王世清
- 作品数：14 被引量：10H指数：2
- 供职机构：河北省农林科学院更多>>
- 相关领域：生物学农业科学理学轻工技术与工程更多>>
- 一种枯草芽孢杆菌及其用途
- 本发明公开了一株枯草芽孢杆菌菌株，该枯草芽孢杆菌为棉籽壳抗热菌01号，在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心保藏，保藏名称为棉籽壳抗热菌01号，保藏编号CGMCC No.4153，保藏日期2010年9月8日。本发明...
- 王朝江高春燕王世清董庆武袁永昌
- 文献传递
- DNA提取前处理方法对太岁里层样品中细菌种群结构的影响被引量：5
- 2019年
- 为了评价不同DNA提取前处理方法对太岁里层样品中细菌种群结构的影响,并解析优势结构,对太岁里层重复取样,在提取细菌DNA前,分别施以水浸提(SI1)、浸提后热溶解(SI2)、直接热溶解(SI3)3种不同前处理,同时与微孔滤膜过滤相结合,在高通量测序后以操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)为基础深度分析细菌种群结构。结果表明,SI1、SI2和SI3的Shannon指数分别为2.96、3.10和3.08,OTU数目分别为891、964和1095个,共有OTU 313个,其序列之和占总序列的96.02%。细菌种群在各分类水平上的数目互有差别,SI1最少,优势种群高度集中于假单胞菌属(Pseudomonas)和不动杆菌属(Acinetobacter),所占比例之和超过60%。其中,假单胞菌属独占42.30%~56.35%,较之前研究结果变化最大。OTU的分布和丰度在不同取样位置间不均衡。3种前处理方法测得的细菌结构近似,但以SI3测得的假单胞菌属中丰度最高OTU,在总序列中所占比例最高,为41.14%。
- 王朝江高春燕王世清李慧李聪
- 太岁表层组织DNA提取前处理对细菌结构的影响被引量：4
- 2019年
- [目的]比较不同DNA提取前处理方法对太岁表层组织细菌结构的影响。[方法]设水浸提(SO1)、浸提后热溶解(SO2)、直接热溶解(SO3)与微孔过滤结合的3种处理法,高通量测序。[结果]SO1、SO2、SO3的Shannon指数均接近4. 44,OTU数目均接近1 677个,共有OTU 807个,序列占比95. 65%。所含细菌在各分类水平上数目相近,各涉及约20个门、200多个属,优势类群集中在未分类属(unclassified)、假单胞菌属(Pseudomonas)、不动杆菌属(Acinetobacter)和Povalibacter 4个属,占比之和超过了60%。除未分类属外的三个属,均各有一种超高占比OTU支撑。假单菌属占比最高,各处理均为21%左右。[结论]3种前处理方法测得的细菌菌群结构,均表明太岁表层组织中细菌种类多,分布不平衡,假单胞菌属是占比21%的最优势属。
- 王朝江李慧王世清高春燕李聪
- 一种枯草芽孢杆菌及其用途
- 本发明公开了一株枯草芽孢杆菌菌株，该枯草芽孢杆菌为棉籽壳抗热菌01号，在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心保藏，保藏名称为棉籽壳抗热菌01号，保藏编号CGMCC No.4153，保藏日期2010年9月8日。本发明...
- 王朝江高春燕王世清董庆武袁永昌
- 一种常压蒸汽灭菌生物指示剂及其制备方法
- 本发明公开了一种常压蒸汽灭菌生物指示剂及其制备方法，它包括有干培养基、指示菌片。所述的指示菌片为指示菌的芽孢附着在染菌载体片上，在该染菌载体片表面涂布有石蜡、石蜡乳液或脂肪酸。制备方法为：将指示菌接种至生芽孢细菌培养基斜...
