杜正平
- 作品数：27 被引量：68H指数：4
- 供职机构：华南理工大学生物科学与工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技基础条件平台建设计划北京市科技新星计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术农业科学更多>>
- 结核分枝杆菌环介导恒温扩增(LAMP)快速检测方法的评价被引量：15
- 2011年
- 目的对国内建立的结核分枝杆菌DNA环介导恒温扩增(loop-mediated isothermal am-plification,LAMP)快速检测方法进行了介绍和评价。方法实验菌株来源于北京结核病胸部肿瘤研究所。以结核分枝杆菌作为研究对象,设计了4条LAMP引物特异地识别结核分枝杆菌中gyrB基因的6个特殊区域。所有的菌株样本提取DNA作为模板,加入LAMP反应管后,65℃恒温反应60min即可。其结果可以通过肉眼观察到的颜色变化来判断。结果实验共验证了79株临床和标准菌株。对于菌株的培养物,LAMP实验的灵敏度为100%,特异度为92%。结论结核分枝杆菌LAMP快速检测方法是一种快速、可靠的结核分枝杆菌诊断方法。
- 戴广明曹以诚杜正平陈洵黄曙海逄宇周杨黄海荣赵雁林
- 关键词：核酸扩增技术
- 基于语义的生物学专业搜索引擎设计被引量：3
- 2004年
- 在分析生物学数据的特点、生物学家的检索需求和通用搜索引擎的局限性的基础上,引入语义树的思想,提出一种以XML作为数据接口的、基于语义的生物学专业搜索引擎的设计方案,从而为生物学研究工作者提供了一个专业的、个性化的海量信息检索工具.
- 王艳宣董守斌曹以诚杜正平吴云鹏
- 关键词：搜索引擎语义树XML生物学
- 纤维素酶分子人工进化的生物信息学研究
- 纤维素酶在食品、医药、轻纺工业中已被广泛应用,更是生物能源战略目标中将生物质材转化为可供酒精发酵用糖的关键环节。结合生物信息学分子设计和分子生物学开发的纤维素人工分子进化,势在必行。目前已知的314个纤维素酶信息的专用关...
- 曹以诚杜正平潘敏尧王艳宣董守斌
- 关键词：纤维素酶生物信息学蛋白质工程
- 文献传递
- 共表达siRNA和hIL-12的新型乙肝多表位DNA疫苗的研究被引量：3
- 2008年
- 目的:构建含有靶向乙肝表面抗原(HBsAg)基因的siRNA、乙肝复合多表位抗原基因和hIL-12共质粒表达的新型DNA疫苗,并在HepG2细胞中检测siRNA的效果以及各基因的表达。方法:设计并合成复合多表位HBV抗原基因,将其与增强型绿色荧光蛋白(EGFP)基因融合克隆进真核表达载体pVAX1的多克隆位点中,同时将带CMV启动子的完整hIL-12表达单元克隆进载体的BspHI位点之间,再设计并合成乙肝siRNA表达单元,将其克隆进载体的MluI位点之间,得到真核三元共表达重组质粒pVAX1-siHB-HB-EGFP-hIL12。以该重组质粒瞬时转染人肝癌细胞系HepG2,通过EGFP的荧光标记观察多表位抗原的表达,以ELISA测定培养细胞上清中hIL-12的表达,以rtPCR检测siRNA对HBsAg基因的沉默效果。结果:经酶切鉴定和测序证实共表达siRNA、hIL-12的HBV多表位DNA疫苗构建成功。转染细胞中检测到绿色荧光,证实抗原表达;转染后48hhIL-12的检出量为1289pg/ml细胞上清,72h检出量为1712pg/ml细胞上清;转染后HBsAg表达量明显降低,证实siRNA效果良好。结论:成功构建乙肝复合多表位抗原基因与siRNA、hIL-12共质粒表达的DNA疫苗,并能在真核细胞中有效表达抗原与hIL-12基因,而且siRNA对HBsAg显示出明显的沉默效果,为进一步研究该复合型DNA疫苗抗HBV的治疗效果打下基础。
- 黄镜贤曹以诚杜正平陶嫦立杨化强
- 关键词：乙型肝炎DNA疫苗多表位抗原SIRNA
- Humicola insolens EGV的同源分析及分子改造设计
- 纤维素酶的研究过去主要集中在菌种选育和酶的定向进化，随着大量纤维素酶的基因被克隆和三维结构的测定使得纤维素酶的分子理性改造变为现实。EGV是家族45的一个中性酶，在纺织工业中有广泛的利用，过去已经对它的耐碱性，蛋白酶敏感...
