张红霞 作品数:13 被引量:138 H指数:6 供职机构: 扬州大学园艺与植物保护学院 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 江苏省“六大人才高峰”高层次人才项目 江苏省自然科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 更多>>
中国家鸡和红色原鸡mtDNA控制区遗传多态性及系统进化分析 被引量:61 2008年 通过线粒体DNA控制区的结构和多态性来研究中国家鸡和红色原鸡的遗传多态性与系统进化。测定14个中国地方鸡种和红色原鸡2个亚种的256个个体线粒体DNA控制区部分序列约560bp,结果表明,A、C、G、T这4种核苷酸的平均比例分别为25.∞%、37.40%、4.40%和33.20%。共发现44个变异位点,约占分析位点总数的7.86%,没有观测到插入/缺失,颠换和转换之比为0.13;共具有32种单倍型,9种为共享单倍型;16个群体内单倍型多样度从0到0.964,单倍型变异度总体为0.909±0.014,整体的平均核苷酸差异数为7.276,核苷酸多样度为1.851%。群体间核苷酸分歧度(Dxy)在0.747%~3.125%之间变化,核苷酸净遗传距离(Da)为0.015%~2.633%。16个群体表现出较高水平的遗传多态性,群体间表现出显著的遗传分化。群体遗传多态性和亲缘关系分析表明,一些中国家鸡的群体(如固始鸡和仙居鸡)起源于泰国红色原鸡Gallus gallu sgallus亚种,一些中国家鸡的群体(如茶花鸡和藏鸡等)起源于中国红色原鸡Gallus gallus spadiceus亚种,在一些中国地方鸡种还同时具有这2种红色原鸡的遗传贡献;认为中国家鸡起源于泰国或单纯起源于中国的观点都是不全面的。 包文斌 束婧婷 王存波 张红霞 Steffen Weigend 陈国宏关键词:家鸡 线粒体DNA控制区 提取东北虎毛发DNA两种方法的比较研究 被引量:13 2007年 研究东北虎毛发DNA的水煮抽提法,并将传统的酚仿抽提法和水煮法进行比较。水煮法即通过对细胞的煮沸和冷却,使细胞破裂、蛋白质变性,从而获得用于PCR扩增的模板DNA。通过测定OD值并计算浓度和纯度,同时进行琼脂糖电泳检测、PCR扩增和PAGE电泳检测,分析2种方法提取东北虎毛发DNA的质量差异。结果表明:水煮法提取东北虎毛发中DNA是一种快捷、简便、经济、高效的方法。 吴云良 陈晶 陈清 张红霞 陈国宏关键词:东北虎 毛发 DNA 29个微卫星标记与淮南麻黄鸡体重的相关性分析 被引量:6 2006年 利用29个微卫星标记的多态性分析淮南麻黄鸡12周龄体重与微卫星标记的相关。结果表明:位于3号染色体和10号染色体上的2个微卫星标记MCW0222、ADL0122与淮南麻黄鸡12周龄体重显著相关。 包文斌 束婧婷 张红霞 吴信生 陈国宏关键词:淮南麻黄鸡 微卫星 体重 微卫星技术分析东北虎遗传多样性及亲缘关系 被引量:8 2011年 利用16对家猫微卫星引物和4对苏门答腊虎微卫星引物,对东北虎基因组DNA进行扩增,其中15对引物可以稳定扩增。这15个位点的等位基因数为3~7个,共检测到83个等位基因,平均等位基因数为5.53个。期望杂合度为0.585 0~0.841 3,平均为0.750 4;多态信息含量为0.512 9~0.821 7,平均为0.714 0。表明这15个微卫星位点在研究群体中均为高度多态性位点。运用SPSS11.5软件对20只东北虎个体间的亲缘关系进行了聚类分析,结果表明,个体间的亲缘关系清晰可见,除个别虎外,与系谱资料基本一致,在距离系数为5.988的水平上可聚为3类,A、B与C聚为1类,E、F与G聚为1类,D单独聚为1类。 吴云良 包文斌 张红霞 郑维平 李文斌 徐琪 陈国宏关键词:东北虎 微卫星 亲缘关系 扬州城市绿地中杜鹃花的种类、应用调查及分析 2013年 在江苏省扬州市主要公园、城市主干道、校园、住宅小区等范围,对杜鹃花的种类、生长状况、园林应用情况、土壤pH值以及花色特性等进行系统的调查研究。