徐永涛
- 作品数：6 被引量：11H指数：2
- 供职机构：青海师范大学生命与地理科学学院更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 藏羚羊(AC)_n,(AG)_n微卫星文库构建被引量：1
- 2014年
- 藏羚羊Pantholops hodgsonii是我国珍稀的动物资源,开发其微卫星标记具有重要的科研与应用价值。本研究采用FIASCO法(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing repeats)构建了藏羚羊的(AC)n和(AG)n微卫星富集文库。各文库随机挑取150个白色菌落,分别筛选到76个(AC)n和61个(AG)n阳性克隆;经测序得到含AC重复的微卫星序列37条和含AG重复的序列29条。研究共设计、合成微卫星引物47对,以扩增、电泳等方法进行筛选,最终获得15个可稳定扩增且具有多态的微卫星标记。筛选出的引物可用于评估藏羚羊的核DNA遗传多样性、遗传结构、种群动态以及构建藏羚羊遗传图谱等。
- 都玉蓉马建滨徐永涛周智红谭春敏张湑泽郭松长
- 关键词：藏羚羊微卫星富集文库
- 藏羚羊(AAC)_n微卫星富集文库构建与引物筛选
- 2014年
- 基于磁珠富集法，利用生物素标记的寡核苷酸探针（AAC）8从藏羚羊（Tibetan antelope）基因组酶切的300—1000bp片段中筛选微卫星位点，纯化的富集片段连接到pCR@2．1载体和转化到Trans5α感受态细胞．随机挑取180个白斑克隆，PCR检测到条带数大于或等于2的阳性克隆为56个，阳性率为31．1％．对阳性克隆测序，获得43条含微卫星座位的序列，微卫星重复次数在5～20次之间．舍弃不适宜设计引物的微卫星座位，试验设计并合成了20对微卫星引物；以3个样点（青海、新疆、西藏）的24个藏羚羊基因组为模板进行PCR扩增，获得8对可得到稳定扩增产物的微卫星引物，其中4对引物的扩增产物具有多态性，座位分别为AAC050、AAC056、AAC165和AAC477．上述引物可用于藏羚羊及近缘物种的遗传多样性、种群遗传结构等研究．
- 徐永涛马建滨周智红谭春敏张湑泽郭松长都玉蓉
- 关键词：藏羚羊微卫星富集文库引物筛选
- 筛选微卫星位点的改进方法
- 2014年
- 微卫星位点是遗传学领域被广泛使用的分子标记。磁珠富集法筛选微卫星是一种新的方法,可以降低筛选时间以及劳动强度,大大提高微卫星位点的得率。本文主要实验步骤包括:(1)构建小插入片段基因组文库;(2)生物素标记的探针富集;(3)阳性克隆建库;(4)进行PCR筛选。在此路线的基础上,通过采用两次杂交富集的技术,对原有技术路线进行了方法改进。新的方法在提高阳性克隆率上取得了成功。
- 谭春敏徐永涛周智红
- 关键词：磁珠富集微卫星藏羚羊
- 藏羚羊5个微卫星标记的多态性分析被引量：2
- 2014年
- 藏羚羊是我国青藏高原的特有物种.为分析藏羚羊独特的遗传变异特征和核DNA遗传多样性,以5个微卫星标记对50只藏羚羊的等位基因多态性进行了研究.研究结果表明：5个微卫星标记共检测到92个等位基因,每个标记的平均等位基因数为18.4个（在16~23之间）,平均有效等位基因数为11.1;5个微卫星标记的多态信息含量均在0.8573以上,为高度多态标记,其中L03标记的多态信息含量最高,达0.9372;各标记的观测杂合度在0.4898~0.9091之间,期望杂合度在0.8770~0.9504之间,平均期望杂合度为0.8990,属于高度杂合标记,遗传变异丰富.这些筛选出的多态性微卫星标记可应用于藏羚羊遗传多样性、遗传结构分析及遗传图谱的构建等工作.
- 周智红郭松长马建滨徐永涛谭春敏都玉蓉
- 关键词：藏羚羊微卫星多态性
- 藏羚羊微卫星富集文库构建与引物筛选
- 本研究利用分子生物学技术进行了藏羚羊微卫星富集文库构建和引物筛选,筛选出一套多态性较高的微卫星分子标记,为探讨藏羚羊种群间基因流以及遗传多样性保持机制奠定了基础。 本文通过FIASCO(Fast isolation b...
- 徐永涛
- 关键词：藏羚羊引物筛选生物素探针
- 文献传递
- 藏羚羊基因组微卫星分析与初步验证被引量：8
- 2016年
- 为明确藏羚羊Pantholops hodgsoni核DNA中微卫星分布情况和特征,利用MISA工具对藏羚羊基因组进行微卫星扫描。在全长2 696.89 Mb的藏羚羊基因组中,搜索到723 135个微卫星座位,其中完全型微卫星有675 809个。6种重复类型中,单核苷酸重复最多,有471 142个,占69.72%;其次是二核苷酸、三核苷酸,分别为88 832个和86 658个,占13.14%和12.82%;六核苷酸最少,仅215个,约占0.03%。以藏羚羊基因组DNA为模板对微卫星座位进行验证,在100个微卫星座位中筛选到8个具有多态性的微卫星座位,多态比例约为8%。本研究将为研究藏羚羊微卫星标记、群体遗传多样性、藏羚羊保护生物学提供基础。
- 都玉蓉谭春敏徐永涛周智红马建滨郭松长
- 关键词：藏羚羊基因组微卫星多态性