- 陈晓曦曹以诚杜正平曾炳佳
- 关键词：纤维素酶同源分析分子改造生物信息学分子模拟
- 文献传递
- siRNA理性设计原理分析被引量：2
- 2007年
- siRNA作为基因功能研究和临床治疗的重要工具,已经引起了科学界的广泛关注,世界上许多学术和商业机构也开发了相应的siRNA设计程序。近年来,随着对siRNA机制研究的不断深入,尤其是2004年Reynolds等提出siRNA理性设计规则之后,许多新的理论极大地推动了siRNA设计程序的发展。本文就siRNA设计程序所普遍考虑的设计原理,从基本经验规则、siRNA序列特征、靶mRNA的可接近性、热动力学特征以及特异性检验方法等5个方面进行了分析和论述,为国内科研机构开发自己的siRNA设计程序提供思路和方法。
- 方翔曹以诚杜正平郭旭卓敏
- 关键词：SIRNA热动力学特异性
- 改良LAMP法检测转基因作物
- LAMP(loop-mediated isothermal amplification)法检测转基因作物，是通过一对特异的能识别一段正义链序列和一段反义链序列的内引物和一对链置换引物，在无外切酶活性的Bst DNA聚合酶...
- 熊槐杜正平周毅陈洵田文武谭慧媚曹以诚
- 关键词：转基因作物
- 文献传递
- 结核分枝杆菌融合抗原Ag85B-ESAT6真核表达载体的构建及鉴定被引量：1
- 2006年
- 以结核分枝杆菌H37Rv株的基因组作为模板,将Ag85B和ESAT6编码基因进行PCR扩增,然后采用基因剪接重叠扩增PCR法(gene SOEing)将其通过疏水甘氨酸接头(GGIGIAPG)连接融合,定向克隆至质粒Pvax1中,构建结核分枝杆菌Ag85B-ESAT6融合抗原的真核表达质粒Pvax1/AE.经单双限制性内切酶图谱、PCR产物及DNA测序分析等多种方法鉴定,证实Pvax1/AE真核表达质粒构建成功.为进一步研究其结核核酸疫苗原型的免疫保护效果奠定了基础.
- 程春明曹以诚杜正平杨化强郭旭方翔张珍武
- 关键词：AG85BESAT6融合基因核酸疫苗
- 大豆和水稻中转基因成分的快速检测技术开发
- 转基因技术的发展给人们的生活带来了更多的机遇。通过生物技术可使品种改良如产量增加、品质提高、抗性增强,包括抗虫、抗旱、抗病、抗逆等,但200多年来的工业文明告诉人类,科学是一把双刃剑,在给人类带来无限益处的同时,也引起了...
- 杜正平
- 关键词：转基因农作物核酸检测
- 文献传递
- 肾移植术后早期急性排斥反应84例回顾分析被引量：3
- 2005年
- 目的 探讨肾移植早期急性排斥反应的危险因素、诊断、鉴别诊断及治疗。方法 肾移植4 2 8例中对84例(19 6 % )发生早期(1个月内)急性排斥反应的危险因素、诊断及治疗进行回顾性分析。结果 84例早期急性排斥反应经治疗后,82例成功,2例失败,移植肾均于术后短期予以摘除,对2例在短期内作了再次移植,均取得成功。结论 急性排斥反应仍是各类排斥反应最常见的一种,目前对早期急性排斥反应的治疗是肾移植成功的关键。
- 杜正平于立新
- 关键词：肾移植术后急性排斥反应
