毕然
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
- 供职机构：华中科技大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金湖北省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
- 一种改进的六联体使用频率编码测度被引量：2
- 2005年
- 在基因预测软件中常用的编码测度得到的序列编码潜力大小往往与序列的C+G含量紧密相关,从而影响了对蛋白编码区的识别效果.研究发现六联体使用偏好与其自身C+G含量存在一种近似线性的相关性,据此提出了一种改进的六联体使用偏好模型,通过综合考虑六联体使用频率与六联体的C+G含量,可简便有效地减小序列编码潜力大小对序列C+G含量的依赖性.测试表明,与分类建模策略相比,该方法所需的训练数据较少,而且具有更好的蛋白编码区识别效果,因此可用于基因预测软件中以提高蛋白编码区与基因结构的预测精度.
- 周艳红毕然唐睿
- 支持向量机方法预测离子通道蛋白被引量：1
- 2007年
- 讨论一种基于蛋白质结构域的方法预测离子通道蛋白。通过将蛋白质的结构域转化成为固定长度的向量,使用支持向量机方法进行离子通道蛋白的预测,并将预测结果与线性判别分析以及利用InterPro与GO映射规则进行预测的结果进行了比较。通过留一法交叉验证,取得最好的预测效果,敏感度为95.9%,专一性为98.3%。
- 涂白毕然
- 关键词：离子通道结构域支持向量机基因本体
