王聪艳
- 作品数：31 被引量：84H指数：6
- 供职机构：廊坊师范学院生命科学学院更多>>
- 发文基金：河北省高等学校科学技术研究指导项目河北省科技厅科研项目河北省科技计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生文化科学更多>>
- 番茄SlNRT2基因家族鉴定、启动子克隆及表达分析
- 2024年
- 硝酸盐转运蛋白2(Nitrate transporter 2,NRT2),是一种高亲和硝酸盐转运蛋白,在植物对硝酸盐的吸收和转运过程中发挥重要作用。本研究通过生物信息学方法对番茄(Solanum lycopersicum)NRT2(SlNRT2)家族基因进行鉴定,利用热图分析SlNRT2家族成员基因表达模式,并利用启动子嵌合GUS报告基因转化拟南芥对SlNRT2启动子活性进行分析。结果表明番茄基因组中鉴定到5个NRT2基因,定位于细胞膜,氨基酸序列长度介于458~531 aa,等电点介于9.05~9.33,不稳定性指数介于31.84~40.70。基因结构分析表明,该基因家族由3~4个外显子构成。染色体定位分析显示,SlNRT2基因分布于3条染色体上。系统进化和保守结构域分析显示,SlNRT2分别归属于I和II两个类群,具有10种保守基序,蛋白保守性很高。番茄不同组织热图分析表明SlNRT2.1和SlNRT2.2呈组成型表达;SlNRT2.3~SlNRT2.5主要在根部表达。启动子顺式作用元件及GUS组织化学染色分析结果表明,SlNRT2.4启动子驱动GUS基因在拟南芥根部特异性表达,而SlNRT2.3和SlNRT2.5除驱动GUS基因在拟南芥根部表达,叶片也有表达。本研究为后续开展SlNRT2基因的功能研究提供依据,同时为培育氮素高效利用型转基因番茄奠定了基础。
- 李文静张新业张智研冯恰刘薇李红敬张艳霞赵金萍王聪艳赵楠楠朱姝
- 关键词：番茄基因家族启动子
- 胡萝卜类黄酮含量的测定及DcCHS基因家族的鉴定分析被引量：5
- 2021年
- 查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)是类黄酮合成过程中的第一个关键酶,具有重要的生理功能。测定胡萝卜不同发育时期、不同组织部位的类黄酮含量,并在全基因组水平上对胡萝卜CHS基因家族进行鉴定和分析。结果表明,无论在苗期还是收获期,胡萝卜叶中的类黄酮含量均极显著地高于根中的含量。叶中的类黄酮含量在不同发育时期无显著差异,而根中的类黄酮含量在不同发育时期却差异显著。胡萝卜基因组中共有12个DcCHS基因,分布于5条染色体上,氨基酸序列长度为253~398 aa,外显子1~3个。经预测,DcCHS蛋白均定位于细胞质,二级结构以α-螺旋和无规卷曲为主。DcCHS蛋白可分为ClassⅠ和ClassⅡ两类,含有10种保守基序,motif1、4、6、7为CHS蛋白N端结构域,motif2、3、8为CHS蛋白C端结构域。这些研究结果可为胡萝卜CHS基因的功能研究提供参考。
- 张新业王雨欣孙艳香朱姝王聪艳李文静
- 关键词：胡萝卜查尔酮合成酶生物信息学分析
- 遗传学教学反思与改革被引量：2
- 2014年
- 现代遗传学的飞速发展,对课程教学提出了新的要求。目前高校遗传学课程和教学体系还存在一些不足,制约了应用性、创新性人才的培养。通过优化教学内容体系,革新教学理念和方法,强化实践教学等改革和实践,有助于培养学生的专业应用能力和综合素质。
- 贾永红张江丽冯雪孙艳香王聪艳张志达
- 关键词：遗传学教学改革
- 番茄SlTIP-1基因的克隆、表达及启动子活性分析被引量：7
- 2020年
- 为研究水孔蛋白分子功能,本研究以番茄(Solanum lycopersicum)矮化品种‘Micro-Tom’为材料,采用RTPCR技术克隆得到1个液泡膜内在蛋白(tonoplast intrinsic proteins,TIPs)类的水孔蛋白基因,命名为SlTIP-1,其开放阅读框(ORF)长753 bp,编码250个氨基酸。基因结构分析发现SlTIP-1有3个外显子和2个内含子。生物信息学分析表明SlTIP-1蛋白含有6个跨膜区及2个NPA(天冬酰胺-脯氨酸-丙氨酸)基序,具有MIP超家族典型的蛋白保守区序列特征。系统进化分析表明,SlTIP-1蛋白与野生种潘那利番茄TIP共聚于一支。实时定量PCR结果表明,SlTIP-1在番茄根中特异性表达。将SlTIP-1基因起始密码子上游1085 bp的序列构建到植物表达载体pBI121中,转化拟南芥(Arabidopsis thaliana)并进行GUS组织化学染色分析。结果表明,SlTIP-1基因启动子驱动GUS基因在拟南芥根部特异性表达,与实时定量PCR结果一致。本研究拟为进一步探索该基因的功能及番茄分子辅助育种提供理论依据。
- 李文静李甜饴乔洁朱姝程兴茹王聪艳张新业
- 关键词：番茄水孔蛋白基因克隆
- 多用途植物甘草人工栽培技术被引量：4
- 2009年
- 甘草是享有"国老"美誉的中药材,用途广泛,需求量大。介绍了甘草的生物学特性,详细总结了甘草的栽培技术措施、田间管理、病虫害防治、收获方法,并概述了甘草的用途。
