姚韩韩
- 作品数：46 被引量：129H指数：9
- 供职机构：浙江万里学院更多>>
- 发文基金：浙江省自然科学基金国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学天文地球医药卫生更多>>
- 泥蚶(Tegillarca granosa)基因组SSR和EST-SSR的开发及比较研究被引量：11
- 2013年
- 采用SSPHunter软件在泥蚶(Tegillarca granosa)磁珠富集文库和454转录组文库中搜索核心序列长度12bp以上的2—6核苷酸重复序列,根据富集文库所得基因组SSR侧翼序列设计47对引物,可成功扩增17对且均为多态性引物,多态率100%,平均等位基因数(Na)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态性信息含量(PIC)分别为6.8、0.468、0.785、0.733。11344条EST序列中得到1683个SSR位点,检出率14.83%,平均每3.85kb出现1个位点。根据部分EST序列设计120对引物,62对可扩增出目的片段,其中29个位点具有多态性,多态率为46.77%,平均Na、Ho、He、PIC分别为4.2、0.372、0.554、0.500,均低于基因组SSR。双变量相关性分析的结果表明,46个多态性SSR位点的核心序列长度与其Na、Ho、He、PIC极显著正相关,Spearman相关系数分别为0.632、0.387、0.657、0.
- 周小龙朱靖华董迎辉林志华富凯立姚韩韩齐晓艳
- 关键词：泥蚶基因组SSREST-SSR
- 文蛤30个微卫星标记的开发及在斧文蛤和帘文蛤中的通用性检测被引量：11
- 2013年
- 为开展文蛤多态性微卫星标记及其在斧文蛤和帘文蛤中的通用性研究,实验从磁珠富集法构建的基因组文库和EST文库中开发了30个文蛤多态性微卫星标记,包括8个G-SSR和22个EST-SSR多态性位点。共获得140个等位基因,平均等位基因数为4.67;多态性信息含量、观测杂合度、期望杂合度分别为0.172～0.744、0.040～0.720、0.187～0.793;G-SSRs的平均等位基因数、平均多态性信息含量、平均观测杂合度和平均期望杂合度都较EST-SSRs高;Hardy-Weinberg平衡检测发现,24个位点偏离了平衡状态;利用BLASTx对含多态性SSR位点的EST进行功能注释,11个位点来自注释基因序列。将30对文蛤多态性SSR引物分别在斧文蛤和帘文蛤中进行了通用性检测,通用率分别为40%和30%。这些微卫星多态性位点的获得,为进一步开展文蛤遗传多样性分析、种质资源评价、分子标记辅助选育等奠定了基础,并且可用于文蛤、斧文蛤和帘文蛤的比较作图、基因发掘和QTL定位等研究。
- 齐晓艳董迎辉姚韩韩周小龙林志华
- 关键词：文蛤EST-SSRS多态性
- 泥蚶野生群体与选育群体的分子遗传基础研究
- 泥蚶是我国四大养殖贝类之一，具有重要的经济价值。培育出优良品种是促进泥蚶养殖业可持续发展的关键。分子标记技术的出现为优良品种的快速培育提供了丰富的理论基础。本研究利用线粒体COI技术和AFLP分子标记技术，以泥蚶野生群体...
- 姚韩韩
- 关键词：泥蚶AFLP分子标记技术
- 文献传递
- 一种活体无损伤提取贝类高质量DNA的方法及其应用
- 本发明提供了一种活体无损伤提取贝类高质量DNA的方法，包括S1：壳皮采集、S2：壳皮清洗、S3：DNA提取：取壳皮组织置于研钵中，加入液氮研磨至粉状，转移至离心管中；加入STE裂解缓冲液，再加入SDS溶液和蛋白酶K，充分...
- 姚韩韩董迎辉赵家熙何琳何京吕丽媛孙长森林志华
- 利用微卫星标记对文蛤4个壳色花纹品系的遗传分析被引量：17
- 2012年
- 利用9个微卫星位点对文蛤红壳(RS)、黑斑(BS)、细纹(TC)、暗纹(DF)4个壳色花纹品系共120个个体进行遗传差异分析。结果共检测到105个等位基因,每个位点平均观察等位基因数为11.7个,其中WG07位点等位基因数最多(21个),WG11位点最少(7个)。每个品系均具有特异等位基因类型,不同品系中相同微卫星位点的等位基因分布规律不同。4个文蛤品系的观测杂合度、期望杂合度和多态信息含量变异范围分别为0.110～1.000、0.486～0.867、0.433～0.834,均属高度多态性位点。Hardy-Weinberg平衡的卡方检测发现,大多数位点偏离平衡状态;聚类分析表明,4个品系间存在较明显的遗传差异,TC品系与其它品系的遗传距离最大,DF品系和RS品系的遗传距离相对较小。
- 朱东丽董迎辉林志华姚韩韩
- 关键词：文蛤微卫星标记
- 泥蚶受精和早期胚胎发育过程的细胞学研究
- 利用石蜡切片技术,对泥蚶受精和早期胚胎发育过程进行了系统的细胞学研究,完善了泥蚶受精生物学的特点和胚胎发育时序,并首次发现了泥蚶存在多精入卵现象。泥蚶成熟未受精卵呈卵圆形,核相处于第一次减数分裂中期;精卵混合后,精子迅速...