结果表明,扬州市园林中应用的杜鹃花种类比较单一,全部是毛鹃,颜色多为紫红色,少数为粉色、白色;园林应用模式以群植和绿篱为主,偶尔有小规模的色带、丛植和花坛等应用模式;其土壤环境的pH值为7.3~8.5,大部分为偏碱性土壤,植株生长势中等,这可能与杜鹃喜欢偏酸性土壤,而城市园林中的土壤不适宜有关;利用紫外分光光度计测得杜鹃花瓣中花色苷含量为6.151μg/g,总黄酮含量为53.67 mg/g;并就杜鹃花在园林应用中的存在问题提出建议。 何丽斯 苏家乐 刘晓青 李畅 陈尚平 张红霞关键词:杜鹃花 园林应用 白枕鹤性别的分子鉴定方法 被引量:1 2009年 根据鸟类性染色体连锁基因EE0.6在Z、W染色体上PCR扩增产物长度的不同,利用4个引物组合对白枕鹤EE0.6基因上的相关片段进行特异性扩增。结果表明:这4个引物组合能从雄鹤中扩增出1条片段,从雌鹤中扩增出2条片段,从而成功地对白枕鹤的性别作出准确判断,有利于白枕鹤的成功配对和繁殖。 刘鑫 张红霞 包文斌 徐琪 束婧婷 程金花 吴云良 陈国宏关键词:白枕鹤 性别鉴定 濒危动物主要组织相容性复合体基因的研究现状及前景 被引量:2 2007年 主要组织相容性复合体(MHC)基因是脊椎动物体内与免疫应答调节密切相关的一个基因家族,由紧密连锁的度多态性基因座位组成。MHC基因具有高变异性,在机体免疫系统中发挥着非常重要的作用,而且与物种的抗病性和易性,以及种群繁殖力和生存力密切相关。对MHC基因进行研究,在种群遗传学,特别是濒危动物的保护遗传学中具有独的优势和应用前景。 吴云良 鞠慧萍 张红霞 陈国宏关键词:主要组织相容性复合体 濒危动物 保护遗传学 黑冠鹤性别的分子鉴定方法 被引量:5 2007年 黑冠鹤,也称戴冕鹤,在我国数量较少,对其进行人工繁殖与人工育种意义很大。本研究采用非伤害性采样方法,利用黑冠鹤羽毛提取基因组DNA,之后利用2个引物组合对黑冠鹤EE0.6基因上的相关片段进行了特异性扩增。结果显示,这2个引物组合都能从雄鹤中扩增出1条片段,从雌鹤中扩增出2条片段,从而成功地对黑冠鹤的性别作出了准确判断,有利于黑冠鹤的成功配对和繁殖。 胡飞 张红霞 包文斌 吴云良 陈国宏关键词:性别鉴定 鸡AIRC基因多态性及其对肌肉肌苷酸含量的遗传效应分析 被引量:5 2009年 以鸡AIRC基因为侯选基因,以丝羽乌骨鸡、萧山鸡、白耳鸡、藏鸡、隐性白羽鸡为试验材料,采用PCR-SS-CP方法对AIRC基因所有外显子及部分内含子区域进行SNPs检测,在外显子3和8中各发现1个单核苷酸多态位点。各种基因型与胸肌肌苷酸(IMP)含量的方差分析结果表明,外显子3中CC基因型个体的肌肉IMP含量显著高于TC和TT基因型个体,TC基因型个体也稍高于TT型,但差异不显著;外显子8中CG基因型个体的肌肉IMP含量显著高于GG和CC基因型个体,GG基因型个体的胸肌肌苷酸含量也显著高于CC型。外显子3和8的合并基因型对IMP含量也有显著的影响,合并基因型为CCCG的个体比TTCC合并基因型的个体高2.25mg.g-1,合并基因型的遗传效应大于最优秀的单个基因型效应。因此,可以利用该合并基因型对鸡的肉质风味性状进行标记辅助选择。 束婧婷 包文斌 吴信生 张学余 张红霞 陈国宏关键词:单核苷酸多态性 肌苷酸含量 合并基因型 家鸡腺苷琥珀酸裂解酶基因多态性与肌苷酸含量的关联及其与红原鸡的亲缘关系 被引量:11 2007年 根据腺苷琥珀酸裂解酶(adenylosuccinate lyase,ADSL)基因外显子2的序列设计引物,用PCR-SSCP的方法对隐性白羽鸡、丝羽乌骨鸡、白耳鸡、藏鸡以及红色原鸡两个亚种进行了单核苷酸多态性分析,并检测到了多态性,表现为3种基因型,对两种纯合子进行直接测序,结果发现3484位碱基处发生C→T突变。对3种基因型的肌肉肌苷酸含量的最小二乘分析结果显示TT型(突变型)个体的肌肉肌苷酸含量极显著地高于CT型、显著地高于CC型个体,CT型个体也稍高于CC型,但差异不显著,初步推测该位点可能与肌肉肌苷酸含量有关。根据该多态位点的基因频率,基于Nei氏的遗传距离运用NJ聚类法构建系统发生树,进行家鸡与原鸡的亲缘关系分析,结果发现,丝羽乌骨鸡与白耳鸡的亲缘关系最近,藏鸡和中国红原鸡亚种的亲缘关系也较近,中国地方家鸡品种与中国红原鸡亚种的亲缘关系较近,而与泰国红色原鸡的亲缘关系较远,隐性白羽鸡与原鸡亲缘关系最远,初步得出中国家鸡有自己独自的血缘来源的结论。 束婧婷 包文斌 张红霞 张学余 季从亮 陈国宏关键词:家鸡 红原鸡 单核苷酸多态性 肌苷酸 亲缘关系