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基于环境的编码方法在预测HLA-A*0201结合多肽中的应用: 2009年; T淋巴细胞对抗原的识别是产生与调节有效免疫应答的关键,T细胞只识别主要组织相容性复合物(MHC)呈递上来的抗原,因此MHC与抗原多肽的结合就成为一系列免疫应答过程中基础的一环.为了辅助疫苗设计,多种机器学习技术已被普遍应用于MHC结合多肽的预报领域中.本文以支持向量机(SVM)为手段,以HLA-A*0201的实验数据集为对象,对多种肽段编码方法形成的模型进行评价,得到的AUC值的范围在0.932～0.936之间.提出一种新的利用抗原多肽结合环境的编码方法,使预报的AUC值提高到0.953.对独立数据集进行建模预报,同样证明环境编码模型的预报准确率高于传统编码方法的准确率.; 赵璞李通化

利用支持向量机预测HLA-A*0201结合多肽: 主要组织相容性复合物(MHC)结合的抗原肽是免疫监督过程中的关键一步。大量的计算机方法应用于这一领域，并且已经取得了不错的预测结果。预测方法有motif法、以结构为基础的方法、机器统计学习的方法等，并达到预报准确率在70...; 赵璞李通化; 关键词：支持向量机抗原肽; 文献传递

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赵璞