- 姚韩韩林志华董迎辉朱东丽沈和定
- 关键词：泥蚶受精细胞学研究
- 文献传递
- 文蛤(Meretrix meretrix)4个壳色花纹品系的遗传差异分析被引量：9
- 2011年
- 应用AFLP技术对文蛤红壳(RS)、黑斑(BS)、细纹(TC)、暗纹(DF)4个壳色花纹品系进行遗传差异分析。利用15对AFLP引物组合对4品系共128个个体进行了PCR扩增和电泳检测,共得到789个位点,总多态位点比例90.75%。Nei’s基因多样性和Shannon’s信息指数显示,4个品系的遗传多样性大小依次为BS品系>RS品系>DF品系>TC品系。AMOVA分析表明,79.45%的变异来自品系内,品系间的变异只占20.55%。聚类分析结果表明,4个品系间存在较明显的遗传差异,TC品系与其他品系的遗传差异最大,DF品系和RS品系的遗传差异相对较小。发现1个TC品系特有的AFLP标记,其出现频率为1.000,可作为品系鉴别的特征性标记。
- 朱东丽林志华董迎辉姚韩韩
- 关键词：文蛤
- 文蛤HDAC1基因克隆、时空表达及生长相关SNP位点筛查
- 为探索HDAC1基因在文蛤生长发育中的作用,本研究通过已构建的文蛤转录组文库,利用SMART RACE技术扩增得到文蛤HDAC1(Mm-HDAC1)基因的cDNA全长序列,分析了其生物信息学、组织及发育阶段表达特征,并用...
- 董迎辉高晓艳姚韩韩林志华
- 关键词：文蛤组蛋白去乙酰化酶1单核苷酸多态性
- 3种壳色花纹文蛤常规营养成分分析与评价被引量：10
- 2014年
- 本试验对红壳、黑斑、白壳3种壳色花纹文蛤的常规营养成分进行了检测,旨在分析和评价不同壳色花纹文蛤在营养价值上的差异。解剖取软体部,采用国家标准方法测定组织中水分、粗蛋白质、粗脂肪含量以及氨基酸、脂肪酸组成。结果表明：文蛤软体部鲜样中水分含量为81.15%-81.89%,粗蛋白质含量为9.23%-9.71%,粗脂肪含量为1.31%-1.91%,其上述常规营养成分的含量在3种文蛤中均不存在显著差异（ P〉0.10）。采用酸水解法,在3种文蛤软体部干样中均检测到17种氨基酸,其中总氨基酸（ TAA）含量为42.95%-48.45%,鲜味氨基酸（ DAA）含量为17.44%-20.88%,且DAA含量红壳文蛤有高于白壳文蛤的趋势（ P〈0.10）；3种文蛤软体部中第一限制性氨基酸均为缬氨酸。在3种文蛤软体部干样中检测到22-23种脂肪酸,其中多不饱和脂肪酸（ PUFA）含量为36.07%-39.55%,C20∶5（ n-3）（ EPA）含量为11.37%-12.87%, C22∶6（n-3）（DHA）含量为9.82%-12.44%,其中 EPA 含量红壳文蛤有高于白壳文蛤的趋势（P〈0.10）,DHA含量红壳文蛤有高于白壳文蛤和黑斑文蛤的趋势（P〈0.10）。由此可见,本试验检测的3种文蛤营养价值均较高,其中以红壳文蛤最高,且其鲜味度最优。
- 顾向飞林志华董迎辉姚韩韩
- 关键词：文蛤软体部脂肪酸氨基酸营养评价
- 泥蚶奉化种群与韩国种群形态特征和遗传结构的差异分析被引量：3
- 2014年
- 利用形态学标记和微卫星标记技术,研究了泥蚶奉化种群和韩国种群的壳形态和遗传结构的差异,为泥蚶良种培育提供科学依据。对同批2龄泥蚶奉化种群和韩国种群的壳长(SL)、壳高(SH)、壳宽(SW)、壳顶宽(SRW)、总质量(TW)、软体部质量(IW)进行测量,以各性状的相对比值作为形态分析指标,考察了SH/SL、SW/SL、SRW/SL、IW/TW 4个指标的差异。方差分析和Tukey多重比较结果表明,韩国种群的SW/SL、SRW/SL 2个形态指标均极显著高于奉化种群(P<0.01),表明韩国种群的壳型比奉化种群更加鼓胀;IW/TW极显著高于奉化种群,表明韩国种群的软体部含量高,即出肉率高。选用6个高度多态的微卫星标记分析了泥蚶韩国种群和奉化种群的遗传差异,结果 6个微卫星位点在2个种群中共检测出64个等位基因,其中5个位点的PIC值>0.5,表现出高度多态性;遗传多样性分析表明,奉化种群和韩国种群在等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、PIC值等遗传参数上差异很小,遗传分化系数Fst为0.022;但2个群体的遗传距离为0.136 7,在TMP18、ETG7等位点的等位基因数和期望杂合度等参数上存在显著差异,表明2个种群的遗传结构已经发生了一定程度的变异。
- 姚韩韩林志华周小龙顾向飞董迎辉
- 关键词：泥蚶地理种群形态学标记微卫星标记
