠子等种质资源的相关研究。同时,开发了一个晋谷21特异的In Del标记2G5501976,利用该标记即可快速鉴定待测材料是否为晋谷21及其衍生品种。本研究初步揭示了晋谷21的基因组特征,不仅为深入解析其优异米质形成的分子机制奠定了基础,而且为相关分子标记辅助育种、遗传分析和基因克隆提供了分子标记资源。
- 赵庆英张瑞娟王瑞良高建华韩渊怀杨致荣杨致荣
- 关键词：谷子INDELSNP分子标记
- 谷子C2H2型锌指蛋白基因SiZFP182的克隆及表达分析被引量：4
- 2015年
- 以‘晋谷45’和‘晋谷42’2个品种作为试验材料,采用聚乙二醇（PEG-6000）模拟干旱胁迫处理谷子幼苗,检测不同处理时间下丙二醛（MDA）的含量,评价其抗旱性。此外,在2个品种中克隆获得SiZFP182基因的cDNA全长,分析比较它们之间的序列差异;通过定量RT-PCR的方法分析SiZFP182基因在受到干旱胁迫的谷子幼苗中的表达特性。结果表明,‘晋谷45’的抗旱性强于‘晋谷42’,2个品种中SiZFP182基因的序列存在5处单碱基差异,使得编码的氨基酸序列不同。此外,PEG胁迫处理后24h内,SiZFP182基因在2个品种中的表达水平均表现出先升高后降低的趋势,处理后6-12h,该基因在‘晋谷45’中表达水平高于‘晋谷42’。初步认为‘晋谷45’的抗旱特性与‘晋谷42’对干旱敏感的特性,可能与干旱胁迫下处于幼苗期的2个品种中SiZFP182基因序列差异及表达差异相关。
- 张彬禾璐候蕊路阳马芳芳王兴春杨致荣韩渊怀李红英
- 关键词：谷子C2H2型锌指蛋白抗旱性
- 糜子EMS突变体库构建和突变体筛选被引量：16
- 2019年
- 糜子(Panicum miliaceum L.)具有抗旱、耐瘠、适应性广、生育期短等特点,是我国北方地区的杂粮作物。糜子高产品种不耐水肥、易倒伏,锄草、间苗费时费工的问题严重影响着农民对糜子生产的积极性和收入。EMS(甲基磺酸乙酯)化学诱变方法成本低,操作简单,诱变率高,是作物育种的重要方法。本试验选用糜子品种伊选大红糜进行EMS化学诱变而构建突变体库,对获得的2333个M2材料进行突变频率和全生育期表型多样性等特征的分析。结果显示,所构建的糜子突变体库材料变异类型非常丰富,共发现104个形态性状突变株系,突变频率为4.5%,包括叶色、叶型、株高、生育期、育性、穗型、种皮颜色等性状,该突变体库的构建将为糜子功能基因组学研究和育种提供丰富的突变体资源和新型种质。
- 张彬王喆陈利青陈利青李红英乔治军李红英
- 关键词：糜子EMS诱变突变体库
- 植物耐低磷的转录调控机制被引量：2
- 2014年
- 植物缺磷已经成为世界性的难题,越来越多的研究表明,转录调控是植物耐低磷调控的的重要环节,因此,有关植物低磷诱导转录因子转录机制的研究已成为国内外研究的热点。综述了与植物磷胁迫相关的转录因子PHR1,PHO1,WRKY6等调控磷酸饥饿的方式及其在植物生长发育、根系形态变化和激素信号等方面的功能,并对其研究前景进行了展望。
- 孟令芝樊娟陈钊李亚娟王兴春杨致荣
- 关键词：低磷转录因子分子机制植物
- 高等真核生物中重叠基因研究
- 2011年
- 基因重叠是高等真核生物中一种普遍存在的基因组排现象.综述了高等真核生物中的重叠基因的分类、数量、互补或自然反义转录本(NATs)可能的生物特性和功能及重叠基因与人类疾病的关系.
- 成亮韩渊怀李榆梅张虹
- 关键词：真核生物重叠基因
- 苦荞SRAP分子标记体系优化与遗传多样性分析被引量：14
- 2015年
- 通过正交试验设计,比较苦荞序列相关多态性-聚合酶链式反应（Sequence related amplified polymorphism-polymerase chain reaction,SRAP-PCR）扩增反应体系的组合,选出最佳扩增体系用于苦荞SRAP分子标记进行遗传多样性分析。其中最佳SRAP-PCR反应扩增体系为Taq DNA聚合酶2 U、Mg^2＋1.5 mmol/L、DNA模板75ng、引物0.5μmol/L。从238对SRAP引物组合中筛选出20对多态性较高的引物组合,并对15个苦荞品种进行遗传多样性分析。结果表明：20对引物组合共扩增出128个位点,其多态性信息量（Polymorphism information content,PIC）值在0.66~0.95,每对引物组合扩增位点为7~13个,多态性比率平均值为81.6%,其中多态性信息量值为0.95的引物组合为me7em11、me9em4和me12em8。基于UPGMA法聚类（GS=0.78）可将15个苦荞品种划分为3大类,但这3类划分的品种没有明显的地域分布特征。
- 令狐斌侯思宇孙朝霞黄可盛路阳韩渊怀许冬梅
- 关键词：苦荞SRAP-PCR正交试验设计
- Cry1Ia蛋白的表达与纯化被引量：2
- 2019年
- 苏云金芽孢杆菌表达的Cry1Ia蛋白对鳞翅目和鞘翅目昆虫具有较好的杀虫活性。为便于后期评价不同的Cry1Ia蛋白,建立了Cry1Ia蛋白的表达与纯化体系。将一个cry1Ia基因的编码基因接入pET28aDel表达载体,并将其转化大肠杆菌BL21(DE3)star菌株。在大肠杆菌中诱导Cry1Ia蛋白的表达,并与Bt中的表达产物进行比较。最后,利用Cry1Ia蛋白C端包含的组氨酸标签,对大肠杆菌表达的Cry1Ia蛋白进行纯化。结果显示,大肠杆菌中Cry1Ia蛋白随着表达时间的延长,产物积累显著,并且其表达量高于Bt菌株,因此,其更适宜生产完整的Cry1Ia蛋白。对大肠杆菌表达的Cry1Ia进行纯化,获得了理想的结果。研究构建了Cry1Ia蛋白的大肠杆菌表达体系,并成功对其进行纯化,可为进一步研究此类蛋白的杀虫活性和机制奠定基础。
- 郭小琴钱红梅郭星高佳丽张义茹高建华王兴春
- 关键词：苏云金芽孢杆菌大肠杆菌蛋白表达蛋白纯化
- 谷子MYB转录因子响应Sclerospora graminicola侵染的生物信息学及表达分析
- 谷子白发病可严重降低谷子的产量和品质,谷子MYB转录因子在调控生物胁迫响应中扮演重要的角色。本研究依据课题组前期白发病菌侵染谷子不同时期的转录组数据,获得6个显著差异表达的MYB转录因子,结合ExPASY、GSDS、Ph...
- 韩彦卿王鹤刘锐武彩娟韩渊怀
- 关键词：谷子MYB转录因子转录组测序
