采用分子动力学方法研究激酶ABL与ATP位点小分子imatinib、P16及变构位点小分子STJ、MS7、MS9、3YY、MYR等的结合,并用GBSA(generalized Born surface area)方法将结合自由能分解到各残基.自山能计算结果表明,小分子STJ、MS7、MS9有利于imatinib与ABL结合;小分子STJ、MS7、MS9与激酶ABL的结合自由能接近,绝对值均大于ABL与3YY、MYR的结合自由能.能量分解表明,ABL残基ILE502、VAL506、LEU510与STJ和MYR的相互作用是αl螺旋处于弯曲状态的重要原因.模拟过程中ABL肉豆蔻酰口袋残基均方根偏差(RMSD)变化值表明,STJ等小分子抑制剂与ABL结合后降低了肉豆蔻酰口袋残基的柔性.
本研究探讨二磷酸氯喹对K562细胞增殖与凋亡的影响及其可能的作用机制。用细胞增殖试验(MTT法)检测不同浓度二磷酸氯喹对K562细胞的增殖抑制作用;应用细胞形态学检查、流式细胞术、DNA琼脂糖凝胶电泳观察和检测细胞凋亡;以罗丹明123(Rhodam ine 123)为细胞染色剂,采用流式细胞术检测不同浓度二磷酸氯喹处理后K562细胞线粒体膜电位(ΔΨm)的变化。结果表明:用不同浓度二磷酸氯喹(1.5625、3.125、6.25、12.5、25、50、100μmol/L)分别作用于K562细胞24、48和72小时后,细胞生长活力明显降低,具有剂量依赖性;典型的细胞形态学改变、亚G1峰的测出、梯形条带的显现共同证实了二磷酸氯喹能诱导K562白血病细胞凋亡;Rhodam ine 123染色显示二磷酸氯喹处理的K562细胞线粒体膜电位强度下降。结论:二磷酸氯喹对K562细胞有生长抑制、诱导凋亡作用,其作用可能与细胞线粒体膜电位(ΔΨm)下降有关。