- 周志国王聪艳孙伟
- 关键词：甘草栽培
- 番茄金属硫蛋白基因家族鉴定、SlMT3基因表达及启动子活性分析被引量：4
- 2021年
- 金属硫蛋白(metallothioneins,MTs)是一类低分子量、富含半胱氨酸的金属结合蛋白,在维持金属稳态和去除金属毒性方面具有重要作用。本研究通过生物信息学方法对番茄(Solanum lycopersicum)MT家族基因(SlMT)进行鉴定,利用荧光定量PCR技术分析家族成员SlMT3基因表达模式,并利用GUS报告基因对SlMT3启动子活性进行分析。结果表明番茄基因组中共鉴定到5个MT基因,主要定位于细胞质,蛋白序列长度在72~112 aa,等电点介于4.49~5.71。基因结构分析表明,该基因家族由2~3个外显子构成。染色体分布结果显示,SlMT基因分布于3条染色体上。系统进化和保守结构域分析显示,SlMT分别归属于Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ三个亚族,具有3种保守基序,蛋白保守性很高。荧光定量PCR结果表明,SlMT3在番茄根中特异性表达。启动子顺式作用元件及GUS组织化学染色分析结果表明,SlMT3基因启动子驱动GUS基因在拟南芥根部特异性表达,与荧光定量PCR结果一致。本研究为后续开展SlMT基因的功能研究和番茄遗传改良提供理论依据。
- 李文静王秋平黄丽婕刘文杰冯珂刘亚雯朱姝王聪艳王晓铮蒋秀虹张新业
- 关键词：番茄金属硫蛋白基因家族
- 小麦醇溶蛋白的研究进展被引量：6
- 2009年
- 小麦醇溶蛋白是小麦种子的主要贮藏蛋白之一。本文综述了小麦醇溶蛋白的组成、分子结构、基因定位、遗传多态性,以及与品质的关系,并对其研究方法进行了总结。
- 王聪艳周志国
- 关键词：小麦醇溶蛋白遗传多态性
- 异源表达菊芋HtHCT基因对受体植物木质素相关生理生化指标的影响
- 2022年
- 羟基肉桂酰辅酶A:莽草酸/奎宁酸羟基肉桂酰转移酶(HCT)是木质素合成过程中的关键酶之一。本研究构建了菊芋HtHCT基因的植物表达载体pCAMBIA1390-HtHCT,分别对拟南芥和本氏烟进行遗传转化,并对转基因植株进行生理生化指标测定。PCR和RT-PCR结果表明,HtHCT基因已经插入到受体植物基因组中,并能进行转录;转基因植株生理生化指标检测表明,HtHCT基因能够调节拟南芥和本氏烟中木质素的含量及组成,并对受体材料的类黄酮合成亦有一定的影响。
- 张新业苏彦苹朱姝王聪艳侯晓强侯晓强
- 关键词：菊芋木质素类黄酮
- 番茄根特异性启动子pSlROOT1及其应用
- 本发明公开了一种番茄根特异性表达启动子pSlROOT1及其应用。所述启动子pSlROOT1为以下核苷酸序列之一：1)序列表中SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列；2)与序列表中SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列有9...
- 李文静朱姝张新业赵楠楠王聪艳张智研李红敬张艳霞张云逸
- 三种伞形科蔬菜作物棕榈酰基转移酶基因家族的鉴定与分析
- 2023年
- 在全基因组水平鉴定胡萝卜(Daucus carota)、芹菜(Apium graveolens)、香菜(Coriandrum sativum)3种伞形科蔬菜作物的棕榈酰基转移酶(protein S-acyltransferase,PAT),对其家族成员进行生物信息学和表达分析,为深入探究该类蛋白在3种伞形科作物生长发育及抵御逆境胁迫中的作用提供参考。利用Basic Local Alignment Search Tool(BLAST)和hmmsearch程序,从胡萝卜、芹菜、香菜基因组中筛选、鉴定PAT家族成员;利用TBtools绘制PAT基因染色体分布图;利用Expasy分析PAT蛋白的等电点、分子量;利用TMHMM-2.0预测PAT蛋白跨膜区;利用CELLO v.2.5、WoLF PSORT预测PAT蛋白的亚细胞定位情况;利用MEGA6构建系统发育进化树;利用MEME分析PAT蛋白保守基序;基于荧光定量PCR实验结果及转录组数据,利用TBtools绘制基因表达热图,分析PAT基因的组织表达特性及胁迫响应情况。结果表明,在胡萝卜、芹菜及香菜基因组中各存在27、25、27个PAT基因,分别命名为DcPAT 1~27、AgPAT 1~25、CsPAT 1~27。这些PAT成员不均匀地分布于染色体上,理化性质存在差异,且均为跨膜蛋白。系统进化分析将伞形科及来源于其他物种的PAT蛋白分为7个类群(Group1~7),伞形科作物PAT蛋白在7个类群中均有分布。结构分析表明,所有的PAT蛋白均含有DHHC-CRD结构域,该序列内的保守氨基酸残基在不同物种间已发生变异。荧光定量PCR和转录组数据分析表明,PAT基因在胡萝卜、芹菜、香菜不同组织间的表达水平有差异,但有部分成员在不同组织间均呈现高水平或低水平表达,另有部分DcPAT基因在盐胁迫和低温胁迫处理后,表达水平发生改变。
- 张新业李文静朱姝孙艳香王聪艳闫训友周志国
- 关键词：伞形科基因家族生物信息学分析