- 王朝江袁永昌董庆武王世清高春燕
- 文献传递
- 统计分析确认“太岁”是一种土生客观物体被引量：1
- 2014年
- ＂太岁＂是中国古籍中记载的一种神秘物体,并由其演绎形成了以＂太岁头上不能动土＂为内容的独特太岁文化。此类物体,自1992年在陕西省周至县再次发现,至2013年的30年间,共有报道228次,期间,不少学者运用微生物可培养（纯菌分离）、非培养（16sDNA、T-RFLP）和化学分析等方法尝试进行分类鉴定,得出了其为含菌化工胶体的结论。
- 王朝江王世清
- 关键词：统计分析化学分析微生物
- 基于热溶解膜过滤法的太岁古菌菌群结构研究被引量：1
- 2021年
- 为获知太岁中古菌准确的菌群结构及分析其与原有结果的不同,在太岁组织表里层不同位置重复取样,采用适合太岁材料特性的热溶解膜过滤法处理后提取DNA,随后利用Illumina MiSeq高通量测序平台测定古菌16S rDNA V3~V4区扩增序列。结果显示:供试太岁所含古菌分属16个门、27个纲、39个目、64个属,相对丰度大于0.01%的属有22个;表层的多样性高于里层,由外至内有物种消失现象;重复取样间存在大量非共有菌群;甲烷杆菌属(Methanobacterium)是有高丰度OTU支撑的优势菌群,相对丰度在43.8595%~96.8110%,是用常规方法提取DNA测知的优势属中,唯一仍保持优势地位的属,且在内部样品中的相对丰度较之前测定值分别提升39.5542%和65.9244%。上述结果表明,甲烷杆菌属是太岁所含古菌的优势菌群,在其形成中存在作用。
- 王朝江王世清李慧信艳杰高春燕
- 太岁DNA提取方法差异及对测知细菌结构的影响
- 2021年
- 以太岁取样的加水热溶解为特点设计4种提取方法,将提取效果好的2个DNA样品用Illumina MiSeq高通量测序平台测序。结果表明:滤膜法(SI3)和研磨法均可获得显示电泳条带的DNA,但前者能将太岁材料彻底破碎和滤除多糖;滤膜法样品测得优质序列46676条,聚类OTU 1095个,比研磨法多154个,只包含1个序列相对丰度大于1%的共有OTU,特有1个序列相对丰度41.14%的OTU,是研磨法的237倍,但滤膜法样品香农指数反比研磨法低1.37%,并导致两者菌群结构在各分类水平上有着明显差别。太岁DNA提取方法深刻影响细菌结构测定结果,滤膜法DNA菌群信息更真实,据其测知的优势结构为假单胞菌属(Pseudomonas)和不动杆菌属(Acinetobacter)。
- 王朝江王世清高春燕李慧李聪
- 关键词：DNA提取方法高通量测序
- 棉籽壳栽培料常压灭菌效果指示菌的获得及利用方法
- 本发明公开了一种棉籽壳栽培料常压灭菌效果指示菌的获得及利用方法。属于食用菌生产的技术领域。其用于解决对食用菌栽培料的常压灭菌效果监测的生物监测手段问题。棉籽壳栽培料常压灭菌效果指示菌的获得及利用方法是将棉籽壳栽培料中的杂...
- 王朝江王立安高春燕王世清
- 文献传递
- 影响细菌种群(太岁组织)结构关键因素的研究
- 2022年
- 探索了太岁取样部位和DNA提取前处理2个因素对细菌菌群结构的影响,并获知真实的优势菌群信息.对表里部位重复取样样品,施加水浸提、热溶解与微孔过滤组合成的3种前处理,提取的DNA用Miseq平台测序,挖掘出共有、占比高、有最高丰度OTU支撑的菌群.发现太岁中细菌种类丰富,大部分是杂菌,由表至内,多数类群不明原因消失,多样性和丰度降低,假单胞菌属(Pseudomonas)丰度显著升高;其与不动杆菌属(Acinetobacter)、根瘤菌属(Rhizobium)和鞘脂菌属(Sphingobium)为共有优势属;3种前处理方法获得的菌群结构近似,以内部组织直接热溶解过膜法为最优,其假单胞菌属占比达48.32%.
- 王朝江李慧王世清高春燕李聪张洋刘方
- 关键词：细菌DNA提取菌群结构
